More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5452 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  100 
 
 		 239 aa  499  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.625319 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1437  oxidoreductase  66.11 
 
 		 246 aa  335  2.9999999999999997e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147364  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  59.83 
 
 		 245 aa  319  3e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2722  hypothetical protein  50.21 
 
 		 242 aa  250  2e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.451695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1216  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  51.69 
 
 		 244 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770234  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1611  hypothetical protein  44.96 
 
 		 241 aa  228  6e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0746419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0079  hypothetical protein  44.64 
 
 		 260 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.376514  unclonable  0.0000154463 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1416  hypothetical protein  45.57 
 
 		 239 aa  223  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1216  hypothetical protein  45.57 
 
 		 239 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0407054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1194  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  45.57 
 
 		 239 aa  223  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1196  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  45.57 
 
 		 239 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0498426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1315  hypothetical protein  45.57 
 
 		 239 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1206  hypothetical protein  43.7 
 
 		 241 aa  223  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.546437  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1456  hypothetical protein  45.57 
 
 		 239 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1392  hypothetical protein  45.57 
 
 		 239 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3990  hypothetical protein  44.73 
 
 		 239 aa  222  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1935  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.12 
 
 		 241 aa  222  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0152527 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1354  hypothetical protein  44.73 
 
 		 239 aa  221  7e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1607  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.7 
 
 		 241 aa  221  8e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0717  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.12 
 
 		 248 aa  220  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1218  hypothetical protein  44.73 
 
 		 239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1024  hypothetical protein  44.3 
 
 		 239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0367  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  45.15 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2222  hypothetical protein  43.7 
 
 		 263 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3098  hypothetical protein  43.7 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1713  hypothetical protein  43.7 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2738  Fe-S oxidoreductase  43.7 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2604  hypothetical protein  43.7 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186656  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1494  hypothetical protein  43.7 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2660  hypothetical protein  43.7 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1769  hypothetical protein  45.34 
 
 		 266 aa  218  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0772008 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2995  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  46.22 
 
 		 246 aa  217  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1310  hypothetical protein  43.7 
 
 		 241 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1870  hypothetical protein  43.7 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1274  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.26 
 
 		 239 aa  215  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2168  hypothetical protein  43.28 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2585  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  44.12 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00208948 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0392  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.46 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1547  hypothetical protein  43.28 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198081  normal  0.0351499 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2041  hypothetical protein  42.86 
 
 		 240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3606  hypothetical protein  44.07 
 
 		 270 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2958  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  41.84 
 
 		 242 aa  210  1e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5437  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  41.6 
 
 		 240 aa  209  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3263  hypothetical protein  41.42 
 
 		 242 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1139  hypothetical protein  42.74 
 
 		 236 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2148  hypothetical protein  42.44 
 
 		 240 aa  209  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11459  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3037  hypothetical protein  41 
 
 		 242 aa  208  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3270  hypothetical protein  41 
 
 		 242 aa  208  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3259  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.83 
 
 		 240 aa  208  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5946  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  42.44 
 
 		 240 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2131  hypothetical protein  42.44 
 
 		 240 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198327  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1464  hypothetical protein  42.02 
 
 		 240 aa  208  8e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270606  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0967  hypothetical protein  45.15 
 
 		 245 aa  205  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0818  hypothetical protein  42.19 
 
 		 241 aa  204  9e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.212327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0140  hypothetical protein  42.37 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0695  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.32 
 
 		 244 aa  202  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3065  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.46 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.44 
 
 		 270 aa  201  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128565  normal  0.0827191 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2452  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  42.5 
 
 		 247 aa  201  6e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.345477  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3164  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.22 
 
 		 256 aa  200  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3704  hypothetical protein  41.67 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7370  cysteine-rich domain protein  42.86 
 
 		 250 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1437  hypothetical protein  40.16 
 
 		 247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1096  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.46 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.757675 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37080  Fe-S oxidoreductase  41.53 
 
 		 243 aa  199  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.151092  normal  0.0205493 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0669  hypothetical protein  44.17 
 
 		 243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0954341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1462  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.04 
 
 		 227 aa  196  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0836578  normal  0.704766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4922  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.78 
 
 		 246 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00884029  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5743  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.16 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.044378 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2080  hypothetical protein  43.04 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945675  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2946  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.78 
 
 		 244 aa  194  7e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4815  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40 
 
 		 247 aa  194  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1431  hypothetical protein  42.02 
 
 		 268 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.667811  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0458  hypothetical protein  42.02 
 
 		 268 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1873  hypothetical protein  42.02 
 
 		 289 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3173  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.87 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2182  hypothetical protein  42.02 
 
 		 268 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0867  hypothetical protein  42.02 
 
 		 268 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.258503  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5817  hypothetical protein  42.68 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.537036  normal  0.103138 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5429  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.46 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2718  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.52 
 
 		 247 aa  192  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2709  hypothetical protein  40.17 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  0.129266 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2429  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.53 
 
 		 248 aa  191  7e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267816 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2975  hypothetical protein  41.46 
 
 		 259 aa  191  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0555  Fe-S oxidoreductase  41.6 
 
 		 268 aa  191  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1234  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.34 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.399981  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2930  hypothetical protein  44.98 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.656633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3038  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.67 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04070  Fe-S oxidoreductase  38.56 
 
 		 244 aa  189  5e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0880878 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1690  glycolate oxidase-like protein  41.95 
 
 		 274 aa  188  5e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0338  hypothetical protein  40.76 
 
 		 239 aa  188  7e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2645  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.37 
 
 		 247 aa  188  8e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3932  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.1 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.38362 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1896  Fe-S oxidoreductase  40.68 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.138109  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0359  cysteine-rich domain protein  40.76 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.477523 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05530  Fe-S oxidoreductase  41.39 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0259  cysteine-rich domain protein  40.76 
 
 		 239 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3299  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.76 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00266  hypothetical protein  40.76 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0321  hypothetical protein  40.76 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>