More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5239 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5239  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  100 
 
 
259 aa  525  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000091984  hitchhiker  0.0000000000884158 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1028  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  42.15 
 
 
250 aa  204  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  39.84 
 
 
249 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  40.78 
 
 
253 aa  192  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.53 
 
 
270 aa  192  6e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  41.04 
 
 
257 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  40.48 
 
 
258 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  38.19 
 
 
265 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  38.17 
 
 
259 aa  189  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.6 
 
 
262 aa  187  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26980  chromosome segregation ATPase  38.43 
 
 
370 aa  187  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.69 
 
 
255 aa  187  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0208  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.76 
 
 
264 aa  187  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.92 
 
 
274 aa  187  2e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000115827  hitchhiker  2.28802e-16 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.65 
 
 
253 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.4 
 
 
265 aa  186  3e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  38.8 
 
 
259 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1363  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.43 
 
 
266 aa  186  3e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.4 
 
 
262 aa  186  4e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.96 
 
 
254 aa  185  5e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  38.82 
 
 
257 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  38.82 
 
 
257 aa  186  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  39.69 
 
 
258 aa  185  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.1 
 
 
265 aa  185  7e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  39.44 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  41.04 
 
 
330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.27 
 
 
253 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.8 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.74 
 
 
255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  38.55 
 
 
254 aa  183  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.2 
 
 
257 aa  182  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.5 
 
 
257 aa  183  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.8 
 
 
253 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.58 
 
 
268 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.5 
 
 
257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  39.04 
 
 
348 aa  182  6e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0006  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.15 
 
 
258 aa  182  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  36.22 
 
 
265 aa  181  7e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40.71 
 
 
257 aa  181  8.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9050  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.8 
 
 
392 aa  181  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0426351  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  40 
 
 
253 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  40 
 
 
253 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  40 
 
 
253 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  40 
 
 
253 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  40 
 
 
253 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  40 
 
 
253 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.6 
 
 
253 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  40 
 
 
253 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  39.6 
 
 
276 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2753  chromosome segregation ATPase  41.57 
 
 
262 aa  181  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00357509  normal  0.629486 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  40 
 
 
253 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  40 
 
 
253 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  39.84 
 
 
257 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.53 
 
 
253 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.94 
 
 
293 aa  180  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.61 
 
 
265 aa  180  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.55 
 
 
253 aa  180  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1365  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  41.44 
 
 
272 aa  180  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.625193  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.04 
 
 
270 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000481921 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.15 
 
 
260 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5065  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.25 
 
 
329 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.995886  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4159  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.3 
 
 
258 aa  179  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.28 
 
 
257 aa  179  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7333  cobyrinic acid ac-diamide synthase  40.64 
 
 
470 aa  179  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.946911  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  35 
 
 
265 aa  179  4e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.25 
 
 
265 aa  179  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1707  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.34 
 
 
269 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.91 
 
 
260 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  38.91 
 
 
260 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  36.69 
 
 
256 aa  178  5.999999999999999e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  37.6 
 
 
254 aa  178  7e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.05 
 
 
265 aa  178  7e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.14 
 
 
295 aa  178  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5105  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.85 
 
 
437 aa  178  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000298727 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.21 
 
 
294 aa  177  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15300  chromosome partitioning ATPase  37.45 
 
 
290 aa  177  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.087048  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23420  chromosome segregation ATPase  38.58 
 
 
315 aa  177  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  39.76 
 
 
294 aa  177  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4587  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  37.45 
 
 
433 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127465  hitchhiker  0.000606651 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  39.04 
 
 
265 aa  177  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5045  parA family protein  39.11 
 
 
268 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337287  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3935  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.31 
 
 
284 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000549335  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.98 
 
 
266 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.92 
 
 
362 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.33 
 
 
256 aa  177  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.92 
 
 
256 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  39.44 
 
 
256 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  37.65 
 
 
260 aa  176  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.55 
 
 
301 aa  176  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  38.8 
 
 
253 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0607  ParA family ATPase  38.06 
 
 
251 aa  176  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  38.34 
 
 
253 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2175  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  40 
 
 
255 aa  176  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000290082  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.94 
 
 
299 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.58 
 
 
268 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2946  sporulation initiation inhibitor protein Soj  38.89 
 
 
256 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.204641  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0188  chromosome partitioning protein ParA  38.89 
 
 
256 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0507089  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  36.76 
 
 
293 aa  176  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3005  sporulation initiation inhibitor protein Soj  38.89 
 
 
256 aa  176  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4054  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide binding domain-containing protein  38.89 
 
 
256 aa  176  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>