More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5666 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5666  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 580 aa  1190    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.106128  normal  0.852479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0412  peptidase M28  44.59 
 
 		 460 aa  393  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0420601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  45.31 
 
 		 454 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  43.19 
 
 		 472 aa  383  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3518  peptidase M28  42.33 
 
 		 463 aa  382  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  43.14 
 
 		 458 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  35.65 
 
 		 481 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  35.23 
 
 		 525 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  34.01 
 
 		 481 aa  234  3e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  33.98 
 
 		 466 aa  223  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  33.33 
 
 		 495 aa  219  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  34.62 
 
 		 469 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  34.32 
 
 		 468 aa  218  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  34.94 
 
 		 468 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  34.71 
 
 		 468 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  34.71 
 
 		 468 aa  217  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  34.57 
 
 		 477 aa  216  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  34.02 
 
 		 468 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  33.96 
 
 		 468 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  33.41 
 
 		 468 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  34.21 
 
 		 467 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  34.25 
 
 		 468 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3182  peptidase M28  33.11 
 
 		 472 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.569108  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  33.97 
 
 		 414 aa  197  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  33.49 
 
 		 473 aa  197  6e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3661  peptidase M28  31.39 
 
 		 468 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.21215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2554  M28 family peptidase  30.2 
 
 		 469 aa  188  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02736  aminopeptidase  29.65 
 
 		 471 aa  168  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.465186  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0237  peptidase M28  32.28 
 
 		 471 aa  167  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.706232 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1103  peptidase M28  29.49 
 
 		 471 aa  146  8.000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.608477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2350  peptidase M28  29.05 
 
 		 457 aa  141  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  27.91 
 
 		 497 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  26.51 
 
 		 487 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  27.25 
 
 		 525 aa  102  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  24.42 
 
 		 552 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2040  peptidase M28  25.38 
 
 		 578 aa  90.5  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.194253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  24.35 
 
 		 544 aa  88.2  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  25.43 
 
 		 539 aa  86.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  26.79 
 
 		 526 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0262  putative endoribonuclease L-PSP  38.53 
 
 		 120 aa  84.3  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1773  endoribonuclease L-PSP, putative  41.67 
 
 		 131 aa  84  0.000000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1390  endoribonuclease L-PSP, putative  38.53 
 
 		 120 aa  84  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483032  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0277  endoribonuclease L-PSP, putative  42.2 
 
 		 120 aa  84  0.000000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 144 aa  83.2  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1579  endoribonuclease L-PSP, putative  39.45 
 
 		 120 aa  82.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0655756  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  41.67 
 
 		 126 aa  81.6  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2605  endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 126 aa  81.6  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.615726  normal  0.989955 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1323  endoribonuclease L-PSP  41.12 
 
 		 126 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3109  endoribonuclease L-PSP  38.26 
 
 		 123 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0400559 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 127 aa  78.2  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5866  endoribonuclease L-PSP  36.89 
 
 		 126 aa  77.8  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0042  putative endoribonuclease L-PSP  39.81 
 
 		 124 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0493131  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0943  endoribonuclease L-PSP  38.74 
 
 		 126 aa  77  0.0000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0278799  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0809  endoribonuclease L-PSP  40.19 
 
 		 124 aa  77  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0749  Endoribonuclease L-PSP  34.48 
 
 		 125 aa  77  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26944  normal  0.774462 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 124 aa  77  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 125 aa  77  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1664  endoribonuclease L-PSP  34.4 
 
 		 124 aa  76.6  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  39.45 
 
 		 126 aa  76.6  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4166  putative endoribonuclease L-PSP  35.25 
 
 		 128 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  35.78 
 
 		 124 aa  75.9  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 136 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2463  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 		 125 aa  75.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173812  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5264  putative endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 124 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.574263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  36.7 
 
 		 126 aa  75.5  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0521  putative endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 123 aa  74.7  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.170713  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  35.51 
 
 		 124 aa  74.3  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  35.45 
 
 		 126 aa  74.3  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0752  endoribonuclease L-PSP  36.21 
 
 		 126 aa  74.7  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000588598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0937  endoribonuclease L-PSP  36.79 
 
 		 171 aa  74.3  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0045  endoribonuclease L-PSP, putative  34.68 
 
 		 127 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 126 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 125 aa  73.9  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0046  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 124 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0042  pur operon repressor  35.54 
 
 		 124 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0042  pur operon repressor  35.54 
 
 		 124 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0046  endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 124 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0042  putative endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 124 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0053  putative endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 124 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0056  putative endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 124 aa  73.9  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  37.61 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0250  endoribonuclease L-PSP  33.02 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 143 aa  73.2  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 129 aa  73.2  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  35.59 
 
 		 125 aa  73.2  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  40 
 
 		 126 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  35.65 
 
 		 128 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4261  endoribonuclease L-PSP  38.68 
 
 		 122 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.165406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  36.61 
 
 		 151 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1403  endoribonuclease L-PSP  35.04 
 
 		 126 aa  72.4  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000591811 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0052  putative endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 124 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000180566  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  38.89 
 
 		 132 aa  72.4  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0043  endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 124 aa  72.8  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00285503  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  37.37 
 
 		 129 aa  72.4  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 150 aa  72.8  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  38.74 
 
 		 134 aa  72  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  32.23 
 
 		 128 aa  71.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  35.66 
 
 		 130 aa  72  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  37.96 
 
 		 127 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 128 aa  71.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>