More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5296 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A0845  hypothetical protein  34.45 
 
 		 4101 aa  773    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0434  polyketide synthase  34.45 
 
 		 4157 aa  789    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1204  putative polyketide synthase  37.17 
 
 		 4212 aa  909    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451.1  hypothetical protein  34.64 
 
 		 4580 aa  774    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1395  putative polyketide synthase PksJ  36.49 
 
 		 5021 aa  779    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4312  erythronolide synthase  34.79 
 
 		 2260 aa  873    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.908395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4314  beta-ketoacyl synthase  32.44 
 
 		 3231 aa  1019    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5296  Beta-ketoacyl synthase  100 
 
 		 5802 aa  11980    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0721794 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1430  KR domain protein  43.78 
 
 		 5612 aa  642    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0001  polyketide synthase  36.49 
 
 		 4874 aa  778    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3096  erythronolide synthase  56.84 
 
 		 1315 aa  720    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1856  polyketide non-ribosomal peptide synthase  34.17 
 
 		 4123 aa  785    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1665  polyketide synthase, putative  34.17 
 
 		 4649 aa  707    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1666  polyketide synthase, putative  55.74 
 
 		 5566 aa  691    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1673  thiotemplate mechanism natural product synthetase  52.84 
 
 		 3925 aa  660    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1674  polyketide synthase  51.46 
 
 		 5628 aa  721    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2093  polyketide synthase, putative  34.12 
 
 		 4048 aa  807    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0858  Beta-ketoacyl synthase  41.98 
 
 		 2725 aa  794    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0860  Beta-ketoacyl synthase  45.71 
 
 		 4036 aa  979    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5297  KR domain protein  39.28 
 
 		 2727 aa  1412    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222593 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0862  Beta-ketoacyl synthase  39.38 
 
 		 5854 aa  1502    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0863  Beta-ketoacyl synthase  40.56 
 
 		 1440 aa  903    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.139933  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3095  beta-ketoacyl synthase  44.68 
 
 		 7157 aa  1734    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1425  KR domain protein  36.12 
 
 		 6876 aa  847    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5290  erythronolide synthase, 6-methylsalicylic acid synthase  39.54 
 
 		 4429 aa  1425    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2598  KR domain protein  31.62 
 
 		 7149 aa  922    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0859  Beta-ketoacyl synthase  45.28 
 
 		 1601 aa  948    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.782867  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3097  beta-ketoacyl synthase  59.33 
 
 		 4869 aa  904    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0861  Beta-ketoacyl synthase  45.38 
 
 		 3525 aa  830    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5291  erythronolide synthase, Mycocerosate synthase  71.35 
 
 		 4588 aa  1109    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0167  putative polyketide synthase PksJ  36.56 
 
 		 3818 aa  778    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1394  putative polyketide synthase PksL  40.39 
 
 		 5993 aa  1252    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0446  putative polyketide synthase  39.22 
 
 		 5778 aa  1302    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5289  KR domain protein  38.44 
 
 		 1911 aa  984    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2161  hypothetical protein  34.51 
 
 		 4098 aa  774    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0530  putative polyketide synthase PksM  34.41 
 
 		 4122 aa  787    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1479  putative polyketide synthase PksL  38.99 
 
 		 5915 aa  1286    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1480  putative polyketide synthase PksJ  36.49 
 
 		 5023 aa  779    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4313  beta-ketoacyl synthase  38.74 
 
 		 2393 aa  611  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.415713 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1393  polyketide synthase, type I  45.74 
 
 		 4555 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2618  OnnB  45.74 
 
 		 4539 aa  596  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0170  polyketide synthase  45.69 
 
 		 2653 aa  595  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3094  erythronolide synthase  48.34 
 
 		 1262 aa  593  1e-167  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0168  putative polyketide synthase  39.78 
 
 		 5822 aa  582  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1130  putative polyketide synthase PksL  54.61 
 
 		 2726 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1478  polyketide synthase, type I  54.61 
 
 		 4614 aa  576  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1429  6-deoxyerythronolide-B synthase  41.17 
 
 		 2363 aa  570  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1423  6-methylsalicylic acid synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  33.85 
 
 		 2501 aa  567  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1421  FkbH like protein  42.66 
 
 		 3811 aa  548  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1205  putative polyketide synthase  41.8 
 
 		 1749 aa  547  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2597  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  40.62 
 
 		 2284 aa  532  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.14 
 
 		 2551 aa  528  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2619  beta-ketoacyl synthase domain-containing protein  42.9 
 
 		 1619 aa  525  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  28.57 
 
 		 3695 aa  518  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5919  beta-ketoacyl synthase  41.54 
 
 		 2463 aa  513  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00253672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5292  erythronolide synthase, Beta-ketoacyl-acyl- carrier-protein synthase I  44.16 
 
 		 1696 aa  499  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0888589  normal  0.456588 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2383  condensation domain protein  28.23 
 
 		 2006 aa  498  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  33.11 
 
 		 3099 aa  493  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  44.24 
 
 		 2462 aa  489  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2377  Beta-ketoacyl synthase  27.14 
 
 		 1613 aa  479  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  29.5 
 
 		 7210 aa  476  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  33.47 
 
 		 4478 aa  476  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  35.84 
 
 		 3176 aa  473  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  33.17 
 
 		 3702 aa  471  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  28.52 
 
 		 3645 aa  466  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  33.07 
 
 		 3693 aa  467  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  33.07 
 
 		 3693 aa  467  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  32.47 
 
 		 3696 aa  467  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  28.81 
 
 		 4080 aa  464  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  33.05 
 
 		 3676 aa  463  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2136  hypothetical protein  26.75 
 
 		 3781 aa  459  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2111  hypothetical protein  26.73 
 
 		 3780 aa  460  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0976  Beta-ketoacyl synthase  38.73 
 
 		 1272 aa  460  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.801633  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  28.55 
 
 		 3711 aa  459  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  34.12 
 
 		 3130 aa  456  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  39.88 
 
 		 2762 aa  457  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  31.23 
 
 		 4183 aa  451  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  32.31 
 
 		 3679 aa  452  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1932a  modular polyketide synthase  44.02 
 
 		 591 aa  449  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.527668  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  33.71 
 
 		 2880 aa  451  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  39.43 
 
 		 1656 aa  448  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  41.11 
 
 		 2333 aa  448  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  28.02 
 
 		 7279 aa  447  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5920  beta-ketoacyl synthase  33.73 
 
 		 2975 aa  443  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0135718 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0864  amino acid adenylation domain protein  36.41 
 
 		 2063 aa  444  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3098  mycocerosate synthase  41.4 
 
 		 1717 aa  441  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  42.51 
 
 		 2551 aa  441  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  28.74 
 
 		 5255 aa  439  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  33.15 
 
 		 3930 aa  437  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  28.87 
 
 		 3494 aa  432  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.23 
 
 		 7110 aa  427  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  39.21 
 
 		 1939 aa  427  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  45.27 
 
 		 2232 aa  426  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  41.37 
 
 		 1087 aa  426  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  32.74 
 
 		 3463 aa  426  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  39.49 
 
 		 2103 aa  424  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  32.23 
 
 		 4647 aa  422  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  39.58 
 
 		 1587 aa  421  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5924  beta-ketoacyl synthase  32.28 
 
 		 2201 aa  421  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0606388 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1667  polyketide synthase, putative  42.23 
 
 		 1901 aa  417  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>