More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5329 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5329  ABC transporter related  100 
 
 		 735 aa  1522    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.580332 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  43.23 
 
 		 725 aa  631  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  42.92 
 
 		 737 aa  623  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  44.43 
 
 		 728 aa  621  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0890  ABC transporter related protein  42.15 
 
 		 771 aa  613  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  42.37 
 
 		 726 aa  607  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  42.76 
 
 		 730 aa  604  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  42.72 
 
 		 741 aa  595  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5250  ABC transporter related  40.52 
 
 		 802 aa  592  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1623  ABC transporter related protein  41.63 
 
 		 735 aa  581  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068726  normal  0.025744 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1690  ABC transporter related  40.57 
 
 		 773 aa  570  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0835868  normal  0.0224785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0781  ABC transporter related protein  38.83 
 
 		 827 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.6 
 
 		 1018 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  32.16 
 
 		 1040 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.87 
 
 		 1018 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  32.28 
 
 		 1018 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  31.83 
 
 		 908 aa  373  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  31.33 
 
 		 1038 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.73 
 
 		 1019 aa  368  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  31.33 
 
 		 1038 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  31.27 
 
 		 906 aa  366  1e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  31.13 
 
 		 906 aa  364  3e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  33.15 
 
 		 1013 aa  363  6e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  33.24 
 
 		 1011 aa  362  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.4 
 
 		 908 aa  353  7e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  28.89 
 
 		 1042 aa  352  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  29.88 
 
 		 738 aa  337  7e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  29.04 
 
 		 738 aa  332  2e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  30.54 
 
 		 726 aa  329  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  31.84 
 
 		 743 aa  327  5e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  29.59 
 
 		 727 aa  322  1.9999999999999998e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  31.31 
 
 		 725 aa  317  5e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  28.63 
 
 		 739 aa  316  8e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  29.44 
 
 		 1000 aa  316  8e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  29.66 
 
 		 727 aa  311  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.42 
 
 		 1003 aa  310  6.999999999999999e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3741  ABC transporter related  30.15 
 
 		 720 aa  307  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0543649  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  29.21 
 
 		 732 aa  306  8.000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.98 
 
 		 1024 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.75 
 
 		 999 aa  304  3.0000000000000004e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  27.05 
 
 		 715 aa  300  5e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0105  bacteriocin ABC transporter ATP-binding/permease  29.2 
 
 		 704 aa  296  8e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0105  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.2 
 
 		 704 aa  296  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  28.26 
 
 		 760 aa  296  1e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4110  ABC transporter related  29.2 
 
 		 704 aa  296  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.75 
 
 		 720 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  27.1 
 
 		 759 aa  294  4e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  29.42 
 
 		 721 aa  293  9e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  28.78 
 
 		 1001 aa  291  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0406  ABC transporter related  31.01 
 
 		 725 aa  291  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.330383  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  28.29 
 
 		 750 aa  291  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  28.98 
 
 		 719 aa  291  4e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  27.57 
 
 		 722 aa  289  1e-76  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  27.91 
 
 		 695 aa  289  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  26.81 
 
 		 716 aa  288  2.9999999999999996e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  26.73 
 
 		 717 aa  286  8e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01637  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB  30.35 
 
 		 704 aa  286  8e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140253  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  30.32 
 
 		 720 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  27.47 
 
 		 731 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  27.45 
 
 		 716 aa  284  5.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  28.65 
 
 		 699 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0494  ABC transporter related  29.15 
 
 		 707 aa  283  8.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.670279  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  26.09 
 
 		 721 aa  282  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0558  colicin V secretion ABC transporter ATP-binding protein  29.01 
 
 		 707 aa  282  1e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  30.34 
 
 		 720 aa  281  2e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.51 
 
 		 1013 aa  281  2e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  28.3 
 
 		 734 aa  281  3e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.2 
 
 		 1008 aa  281  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.2 
 
 		 1008 aa  281  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3122  ABC transporter related  27.82 
 
 		 721 aa  280  5e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.742255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  28.47 
 
 		 706 aa  280  7e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4506  toxin secretion ATP-binding protein  27.69 
 
 		 721 aa  280  8e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3057  ABC transporter related  29.2 
 
 		 683 aa  280  8e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696223  normal  0.0570299 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  26.35 
 
 		 726 aa  279  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  28.17 
 
 		 734 aa  278  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0092  ABC transporter related  29.23 
 
 		 727 aa  278  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353929  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3793  colicin V processing peptidase  29.99 
 
 		 712 aa  278  4e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145248 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  26 
 
 		 865 aa  276  8e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  27.87 
 
 		 743 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4346  ABC transporter related  29.37 
 
 		 726 aa  275  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.345165  normal  0.461929 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  26.88 
 
 		 725 aa  275  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  27.67 
 
 		 728 aa  275  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  29.04 
 
 		 733 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1956  ABC transporter related  29.38 
 
 		 739 aa  273  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319877  normal  0.491395 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  29.03 
 
 		 712 aa  273  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  28.73 
 
 		 696 aa  272  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  29.73 
 
 		 728 aa  272  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  29.74 
 
 		 705 aa  272  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  27.46 
 
 		 715 aa  271  2e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1584  ABC transporter related  28.16 
 
 		 688 aa  271  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2167  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein, HlyB family  30.24 
 
 		 723 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  29.95 
 
 		 976 aa  271  2.9999999999999997e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1826  ABC transporter related  30.24 
 
 		 723 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.279853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  26.59 
 
 		 748 aa  271  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1112  ABC transporter related  27.57 
 
 		 737 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.37 
 
 		 1016 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.15 
 
 		 1006 aa  269  1e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  26.95 
 
 		 747 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  27.72 
 
 		 727 aa  268  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  27.92 
 
 		 721 aa  267  5e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>