More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5332 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 347 aa  698    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4410  secretion protein HlyD family protein  46.96 
 
 		 370 aa  308  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  43.23 
 
 		 347 aa  262  6.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  42.86 
 
 		 375 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  39.61 
 
 		 366 aa  259  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  40.73 
 
 		 359 aa  250  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  36.59 
 
 		 349 aa  225  7e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  37.88 
 
 		 369 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0040  multidrug resistance protein A  39.42 
 
 		 342 aa  222  6e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.984941  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  39.04 
 
 		 372 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  39.75 
 
 		 368 aa  220  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  40.47 
 
 		 332 aa  220  3e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  38.14 
 
 		 375 aa  219  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  36.53 
 
 		 355 aa  216  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  37.31 
 
 		 328 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 366 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  38.82 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  35.45 
 
 		 351 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  38.62 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  37.5 
 
 		 390 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6122  secretion protein HlyD family protein  36.44 
 
 		 347 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  35.31 
 
 		 355 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  35.31 
 
 		 344 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  37.73 
 
 		 374 aa  210  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  36.34 
 
 		 372 aa  209  7e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  33.84 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  33.84 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  36.61 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  37.3 
 
 		 349 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  37.95 
 
 		 383 aa  205  8e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  38.25 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  39.7 
 
 		 413 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  38.25 
 
 		 351 aa  203  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  38.04 
 
 		 351 aa  200  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  37.05 
 
 		 352 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  37.05 
 
 		 352 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  37.84 
 
 		 351 aa  199  7e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  36.69 
 
 		 346 aa  198  9e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  37.05 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  36.75 
 
 		 352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  37.05 
 
 		 352 aa  195  9e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  33.82 
 
 		 390 aa  194  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  34.26 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  34.74 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  36.39 
 
 		 373 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  37.5 
 
 		 401 aa  193  3e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  35.42 
 
 		 373 aa  193  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  35.88 
 
 		 380 aa  193  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  35.14 
 
 		 410 aa  193  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3626  secretion protein HlyD family protein  37.05 
 
 		 374 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal  0.990317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4465  secretion protein HlyD  37.05 
 
 		 374 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3901  secretion protein HlyD family protein  37.05 
 
 		 374 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  35.03 
 
 		 383 aa  192  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  34.1 
 
 		 385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  36.72 
 
 		 372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  33.82 
 
 		 387 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2257  HlyD family secretion protein  36.19 
 
 		 341 aa  189  9e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105446  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2027  secretion protein HlyD  38.44 
 
 		 413 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294658  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  35.69 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  36.6 
 
 		 422 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  34.69 
 
 		 381 aa  185  9e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  35.03 
 
 		 470 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  35.03 
 
 		 475 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  35.03 
 
 		 475 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  35.59 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  40.2 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  37.22 
 
 		 348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  36.69 
 
 		 350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  38.07 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  33.53 
 
 		 348 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  35.92 
 
 		 393 aa  183  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  34.07 
 
 		 380 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2024  secretion protein HlyD  37.05 
 
 		 429 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0436308  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  35.82 
 
 		 364 aa  182  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  36.54 
 
 		 404 aa  182  7e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  35.42 
 
 		 349 aa  182  9.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2560  multidrug resistance protein  36.25 
 
 		 410 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.634691  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2726  multidrug ABC transporter transmembrane protein  37.38 
 
 		 388 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  36.42 
 
 		 363 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  35.09 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  35.12 
 
 		 349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  36.22 
 
 		 375 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2289  secretion protein HlyD family protein  40.2 
 
 		 348 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  34.57 
 
 		 460 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  34.57 
 
 		 460 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  31.17 
 
 		 334 aa  179  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  34.81 
 
 		 371 aa  179  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1426  secretion protein HlyD family protein  35 
 
 		 405 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183071 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  34.71 
 
 		 414 aa  179  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2377  secretion protein HlyD family protein  39.54 
 
 		 348 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4645  HlyD family secretion protein  35.31 
 
 		 404 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.109619  normal  0.493066 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1386  secretion protein HlyD family protein  35 
 
 		 407 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3362  secretion protein HlyD family protein  33.13 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  hitchhiker  0.0000000000000309797 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  34.64 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3406  secretion protein HlyD family protein  36.36 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1751  efflux pump membrane protein  35 
 
 		 407 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0610226 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1744  multidrug resistance protein  34.69 
 
 		 411 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1919  multidrug resistance protein  34.69 
 
 		 411 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1767  multidrug resistance protein  34.69 
 
 		 411 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  35.67 
 
 		 413 aa  176  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>