270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5430 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5430  homoserine kinase  100 
 
 
311 aa  635    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6218  homoserine kinase  53.09 
 
 
311 aa  327  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.559552  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2574  homoserine kinase  59.54 
 
 
306 aa  327  2.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0074  homoserine kinase  51.79 
 
 
309 aa  318  6e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.281834 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3803  homoserine kinase  50.66 
 
 
311 aa  308  8e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3151  homoserine kinase  51.64 
 
 
309 aa  296  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07415  homoserine kinase  47.4 
 
 
308 aa  275  8e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2545  homoserine kinase  47.19 
 
 
320 aa  260  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0629954  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1986  homoserine kinase  46.56 
 
 
320 aa  253  3e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2333  homoserine kinase  47.19 
 
 
320 aa  252  6e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0296  homoserine kinase  46.18 
 
 
320 aa  250  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.193938 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2706  homoserine kinase  45.6 
 
 
320 aa  246  4e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.690361  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0139  homoserine kinase  50.69 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0261  homoserine kinase  44.83 
 
 
320 aa  239  5.999999999999999e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.836867  normal  0.0420212 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1262  homoserine kinase  36.04 
 
 
325 aa  175  9e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.467921  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1424  homoserine kinase  36.51 
 
 
322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1357  homoserine kinase  36.51 
 
 
322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1306  homoserine kinase  38.46 
 
 
302 aa  169  5e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.460055  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0041  homoserine kinase  37.41 
 
 
307 aa  169  5e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1298  homoserine kinase  37.73 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.801618  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0658  homoserine kinase  38.32 
 
 
301 aa  163  3e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.411206  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1378  homoserine kinase  37.96 
 
 
301 aa  159  8e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0058  homoserine kinase  36.64 
 
 
291 aa  157  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.188045  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004456  homoserine kinase  33.23 
 
 
323 aa  155  9e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00940  homoserine kinase  33.23 
 
 
323 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0833  homoserine kinase  36.3 
 
 
312 aa  154  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3579  homoserine kinase  31.56 
 
 
331 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2302  homoserine kinase  35.12 
 
 
293 aa  150  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.591143  normal  0.310319 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0002  homoserine kinase  30.45 
 
 
310 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.475933  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0807  homoserine kinase  30.38 
 
 
309 aa  149  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.522624 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3603  homoserine kinase  30.38 
 
 
309 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3475  homoserine kinase  30.38 
 
 
309 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1251  homoserine kinase  34.98 
 
 
296 aa  149  7e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.823907  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3593  homoserine kinase  30.13 
 
 
310 aa  148  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0004  homoserine kinase  29.81 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.528078  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0573  homoserine kinase  30.42 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00003  homoserine kinase  29.81 
 
 
310 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.646398  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0003  homoserine kinase  29.81 
 
 
310 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03327  homoserine kinase  34.49 
 
 
315 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0004  homoserine kinase  29.81 
 
 
310 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3652  homoserine kinase  29.81 
 
 
310 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0002  homoserine kinase  29.81 
 
 
310 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00003  hypothetical protein  29.81 
 
 
310 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.716854  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3310  homoserine kinase  35.74 
 
 
293 aa  146  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0003  homoserine kinase  31.29 
 
 
309 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.611229  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0003  homoserine kinase  31.29 
 
 
309 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.45853  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0003  homoserine kinase  31.29 
 
 
309 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0003  homoserine kinase  31.29 
 
 
309 aa  145  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1097  homoserine kinase  37.64 
 
 
314 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1750  homoserine kinase  38.03 
 
 
304 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.1731 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0565  homoserine kinase  30.87 
 
 
309 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0003  homoserine kinase  30.97 
 
 
309 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1644  homoserine kinase  34.8 
 
 
291 aa  143  4e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0534  homoserine kinase  29.77 
 
 
309 aa  142  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.883707  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1305  homoserine kinase  35.86 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2555  homoserine kinase  31.23 
 
 
318 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1213  homoserine kinase  30.89 
 
 
314 aa  138  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.241016  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0684  homoserine kinase  28.71 
 
 
309 aa  135  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0440126  normal  0.0506936 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1166  homoserine kinase  34.15 
 
 
301 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3862  homoserine kinase  29.13 
 
 
309 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0723691  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3667  homoserine kinase  29.13 
 
 
309 aa  134  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.478541  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4290  homoserine kinase  30.19 
 
 
328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2309  homoserine kinase  29.81 
 
 
308 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2115  homoserine kinase  30.74 
 
 
300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185248 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1318  homoserine kinase  29.26 
 
 
300 aa  129  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.607391  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1942  homoserine kinase  30.28 
 
 
318 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.17619  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1031  homoserine kinase  31.72 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0595  homoserine kinase  30.51 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06211  homoserine kinase  30.77 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2478  homoserine kinase  29.28 
 
 
297 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.979123  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18581  homoserine kinase  30.55 
 
 
316 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0031  homoserine kinase  29.93 
 
 
315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0932  homoserine kinase  30.19 
 
 
315 aa  126  5e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.732555  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1440  homoserine kinase  30.84 
 
 
306 aa  126  5e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.231357  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1176  homoserine kinase  30.35 
 
 
312 aa  126  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06511  homoserine kinase  29.93 
 
 
315 aa  126  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.893933  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2392  homoserine kinase  36.62 
 
 
326 aa  126  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.6073 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0906  homoserine kinase  31.55 
 
 
314 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1581  homoserine kinase  28.95 
 
 
307 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1271  homoserine kinase  30.65 
 
 
311 aa  124  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06511  homoserine kinase  28.52 
 
 
302 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1871  homoserine kinase  29.39 
 
 
305 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1080  homoserine kinase  32.49 
 
 
316 aa  124  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.708816  normal  0.284936 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1897  homoserine kinase  29.68 
 
 
305 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3414  homoserine kinase  30.87 
 
 
312 aa  123  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1067  homoserine kinase  30.65 
 
 
311 aa  123  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1276  homoserine kinase  30.67 
 
 
318 aa  122  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08010  homoserine kinase  27.76 
 
 
311 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0100938  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1139  homoserine kinase  30.55 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06601  homoserine kinase  28.25 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1140  homoserine kinase  30.55 
 
 
312 aa  120  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0308198  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00815  homoserine kinase  36.36 
 
 
294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.500035  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1064  homoserine kinase  26.21 
 
 
303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1210  homoserine kinase  30.23 
 
 
312 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0672  homoserine kinase  29.48 
 
 
311 aa  119  9e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.000904789 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16080  homoserine kinase  30.89 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.222088  hitchhiker  0.000000158758 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2905  homoserine kinase  30.77 
 
 
319 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0593  homoserine kinase  27.54 
 
 
304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3085  homoserine kinase  30.41 
 
 
321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.479885  hitchhiker  0.00212807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2253  homoserine kinase  33.09 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.227732  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>