135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5466 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5466  protein of unknown function DUF147  100 
 
 
270 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.200654  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3664  protein of unknown function DUF147  43.03 
 
 
263 aa  194  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2107  protein of unknown function DUF147  43.15 
 
 
258 aa  192  5e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3222  hypothetical protein  39.52 
 
 
282 aa  185  8e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13513  putative transmembrane protein  44.31 
 
 
259 aa  183  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2673  protein of unknown function DUF147  38.91 
 
 
272 aa  182  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0979308 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0146  protein of unknown function DUF147  38.22 
 
 
269 aa  177  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0224  protein of unknown function DUF147  36.65 
 
 
267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424846  normal  0.0474831 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0652  hypothetical protein  38.19 
 
 
264 aa  163  3e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2195  hypothetical protein  41.25 
 
 
269 aa  162  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2233  hypothetical protein  41.25 
 
 
269 aa  162  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.785168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0604  protein of unknown function DUF147  36.29 
 
 
275 aa  159  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000675285  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1166  hypothetical protein  38.02 
 
 
292 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000552202  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0999  hypothetical protein  36.61 
 
 
261 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000188135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3551  hypothetical protein  34.8 
 
 
293 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000686428  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1588  hypothetical protein  35.92 
 
 
255 aa  155  6e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1201  protein of unknown function DUF147  32.94 
 
 
309 aa  154  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0240  protein of unknown function DUF147  35.06 
 
 
272 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0934  hypothetical protein  34.82 
 
 
277 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2248  hypothetical protein  34.54 
 
 
277 aa  149  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.356629  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0361  protein of unknown function DUF147  35.39 
 
 
285 aa  149  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.566401  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5137  hypothetical protein  34.02 
 
 
273 aa  148  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0006  protein of unknown function DUF147  34.98 
 
 
248 aa  148  9e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000163488  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0370  protein of unknown function DUF147  34.39 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0187  conserved hypothetical protein TIGR00159  34.44 
 
 
273 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0290754  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1764  hypothetical protein  37.8 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0407  hypothetical protein  34.52 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000461408  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0148  hypothetical protein  35.63 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0552836  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0292  hypothetical protein  32.8 
 
 
274 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00100621  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0255  protein of unknown function DUF147  35.16 
 
 
251 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000845039  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0278  hypothetical protein  34.69 
 
 
292 aa  145  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911032  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2336  hypothetical protein  33.2 
 
 
296 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0161  protein of unknown function DUF147  32.8 
 
 
239 aa  145  7.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0135  hypothetical protein  33.74 
 
 
278 aa  145  9e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.575815  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0156  hypothetical protein  33.2 
 
 
273 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.374627  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0150  hypothetical protein  33.2 
 
 
273 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.888291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0148  hypothetical protein  33.2 
 
 
273 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0102847  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0155  hypothetical protein  33.2 
 
 
273 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0837  protein of unknown function DUF147  34.68 
 
 
275 aa  145  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0199  conserved hypothetical protein TIGR00159  33.2 
 
 
273 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0178  conserved hypothetical protein TIGR00159  33.2 
 
 
273 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0155  hypothetical protein  33.2 
 
 
273 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0149  hypothetical protein  35.1 
 
 
273 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1515  hypothetical protein  33.47 
 
 
249 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.189008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0152  protein of unknown function DUF147  33.2 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1288  hypothetical protein  34.27 
 
 
282 aa  139  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000108276  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1568  hypothetical protein  33.2 
 
 
273 aa  138  7.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0885  hypothetical protein  31.8 
 
 
283 aa  137  2e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.296803  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2672  protein of unknown function DUF147  31.78 
 
 
273 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.164928  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1932  hypothetical protein  32.48 
 
 
266 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0110  protein of unknown function DUF147  33.2 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0477  hypothetical protein  34.8 
 
 
292 aa  136  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1725  protein of unknown function DUF147  34.54 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.175281  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0156  protein of unknown function DUF147  34.16 
 
 
273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000602517  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2660  hypothetical protein  37.2 
 
 
285 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2346  hypothetical protein  37.2 
 
 
285 aa  133  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2103  hypothetical protein  36.05 
 
 
288 aa  132  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1785  hypothetical protein  35.89 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.334778 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0057  protein of unknown function DUF147  33.74 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1817  protein of unknown function DUF147  35.18 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2186  protein of unknown function DUF147  32.31 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2640  hypothetical protein  33.33 
 
 
471 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.911515  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1232  hypothetical protein  33.64 
 
 
235 aa  130  3e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0124  protein of unknown function DUF147  35.71 
 
 
298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0678781 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0127  protein of unknown function DUF147  35.71 
 
 
298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0832  protein of unknown function DUF147  33.33 
 
 
271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000526426  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2337  protein of unknown function DUF147  34.6 
 
 
276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0249432 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1888  hypothetical protein  32.35 
 
 
255 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000352181  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3416  hypothetical protein  33.2 
 
 
267 aa  129  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1168  hypothetical protein  31.47 
 
 
471 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000542282  normal  0.0311733 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3550  protein of unknown function DUF147  29.59 
 
 
480 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000131066  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3055  protein of unknown function DUF147  33.6 
 
 
382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0416862  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1715  protein of unknown function DUF147  32.08 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.188569  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1656  hypothetical protein  29.53 
 
 
297 aa  125  6e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3986  hypothetical protein  34.15 
 
 
294 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0008  hypothetical protein  32.94 
 
 
256 aa  124  1e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.487751  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0263  hypothetical protein  32.81 
 
 
306 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0843  protein of unknown function DUF147  32.16 
 
 
293 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.105592 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0400  protein of unknown function DUF147  30.8 
 
 
291 aa  123  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0280  hypothetical protein  29.17 
 
 
264 aa  123  4e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1367  hypothetical protein  33.86 
 
 
470 aa  122  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.010131  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2732  hypothetical protein  32.09 
 
 
275 aa  123  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.76859  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2524  protein of unknown function DUF147  31.89 
 
 
248 aa  123  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74845  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0895  protein of unknown function DUF147  34.25 
 
 
388 aa  122  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000136651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1145  hypothetical protein  36.4 
 
 
279 aa  122  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586351 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0868  hypothetical protein  33.2 
 
 
470 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1807  hypothetical protein  31.25 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.895114  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1497  hypothetical protein  31.13 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2254  hypothetical protein  35.42 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3366  protein of unknown function DUF147  33.59 
 
 
388 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2637  protein of unknown function DUF147  31.9 
 
 
252 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1597  protein of unknown function DUF147  31.9 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1909  hypothetical protein  28.11 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14891  hypothetical protein  32.23 
 
 
300 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4701  protein of unknown function DUF147  31.01 
 
 
327 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11821  hypothetical protein  32.58 
 
 
286 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4735  hypothetical protein  27.07 
 
 
325 aa  115  7.999999999999999e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0657  hypothetical protein  31.75 
 
 
300 aa  115  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1392  hypothetical protein  30.12 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0913  hypothetical protein  27.07 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>