179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5260 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5260  Beta-N-acetylhexosaminidase  100 
 
 
609 aa  1266    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0488918  hitchhiker  0.00217525 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1614  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.8 
 
 
634 aa  541  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2031  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.91 
 
 
762 aa  534  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.250491  normal  0.492134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4336  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.98 
 
 
553 aa  524  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3399  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.74 
 
 
613 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.06 
 
 
790 aa  514  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.07 
 
 
766 aa  514  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6221  Beta-N-acetylhexosaminidase  45.33 
 
 
795 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.473929  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1388  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.93 
 
 
905 aa  507  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.351923  normal  0.145256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3192  Beta-N-acetylhexosaminidase  48.41 
 
 
542 aa  504  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.106418 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1175  Beta-N-acetylhexosaminidase  47 
 
 
533 aa  489  1e-137  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3037  glycosyl hydrolase  40.64 
 
 
795 aa  477  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542043  hitchhiker  0.0000668214 
 
 
-
 
NC_002950  PG0043  beta-hexosaminidase  42.07 
 
 
777 aa  473  1e-132  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2638  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.87 
 
 
613 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.33846  normal  0.654187 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1350  Beta-N-acetylhexosaminidase  43.41 
 
 
775 aa  469  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0434  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.56 
 
 
618 aa  468  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.37 
 
 
779 aa  451  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0293  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.08 
 
 
781 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218419  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2039  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.92 
 
 
772 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3960  beta-hexosaminidase  37.19 
 
 
776 aa  424  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2718  Beta-N-acetylhexosaminidase  38 
 
 
779 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.954025  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1198  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.56 
 
 
774 aa  419  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.263867  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0578  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.44 
 
 
526 aa  418  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.385541  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0868  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.94 
 
 
549 aa  418  9.999999999999999e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3427  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.82 
 
 
785 aa  415  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0258977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1798  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.1 
 
 
618 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2417  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.44 
 
 
821 aa  405  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3975  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.68 
 
 
605 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0128397  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4989  Beta-N-acetylhexosaminidase  42.21 
 
 
534 aa  392  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171054  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4994  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.96 
 
 
765 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00424832  normal  0.110436 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2363  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.92 
 
 
527 aa  391  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14021  normal  0.334984 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01641  beta-hexosaminidase  39.53 
 
 
736 aa  386  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.108006  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1927  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.98 
 
 
812 aa  383  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000016014  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3893  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.83 
 
 
760 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.470709 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2003  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.81 
 
 
812 aa  381  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00352357  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3656  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.68 
 
 
655 aa  362  1e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.621281  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1293  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.86 
 
 
534 aa  355  2e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788263  normal  0.441973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4808  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.15 
 
 
834 aa  349  7e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8105  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.16 
 
 
505 aa  348  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0142  beta-N-acetylhexosaminidase  36.99 
 
 
637 aa  340  4e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  39.91 
 
 
469 aa  339  9e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5877  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.59 
 
 
546 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2148  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.98 
 
 
549 aa  328  3e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0482384  normal  0.117 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2583  beta-hexosaminidase (beta-N-acetylglucosaminidase)  38.33 
 
 
602 aa  325  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7198  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.29 
 
 
525 aa  313  4.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03430  beta-N-hexosaminidase  33.59 
 
 
639 aa  312  1e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7722  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.5 
 
 
628 aa  310  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2279  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.14 
 
 
529 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.962324  hitchhiker  0.00828921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9002  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.58 
 
 
545 aa  308  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1669  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.95 
 
 
547 aa  305  2.0000000000000002e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.254995  normal  0.452028 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002579  beta-hexosaminidase  33.52 
 
 
639 aa  304  3.0000000000000004e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0201  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.55 
 
 
481 aa  301  2e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0369  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.65 
 
 
665 aa  302  2e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.868004  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9094  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.02 
 
 
422 aa  300  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121755  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3353  beta-N-acetylhexosaminidase  34.44 
 
 
543 aa  297  5e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08320  N-acetyl-beta-hexosaminidase  34.6 
 
 
614 aa  289  8e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.034495 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2739  Beta-N-acetylhexosaminidase  38.43 
 
 
627 aa  282  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3454  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.71 
 
 
636 aa  281  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4653  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.33 
 
 
639 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292919  normal  0.0791763 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6251  beta-N-acetylhexosaminidase  33.99 
 
 
639 aa  273  5.000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3756  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.27 
 
 
636 aa  272  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782699  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2018  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.28 
 
 
493 aa  265  2e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.191644  hitchhiker  0.00584388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0449  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.56 
 
 
447 aa  262  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1091  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.99 
 
 
515 aa  260  7e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4556  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.04 
 
 
688 aa  258  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1005  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.02 
 
 
688 aa  254  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000159373 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3493  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.79 
 
 
683 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2019  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.99 
 
 
504 aa  249  1e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758955 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3430  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.07 
 
 
584 aa  246  6.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0765311 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0442  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.41 
 
 
794 aa  246  8e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.327931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32560  N-acetyl-beta-hexosaminidase  32.57 
 
 
525 aa  244  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0177898  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3807  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.08 
 
 
593 aa  244  3e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0222239 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  30.83 
 
 
816 aa  243  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0536  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.65 
 
 
797 aa  242  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3060  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.5 
 
 
820 aa  241  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.481908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2735  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.67 
 
 
676 aa  238  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.38332  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1285  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.99 
 
 
852 aa  236  8e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1032  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.96 
 
 
518 aa  235  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6613  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.83 
 
 
673 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4251  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.61 
 
 
528 aa  231  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.115163  normal  0.185001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4810  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.11 
 
 
533 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.48578  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2797  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.74 
 
 
858 aa  231  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5673  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.23 
 
 
673 aa  231  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.869284  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0072  beta-N-acetylhexosaminidase  31.22 
 
 
558 aa  230  7e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0947  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.05 
 
 
500 aa  229  9e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.376461 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2989  putative beta-N-acetylhexosaminidase  29.71 
 
 
807 aa  226  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3941  Beta-N-acetylhexosaminidase  29.19 
 
 
811 aa  224  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1487  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.04 
 
 
866 aa  216  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  30.44 
 
 
1140 aa  215  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06345  N-acetyl-beta-hexosaminidase  33.15 
 
 
778 aa  210  7e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6586  Beta-N-acetylhexosaminidase  26.3 
 
 
863 aa  204  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2737  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.97 
 
 
530 aa  202  1.9999999999999998e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.536035  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0842  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.92 
 
 
489 aa  201  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00650  N-acetyl-beta-hexosaminidase  31.25 
 
 
473 aa  196  8.000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.735936  normal  0.194133 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4327  Beta-N-acetylhexosaminidase  27.66 
 
 
868 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0943  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.28 
 
 
884 aa  191  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.125845  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32069  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  27.97 
 
 
614 aa  189  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.28283 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0232  Beta-N-acetylhexosaminidase  30.81 
 
 
479 aa  188  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.107558  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3271  glycosyl hydrolase  30.89 
 
 
889 aa  187  7e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0765357  hitchhiker  0.00388677 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3509  beta-hexosaminidase b precursor  28.63 
 
 
896 aa  186  8e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>