82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5347 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  100 
 
 		 686 aa  1428    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  36.94 
 
 		 656 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  34.72 
 
 		 800 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  35.35 
 
 		 634 aa  364  3e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  33.92 
 
 		 666 aa  352  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  32.94 
 
 		 640 aa  351  3e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  33.43 
 
 		 655 aa  350  5e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  33.53 
 
 		 648 aa  345  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  33.24 
 
 		 636 aa  340  4e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  33.39 
 
 		 638 aa  330  4e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  33.28 
 
 		 652 aa  324  4e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  31.87 
 
 		 656 aa  323  7e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  31.76 
 
 		 651 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  31.71 
 
 		 656 aa  320  3.9999999999999996e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  31.6 
 
 		 651 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  31.6 
 
 		 651 aa  320  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  32.64 
 
 		 634 aa  319  1e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  31.45 
 
 		 651 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  31.45 
 
 		 651 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  33.12 
 
 		 620 aa  317  5e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  32.96 
 
 		 620 aa  316  8e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  31.6 
 
 		 659 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  31.6 
 
 		 667 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  31.99 
 
 		 617 aa  313  9e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  32.21 
 
 		 647 aa  312  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  33.33 
 
 		 648 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  32.32 
 
 		 647 aa  312  2e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  34.2 
 
 		 640 aa  300  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  34.2 
 
 		 640 aa  292  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  34.14 
 
 		 648 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  29.05 
 
 		 640 aa  288  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  32.3 
 
 		 628 aa  283  8.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  30.46 
 
 		 646 aa  281  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000770924  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  28.9 
 
 		 659 aa  281  3e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  28.7 
 
 		 652 aa  270  7e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  29.6 
 
 		 673 aa  267  5e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  29.37 
 
 		 680 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  29.35 
 
 		 684 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  33.66 
 
 		 679 aa  249  1e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  29.21 
 
 		 672 aa  243  6e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  26.49 
 
 		 665 aa  233  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1535  hypothetical protein  30.49 
 
 		 742 aa  233  1e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  28.5 
 
 		 643 aa  224  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05305  DUF1680 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G08910)  29.24 
 
 		 629 aa  213  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2831  protein of unknown function DUF1680  25.04 
 
 		 629 aa  201  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  25.69 
 
 		 654 aa  200  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0057  protein of unknown function DUF1680  27.01 
 
 		 643 aa  197  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0839925 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0407  protein of unknown function DUF1680  26.9 
 
 		 633 aa  197  8.000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02820  hypothetical protein  27.69 
 
 		 643 aa  191  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.491149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0212  hypothetical protein  31.25 
 
 		 397 aa  172  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000517482  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  30.21 
 
 		 795 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  29.86 
 
 		 795 aa  114  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  30.14 
 
 		 795 aa  114  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  23.48 
 
 		 1025 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2153  protein of unknown function DUF1680  29.43 
 
 		 792 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.299284  normal  0.0915146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  23.09 
 
 		 760 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  29.34 
 
 		 602 aa  99.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  22.66 
 
 		 765 aa  95.9  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  23.58 
 
 		 844 aa  92.8  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  27.42 
 
 		 607 aa  89.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  25.59 
 
 		 803 aa  89.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  25.44 
 
 		 783 aa  86.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  21.71 
 
 		 641 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  21.5 
 
 		 955 aa  85.9  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0363  protein of unknown function DUF1680  25.8 
 
 		 744 aa  76.3  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0636  protein of unknown function DUF1680  25.1 
 
 		 667 aa  74.3  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  24.67 
 
 		 846 aa  73.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  25.76 
 
 		 596 aa  73.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  25.59 
 
 		 614 aa  72.8  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  25.36 
 
 		 771 aa  68.2  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0089  protein of unknown function DUF1680  23.14 
 
 		 677 aa  64.3  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2035  protein of unknown function DUF1680  24.43 
 
 		 678 aa  61.6  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0997  protein of unknown function DUF1680  20.72 
 
 		 597 aa  60.8  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3545  hypothetical protein  20.11 
 
 		 663 aa  60.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  21.28 
 
 		 963 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  21.51 
 
 		 838 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  21.41 
 
 		 711 aa  56.6  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1194  protein of unknown function DUF1680  24.07 
 
 		 749 aa  56.2  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1342  hypothetical protein  21.37 
 
 		 669 aa  52  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1480  protein of unknown function DUF1680  23.91 
 
 		 632 aa  51.2  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11690  hypothetical protein  21.76 
 
 		 752 aa  49.7  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1254  protein of unknown function DUF1680  19.2 
 
 		 684 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.831647  normal  0.201869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>