86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5859 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5859  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 153 aa  314  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315919  normal  0.709567 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2817  NUDIX hydrolase  55.33 
 
 		 152 aa  180  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4185  NUDIX hydrolase  58.39 
 
 		 154 aa  178  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0649  NUDIX hydrolase  58.78 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1098  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 		 155 aa  174  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.448476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0645  NUDIX hydrolase  54.97 
 
 		 155 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2646  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 		 155 aa  170  5e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2570  hypothetical protein  53.29 
 
 		 172 aa  170  5.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00072063  normal  0.0208228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7253  NUDIX hydrolase  55.48 
 
 		 160 aa  166  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1987  NUDIX hydrolase  57.64 
 
 		 155 aa  165  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2909  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 		 157 aa  160  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188033  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2923  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 		 157 aa  160  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.928534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2879  NUDIX hydrolase  52.63 
 
 		 157 aa  160  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3182  NUDIX hydrolase  56.08 
 
 		 163 aa  159  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.565463  normal  0.196576 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2044  NUDIX hydrolase  52.94 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5357  NUDIX hydrolase  51.3 
 
 		 154 aa  157  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.737057 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  52.35 
 
 		 166 aa  156  8e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3663  NUDIX hydrolase  53.52 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3428  NUDIX hydrolase  51.97 
 
 		 163 aa  156  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3585  NUDIX hydrolase  51.33 
 
 		 162 aa  156  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00428581  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0671  NUDIX hydrolase  48.03 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.616571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  48.98 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5719  NUDIX hydrolase  50.33 
 
 		 154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.943651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2262  NUDIX hydrolase  49.67 
 
 		 155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.997578  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  51.68 
 
 		 174 aa  151  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0645  hypothetical protein  50.33 
 
 		 154 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16970  predicted NTP pyrophosphohydrolase  48 
 
 		 154 aa  148  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.542075  normal  0.366756 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4521  NUDIX hydrolase  56 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.506364 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3569  NUDIX hydrolase  48.37 
 
 		 163 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0358  NUDIX hydrolase  44.72 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0064  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0113  NUDIX hydrolase  47.1 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2993  NUDIX hydrolase  50.34 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1389  NUDIX hydrolase  44.59 
 
 		 324 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.524565  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2455  NUDIX hydrolase  41.06 
 
 		 162 aa  123  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.490004  normal  0.610267 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0230  NUDIX hydrolase  39.75 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 130 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3219  NUDIX hydrolase  28.86 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4501  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 322 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3427  NUDIX hydrolase  30.13 
 
 		 341 aa  48.5  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1404  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567181  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1152  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 		 296 aa  47.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000396101 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0922  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1382  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.162154 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0301  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 		 324 aa  47.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.917756  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3015  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 		 351 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.771324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1315  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.511776  normal  0.0806389 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4436  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 180 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1261  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 289 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0352792  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 322 aa  44.3  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1448  ADP-ribose pyrophosphatase  33.33 
 
 		 430 aa  43.9  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4563  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 166 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4548  NUDIX hydrolase  33.03 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8260  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 		 303 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1059  NUDIX hydrolase  28.7 
 
 		 195 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0992  NUDIX hydrolase  38.98 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  31.58 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1911  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 167 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.276369  normal  0.389177 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3707  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.000000974348 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1281  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0791  NUDIX family hydrolase  37.31 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000502884  hitchhiker  6.80479e-24 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0324  putative MutT family protein  37.5 
 
 		 325 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0059  hydrolase, NUDIX family  29.2 
 
 		 258 aa  42.4  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.888267 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1716  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 		 171 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0743315 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  38.78 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  27.27 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33510  NTP pyrophosphohydrolase  37.78 
 
 		 343 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0185046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25640  ADP-ribose pyrophosphatase  38.71 
 
 		 314 aa  41.6  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194053  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1417  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4995  putative phosphohistidine phosphatase SixA  58.06 
 
 		 301 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2758  NUDIX hydrolase  28.1 
 
 		 142 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2666  NUDIX domain-containing protein  29.03 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.661502  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39610  ADP-ribose pyrophosphatase  41.27 
 
 		 169 aa  41.2  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1632  NUDIX family hydrolase  29.03 
 
 		 160 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.081171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1653  NUDIX family hydrolase  29.03 
 
 		 160 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.186511  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3070  NUDIX hydrolase  27.63 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.973852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  36.96 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 		 174 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1429  NUDIX hydrolase  58.82 
 
 		 176 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.742876  normal  0.0486947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  37.74 
 
 		 160 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0905  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 152 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.900036  normal  0.116186 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5298  NUDIX hydrolase  43.33 
 
 		 170 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1810  NUDIX family hydrolase  29.03 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.610714  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5398  NUDIX hydrolase  42.17 
 
 		 151 aa  40.4  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25510  ADP-ribose pyrophosphatase  38.46 
 
 		 165 aa  40.4  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0162353  normal  0.120334 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>