20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5457 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5457  protein of unknown function DUF721  100 
 
 		 95 aa  192  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.010243  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10803  hypothetical protein  38.2 
 
 		 98 aa  71.2  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.594174  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3716  hypothetical protein  37.5 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.290608 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4977  hypothetical protein  34.44 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0216  protein of unknown function DUF721  35.56 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690778  normal  0.772545 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0612  protein of unknown function DUF721  31.18 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2709  protein of unknown function DUF721  30.43 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1102  hypothetical protein  34.09 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000565832  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0638  hypothetical protein  33.72 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.128267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3768  hypothetical protein  31.11 
 
 		 152 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00373156  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2691  protein of unknown function DUF721  28.42 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0095  hypothetical protein  28.57 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.437017  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2009  hypothetical protein  33.87 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0003  hypothetical protein  32.81 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179596  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1548  protein of unknown function DUF721  28.41 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0658767  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0004  hypothetical protein  31.25 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301106  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0004  hypothetical protein  25.27 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2445  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000048803  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2226  hypothetical protein  24.47 
 
 		 168 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000216141  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0645  hypothetical protein  28 
 
 		 97 aa  40  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.361881 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>