189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5935 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1097 aa  2232    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  37.11 
 
 		 1041 aa  645    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  33.88 
 
 		 1129 aa  563  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  34.37 
 
 		 1100 aa  557  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  33.84 
 
 		 1125 aa  554  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  33.57 
 
 		 1105 aa  542  9.999999999999999e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  34.5 
 
 		 1074 aa  526  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  33.48 
 
 		 1077 aa  520  1e-146  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  32.51 
 
 		 1074 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  31.27 
 
 		 1071 aa  455  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  30.73 
 
 		 1056 aa  409  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  28.85 
 
 		 1081 aa  369  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  28.65 
 
 		 1068 aa  359  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  27.66 
 
 		 1066 aa  308  4.0000000000000004e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  26.9 
 
 		 1051 aa  303  2e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  27.06 
 
 		 1057 aa  297  7e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  27.1 
 
 		 1061 aa  280  8e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  26.37 
 
 		 1116 aa  263  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  25.11 
 
 		 1008 aa  258  4e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1068 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1052 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1071 aa  221  6e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  24.5 
 
 		 1067 aa  220  1e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  25.72 
 
 		 1053 aa  214  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1066 aa  204  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 1041 aa  138  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  25.28 
 
 		 1069 aa  137  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 1008 aa  137  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 1206 aa  136  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  23.49 
 
 		 1125 aa  135  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1008 aa  132  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 1123 aa  131  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1075 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 1026 aa  123  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  27.53 
 
 		 1203 aa  119  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  23.92 
 
 		 992 aa  118  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 1105 aa  116  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  23.42 
 
 		 1012 aa  115  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 1232 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 1153 aa  112  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  29.27 
 
 		 1210 aa  112  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 1176 aa  112  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 1065 aa  110  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1122 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 1149 aa  109  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  28.8 
 
 		 1075 aa  106  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 1016 aa  105  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  25.81 
 
 		 1195 aa  101  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  29.97 
 
 		 1196 aa  97.8  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  24.11 
 
 		 1132 aa  96.3  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  23.84 
 
 		 1298 aa  94.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 1114 aa  94  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  24.57 
 
 		 1010 aa  92  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  24.38 
 
 		 1173 aa  89.7  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  23.08 
 
 		 1007 aa  89.4  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 1167 aa  87.8  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  24.18 
 
 		 1257 aa  87  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1162 aa  86.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  25.92 
 
 		 979 aa  86.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1141 aa  86.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  22.34 
 
 		 986 aa  84  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  22.93 
 
 		 1037 aa  81.6  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 1188 aa  81.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1122 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1120 aa  80.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  25 
 
 		 511 aa  79  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1126 aa  79  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  25.92 
 
 		 1109 aa  79  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  24.8 
 
 		 1162 aa  78.6  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 993 aa  78.6  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  24.05 
 
 		 1054 aa  78.2  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1161 aa  77.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 1123 aa  77.4  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 798 aa  77.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  23.22 
 
 		 972 aa  76.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 991 aa  76.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  21.44 
 
 		 966 aa  74.3  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 1124 aa  72.4  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  21.9 
 
 		 1194 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 1010 aa  70.1  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  21.36 
 
 		 1007 aa  70.1  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 		 1066 aa  70.1  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  21.81 
 
 		 1050 aa  70.5  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2876  TonB-dependent receptor  21.23 
 
 		 1007 aa  69.7  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4791  putative oar protein  24.09 
 
 		 997 aa  68.6  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4107  putative oar protein  23.63 
 
 		 994 aa  66.2  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000254754  hitchhiker  0.000800061 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  24.43 
 
 		 791 aa  66.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 1087 aa  65.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 1066 aa  65.1  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  23.77 
 
 		 1194 aa  63.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 888 aa  62.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 897 aa  62  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 1089 aa  60.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  34.43 
 
 		 1003 aa  60.1  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  33.86 
 
 		 1076 aa  58.9  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  23.9 
 
 		 1001 aa  58.2  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 1011 aa  58.2  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  22.05 
 
 		 1105 aa  57  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 935 aa  56.6  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 938 aa  56.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>