More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5300 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  100 
 
 
420 aa  869    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  45.91 
 
 
405 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  41.87 
 
 
411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2385  cytochrome P450  42.14 
 
 
412 aa  324  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.409201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  42.34 
 
 
410 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  41.21 
 
 
411 aa  309  5e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  39.8 
 
 
419 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  38.88 
 
 
411 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  39.15 
 
 
411 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  39.15 
 
 
411 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  38.65 
 
 
411 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  38.39 
 
 
411 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  38.88 
 
 
411 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  38.88 
 
 
411 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  38.88 
 
 
411 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  38.14 
 
 
411 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  39.4 
 
 
411 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5532  cytochrome P450  39.41 
 
 
414 aa  297  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  39.51 
 
 
411 aa  296  6e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  38.42 
 
 
410 aa  293  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  38.52 
 
 
402 aa  290  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  38.32 
 
 
401 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  41.01 
 
 
410 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2102  cytochrome P450  39.44 
 
 
417 aa  285  7e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.521658  normal  0.0100122 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  36.08 
 
 
426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2064  cytochrome P450  37.8 
 
 
408 aa  281  2e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.680222 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2290  cytochrome P450  35.8 
 
 
400 aa  280  5e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  37.26 
 
 
412 aa  279  7e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4206  cytochrome P450  37.31 
 
 
406 aa  276  5e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.974086  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20970  cytochrome P450  39.95 
 
 
418 aa  276  7e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210976  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2367  cytochrome P450  36.76 
 
 
396 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.499034 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  37.53 
 
 
408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4235  cytochrome P450  35.57 
 
 
400 aa  272  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.457806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  39.44 
 
 
402 aa  270  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  34.89 
 
 
417 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  37.67 
 
 
406 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  37.79 
 
 
459 aa  265  8.999999999999999e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  37.56 
 
 
423 aa  265  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3600  cytochrome P450  34.81 
 
 
402 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4362  cytochrome P450  34 
 
 
398 aa  263  4.999999999999999e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  34.75 
 
 
409 aa  260  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  35.58 
 
 
417 aa  260  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  37.47 
 
 
394 aa  257  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0804  cytochrome P450  34.52 
 
 
407 aa  256  7e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  33.82 
 
 
407 aa  255  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  37.93 
 
 
416 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  34.89 
 
 
402 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1807  cytochrome P450  35.81 
 
 
405 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.154982  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2770  cytochrome P450  35.55 
 
 
395 aa  251  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00247392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  35.88 
 
 
404 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  34.81 
 
 
422 aa  250  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  34.05 
 
 
400 aa  249  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0041  cytochrome P450  34.79 
 
 
407 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1901  cytochrome P450  36.41 
 
 
411 aa  249  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.908058  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  35.09 
 
 
408 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  35.04 
 
 
407 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  34.84 
 
 
399 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1930  cytochrome P450  35.66 
 
 
429 aa  246  8e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.708059 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3652  cytochrome P450  35.71 
 
 
406 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  34.79 
 
 
407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  34.79 
 
 
407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  34.38 
 
 
405 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  33.49 
 
 
418 aa  243  5e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2132  cytochrome P450  33.83 
 
 
417 aa  243  6e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.257002  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  35.82 
 
 
411 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  35.57 
 
 
412 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4485  cytochrome P450  35.82 
 
 
421 aa  242  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.45181  normal  0.78931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  34.75 
 
 
413 aa  242  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  36.94 
 
 
390 aa  240  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8494  cytochrome P450  36.13 
 
 
409 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  35.63 
 
 
405 aa  237  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  35.58 
 
 
396 aa  238  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  34.83 
 
 
412 aa  237  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3438  cytochrome P450  34.24 
 
 
412 aa  237  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0067  cytochrome P450  36.11 
 
 
423 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.838674 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  35.38 
 
 
388 aa  236  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2162  cytochrome P450  33.67 
 
 
392 aa  236  8e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4384  cytochrome P450  35.5 
 
 
400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1604  cytochrome P450  31.51 
 
 
436 aa  234  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0677  cytochrome P450  34.24 
 
 
402 aa  233  6e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.113337  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  34.5 
 
 
395 aa  232  9e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6078  cytochrome P450  33.33 
 
 
414 aa  230  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  34.62 
 
 
398 aa  230  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  33.67 
 
 
403 aa  229  5e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  34.48 
 
 
408 aa  229  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1521  cytochrome P450  35.7 
 
 
407 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1544  cytochrome P450  35.7 
 
 
407 aa  229  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  31.08 
 
 
399 aa  228  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0433  cytochrome P450  38.15 
 
 
447 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0443  cytochrome P450  38.15 
 
 
447 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0122986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  39.69 
 
 
414 aa  228  2e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6255  putative cytochrome P450  35.16 
 
 
399 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.553976  normal  0.0297217 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4557  cytochrome P450  32.92 
 
 
420 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0420  cytochrome P450  38.15 
 
 
447 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  31.91 
 
 
398 aa  226  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  34.01 
 
 
417 aa  226  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2412  cytochrome P450  33.42 
 
 
395 aa  225  9e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5236  cytochrome P450 CYP109C2  33.07 
 
 
399 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.134393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  36.2 
 
 
409 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5256  CYP55B1; cytochrome P450, nitric oxide reductase  35.82 
 
 
398 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00211326  normal  0.131878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>