More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5305 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_0854  PfaD family protein  44.42 
 
 		 803 aa  696    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.111662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3105  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  46.8 
 
 		 764 aa  709    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5305  PfaD family protein  100 
 
 		 790 aa  1626    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.108741 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1432  PfaD family protein  44.12 
 
 		 481 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1675  MmpIII  44.44 
 
 		 1154 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257093  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2587  PfaD family protein  42.76 
 
 		 865 aa  363  7.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4451  PfaD family protein  38.51 
 
 		 549 aa  333  8e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.898677  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2668  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.12 
 
 		 545 aa  332  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2843  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.5 
 
 		 548 aa  332  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2736  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.04 
 
 		 550 aa  330  8e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2669  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.04 
 
 		 550 aa  329  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1112  omega-3 polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  39.95 
 
 		 537 aa  328  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1597  hypothetical protein  38.58 
 
 		 547 aa  325  2e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2932  PfaD family protein  38.29 
 
 		 548 aa  325  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.266003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1422  PfaD family protein  38.06 
 
 		 548 aa  324  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1450  PfaD family protein  38.29 
 
 		 548 aa  324  4e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1323  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.13 
 
 		 552 aa  324  4e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.596001  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1416  PfaD family protein  38.29 
 
 		 548 aa  324  4e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2910  PfaD family protein  37.84 
 
 		 542 aa  324  4e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1218  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.92 
 
 		 542 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3205  2-nitropropane dioxygenase, NPD  37.09 
 
 		 541 aa  320  5e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1420  PfaD family protein  36.87 
 
 		 545 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3099  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  38.1 
 
 		 532 aa  315  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1675  PfaD family protein  39.23 
 
 		 557 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.752172  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2630  hypothetical protein  37.44 
 
 		 542 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2594  2-nitropropane dioxygenase, NPD  36.99 
 
 		 552 aa  311  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1687  polyunsaturated fatty acid synthase PfaD  37.53 
 
 		 531 aa  309  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0463  PfaD family protein  37.44 
 
 		 542 aa  306  9.000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.780857  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3913  PfaD family protein  37.67 
 
 		 556 aa  305  2.0000000000000002e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3952  PfaD family protein  39.82 
 
 		 550 aa  305  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0190583  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3093  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  48.76 
 
 		 410 aa  305  3.0000000000000004e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3100  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.1 
 
 		 554 aa  298  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4751  2-nitropropane dioxygenase, NPD  39.37 
 
 		 525 aa  298  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2013  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.78 
 
 		 554 aa  296  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2266  PfaD family protein  38.46 
 
 		 477 aa  294  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5626  hypothetical protein  36.76 
 
 		 526 aa  293  9e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2929  2-nitropropane dioxygenase, NPD  38.66 
 
 		 553 aa  290  8e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0103438  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2106  PfaD family protein  37.59 
 
 		 554 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2112  PfaD family protein  36.9 
 
 		 554 aa  284  5.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0687  peptidase M22, glycoprotease  35.6 
 
 		 530 aa  276  8e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000276719 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2616  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  45.76 
 
 		 390 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0488176  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1389  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  45.76 
 
 		 390 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1475  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  49.28 
 
 		 437 aa  267  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00398178  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0174  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  49.64 
 
 		 452 aa  266  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286523  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0451  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  49.64 
 
 		 452 aa  266  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0265499  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1125  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  49.64 
 
 		 452 aa  266  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.162779  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1434  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  50.68 
 
 		 377 aa  265  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.62068  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1209  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  49.64 
 
 		 394 aa  265  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.059657  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1433  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  48.18 
 
 		 623 aa  265  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2597  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  46.15 
 
 		 2284 aa  259  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4239  PfaD family protein  34.05 
 
 		 539 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.354626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4311  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.49 
 
 		 1055 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.707296 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2098  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.5 
 
 		 299 aa  213  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.476029  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10280  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  43.48 
 
 		 309 aa  210  8e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0189442  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2512  putative acyltransferase  44.73 
 
 		 282 aa  208  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2602  putative acyltransferase  44.73 
 
 		 282 aa  208  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2015  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  42.55 
 
 		 293 aa  196  1e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1644  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.34 
 
 		 309 aa  194  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2977  putative acyltransferase  43.89 
 
 		 264 aa  190  8e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.301026  hitchhiker  0.0000388716 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2491  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  40 
 
 		 302 aa  190  9e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3992  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.82 
 
 		 297 aa  189  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107097 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0641  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.83 
 
 		 313 aa  187  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000153814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2986  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  37.97 
 
 		 319 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0669081  normal  0.0218137 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5012  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.55 
 
 		 291 aa  186  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3966  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  39.36 
 
 		 292 aa  185  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147046  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1158  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.14 
 
 		 301 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00125697  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1804  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.48 
 
 		 290 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1458  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.11 
 
 		 299 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1850  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.11 
 
 		 299 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0839  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.11 
 
 		 299 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2155  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.11 
 
 		 299 aa  182  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.582901  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0428  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.11 
 
 		 299 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0524  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.11 
 
 		 299 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1034  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  36.2 
 
 		 291 aa  182  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.24557  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0611  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  39.86 
 
 		 299 aa  181  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000665754  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1832  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.14 
 
 		 290 aa  181  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2730  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  40.88 
 
 		 292 aa  180  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.212271 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3675  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.07 
 
 		 314 aa  180  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0879975  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3951  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.07 
 
 		 314 aa  179  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.174745  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1292  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.71 
 
 		 314 aa  179  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.785479  hitchhiker  0.0000000000409846 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0176  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  36.81 
 
 		 304 aa  179  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0199  hypothetical protein  40.56 
 
 		 293 aa  179  2e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.608762 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3894  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  40.71 
 
 		 314 aa  178  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.14091  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0130  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  37.5 
 
 		 293 aa  178  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0128  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  37.5 
 
 		 293 aa  178  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199952  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1456  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  43.32 
 
 		 293 aa  178  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.40678  normal  0.0451316 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0181  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  37.09 
 
 		 303 aa  178  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0124548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0957  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.57 
 
 		 314 aa  177  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.915141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3703  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  40.36 
 
 		 314 aa  177  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.527854  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0132  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  39.93 
 
 		 301 aa  177  6e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.446703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3990  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  40.36 
 
 		 314 aa  177  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000233521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3593  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  40.36 
 
 		 314 aa  177  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3611  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  40.36 
 
 		 314 aa  177  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.276022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3900  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.36 
 
 		 314 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6954  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.38 
 
 		 297 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4148  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.49 
 
 		 292 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0283843 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2469  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  39.08 
 
 		 291 aa  175  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0181872 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1085  Acyl transferase  39.29 
 
 		 412 aa  175  2.9999999999999996e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.242324  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3866  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40 
 
 		 314 aa  174  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3239299999999998e-45 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1044  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  41.28 
 
 		 299 aa  174  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00926086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>