More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5297 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1204  putative polyketide synthase  35.89 
 
 
4212 aa  739    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451.1  hypothetical protein  47.63 
 
 
4580 aa  669    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0845  hypothetical protein  47.63 
 
 
4101 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4314  beta-ketoacyl synthase  31.48 
 
 
3231 aa  1038    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  36.78 
 
 
1656 aa  729    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0434  polyketide synthase  47.54 
 
 
4157 aa  668    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1856  polyketide non-ribosomal peptide synthase  46.92 
 
 
4123 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  34.98 
 
 
2762 aa  713    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5297  KR domain protein  100 
 
 
2727 aa  5640    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0222593 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1665  polyketide synthase, putative  32.21 
 
 
4649 aa  675    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  48.25 
 
 
4048 aa  676    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3095  beta-ketoacyl synthase  40.67 
 
 
7157 aa  1568    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  38.49 
 
 
2103 aa  714    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1425  KR domain protein  34.78 
 
 
6876 aa  871    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0863  Beta-ketoacyl synthase  38.4 
 
 
1440 aa  768    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.139933  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3094  erythronolide synthase  52.42 
 
 
1262 aa  649    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0859  Beta-ketoacyl synthase  41.06 
 
 
1601 aa  852    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.782867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  32.39 
 
 
7149 aa  922    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  39.28 
 
 
5802 aa  1392    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0860  Beta-ketoacyl synthase  36.17 
 
 
4036 aa  1256    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  37.53 
 
 
1474 aa  702    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3097  beta-ketoacyl synthase  31.47 
 
 
4869 aa  801    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3096  erythronolide synthase  51.99 
 
 
1315 aa  640    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1394  putative polyketide synthase PksL  36.13 
 
 
5993 aa  1076    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0858  Beta-ketoacyl synthase  42.32 
 
 
2725 aa  762    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5290  erythronolide synthase, 6-methylsalicylic acid synthase  56.88 
 
 
4429 aa  823    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5291  erythronolide synthase, Mycocerosate synthase  48.33 
 
 
4588 aa  691    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0861  Beta-ketoacyl synthase  36.15 
 
 
3525 aa  1189    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5289  KR domain protein  36.81 
 
 
1911 aa  892    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0168  putative polyketide synthase  35.66 
 
 
5822 aa  1142    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0446  putative polyketide synthase  35.86 
 
 
5778 aa  1146    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2161  hypothetical protein  47.63 
 
 
4098 aa  669    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0862  Beta-ketoacyl synthase  34.97 
 
 
5854 aa  1311    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0530  putative polyketide synthase PksM  47.7 
 
 
4122 aa  672    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1479  putative polyketide synthase PksL  35.12 
 
 
5915 aa  1127    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1393  polyketide synthase, type I  32.65 
 
 
4555 aa  624  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2618  OnnB  32.75 
 
 
4539 aa  623  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1478  polyketide synthase, type I  32.65 
 
 
4614 aa  624  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  35.05 
 
 
6889 aa  618  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1673  thiotemplate mechanism natural product synthetase  31.73 
 
 
3925 aa  610  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1430  KR domain protein  43.06 
 
 
5612 aa  592  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3036  amino acid adenylation  34.6 
 
 
4165 aa  587  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.585184 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1666  polyketide synthase, putative  49.92 
 
 
5566 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1674  polyketide synthase  50.75 
 
 
5628 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0170  polyketide synthase  44.86 
 
 
2653 aa  567  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4313  beta-ketoacyl synthase  36.4 
 
 
2393 aa  547  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.415713 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1429  6-deoxyerythronolide-B synthase  40.15 
 
 
2363 aa  543  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4312  erythronolide synthase  40.54 
 
 
2260 aa  532  1e-149  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.908395 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0167  putative polyketide synthase PksJ  34.64 
 
 
3818 aa  529  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1130  putative polyketide synthase PksL  49.37 
 
 
2726 aa  527  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0001  polyketide synthase  34.15 
 
 
4874 aa  523  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1395  putative polyketide synthase PksJ  34.26 
 
 
5021 aa  524  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1480  putative polyketide synthase PksJ  34.04 
 
 
5023 aa  519  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1423  6-methylsalicylic acid synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  40.49 
 
 
2501 aa  516  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  34.12 
 
 
4478 aa  503  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5292  erythronolide synthase, Beta-ketoacyl-acyl- carrier-protein synthase I  33.84 
 
 
1696 aa  500  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0888589  normal  0.456588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  32.38 
 
 
4101 aa  494  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  28.42 
 
 
3099 aa  484  1e-135  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2383  condensation domain protein  26.87 
 
 
2006 aa  482  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.66 
 
 
2551 aa  478  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5919  beta-ketoacyl synthase  42.01 
 
 
2463 aa  475  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00253672 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  29.06 
 
 
7279 aa  478  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2597  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  38.83 
 
 
2284 aa  476  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  36.95 
 
 
3811 aa  474  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  26.78 
 
 
3695 aa  466  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0864  amino acid adenylation domain protein  27.8 
 
 
2063 aa  462  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2136  hypothetical protein  28.48 
 
 
3781 aa  456  1.0000000000000001e-126  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0751  amino acid adenylation domain-containing protein  31.21 
 
 
3875 aa  457  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2111  hypothetical protein  28.19 
 
 
3780 aa  451  1e-125  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3098  mycocerosate synthase  41.71 
 
 
1717 aa  453  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  31.3 
 
 
5154 aa  448  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  32.27 
 
 
2880 aa  449  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  34.08 
 
 
3702 aa  444  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  34.19 
 
 
3693 aa  444  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  34.19 
 
 
3693 aa  444  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  31.76 
 
 
3696 aa  442  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  33.47 
 
 
3176 aa  439  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1932a  modular polyketide synthase  42.42 
 
 
591 aa  439  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.527668  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  27.73 
 
 
4080 aa  434  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  28.95 
 
 
5255 aa  434  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1205  putative polyketide synthase  41.17 
 
 
1749 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5920  beta-ketoacyl synthase  33.19 
 
 
2975 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0135718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  33.44 
 
 
3679 aa  429  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2619  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  36.99 
 
 
1619 aa  425  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  28.57 
 
 
3494 aa  427  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  32.97 
 
 
3463 aa  425  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  40.94 
 
 
2551 aa  427  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  41.67 
 
 
1087 aa  420  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  28.69 
 
 
4183 aa  419  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  33.59 
 
 
3676 aa  421  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  30.42 
 
 
2374 aa  419  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0171  polyketide synthase  39.54 
 
 
1798 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  31.4 
 
 
3645 aa  416  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  32.89 
 
 
3130 aa  417  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3532  amino acid adenylation  30.44 
 
 
3718 aa  417  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  32.26 
 
 
2376 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0449  DszB  39.54 
 
 
1778 aa  417  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  32.38 
 
 
3930 aa  412  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  30.28 
 
 
3427 aa  413  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  27.19 
 
 
7210 aa  412  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.1197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>