More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5752 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 677 aa  1399    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  32.71 
 
 		 660 aa  303  9e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  32.61 
 
 		 653 aa  301  3e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  40.26 
 
 		 585 aa  295  2e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  31.82 
 
 		 643 aa  293  7e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  32.27 
 
 		 666 aa  293  8e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  32.56 
 
 		 650 aa  290  6e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  32.03 
 
 		 665 aa  281  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  31.59 
 
 		 645 aa  276  9e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  31.03 
 
 		 668 aa  265  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  36.97 
 
 		 613 aa  259  8e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  31.35 
 
 		 626 aa  256  8e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  30.47 
 
 		 642 aa  252  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  31.59 
 
 		 630 aa  235  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  28.69 
 
 		 757 aa  213  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  29.58 
 
 		 656 aa  209  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  28.4 
 
 		 903 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  29.39 
 
 		 671 aa  187  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  25.78 
 
 		 672 aa  182  1e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  27.15 
 
 		 679 aa  178  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  27.24 
 
 		 641 aa  171  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  29.46 
 
 		 798 aa  171  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  28.24 
 
 		 734 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  31.08 
 
 		 640 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  26.44 
 
 		 620 aa  162  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  32.64 
 
 		 638 aa  160  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  28.76 
 
 		 778 aa  157  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  32.03 
 
 		 631 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  31.96 
 
 		 658 aa  153  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  30.31 
 
 		 656 aa  151  4e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  28.44 
 
 		 712 aa  150  8e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  30.31 
 
 		 630 aa  148  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  24.33 
 
 		 673 aa  146  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  34.1 
 
 		 813 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  28.75 
 
 		 648 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  27.09 
 
 		 694 aa  136  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  28.3 
 
 		 510 aa  134  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  27.53 
 
 		 704 aa  132  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  29.49 
 
 		 631 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  28.36 
 
 		 471 aa  130  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  28 
 
 		 525 aa  130  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1705  OmpA/MotB domain protein  46.56 
 
 		 340 aa  129  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.597429  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  29.29 
 
 		 517 aa  127  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  26.84 
 
 		 670 aa  127  8.000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  28.38 
 
 		 669 aa  127  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  29.79 
 
 		 710 aa  120  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  27.36 
 
 		 537 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  29.08 
 
 		 509 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  27.27 
 
 		 648 aa  112  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08086  hypothetical protein  46.02 
 
 		 366 aa  109  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  27.63 
 
 		 712 aa  108  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  26.9 
 
 		 673 aa  108  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4274  OmpA/MotB domain protein  28.86 
 
 		 568 aa  92  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.24355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  29.26 
 
 		 424 aa  89  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  35 
 
 		 432 aa  87.4  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  41.82 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  39.45 
 
 		 412 aa  85.5  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  38.26 
 
 		 586 aa  84.3  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  39.13 
 
 		 239 aa  83.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  33.06 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  25.19 
 
 		 519 aa  81.3  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 594 aa  80.5  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  34.06 
 
 		 362 aa  80.1  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  39.34 
 
 		 374 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  40.37 
 
 		 457 aa  79  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  32.61 
 
 		 240 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  32.73 
 
 		 1026 aa  78.2  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0393  OmpA/MotB domain protein  29.57 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  33.58 
 
 		 365 aa  77.4  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  34.15 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  41.82 
 
 		 454 aa  77  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  37.27 
 
 		 637 aa  76.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  35.17 
 
 		 510 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  34.86 
 
 		 209 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  38.52 
 
 		 537 aa  76.3  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  31.11 
 
 		 388 aa  76.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.5 
 
 		 447 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  33.04 
 
 		 230 aa  76.3  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 193 aa  76.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  36.04 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  41.28 
 
 		 427 aa  75.5  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  37.21 
 
 		 375 aa  75.5  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  32.8 
 
 		 321 aa  75.5  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  37.29 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  34.43 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  32.59 
 
 		 230 aa  75.1  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  34.04 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  37.07 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0626  OmpA/MotB domain-containing protein  34.62 
 
 		 768 aa  75.1  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  34.31 
 
 		 653 aa  74.7  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  36.44 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  34.51 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  37.93 
 
 		 429 aa  73.9  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  36.03 
 
 		 456 aa  73.6  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.74 
 
 		 542 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.23 
 
 		 609 aa  73.6  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  43.14 
 
 		 459 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  38.02 
 
 		 543 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  34.86 
 
 		 707 aa  72.8  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  32.79 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>