More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5180 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02361  aminoglycoside/multidrug efflux system  36.87 
 
 		 1037 aa  691    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1200  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  36.87 
 
 		 1037 aa  691    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1385  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  37.11 
 
 		 1050 aa  694    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.252885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3426  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  39.24 
 
 		 1059 aa  719    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.96069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1360  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  36.88 
 
 		 1054 aa  721    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.103096  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1597  multidrug efflux transporter MexF  37.84 
 
 		 1055 aa  703    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.586106  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2231  HAE1 efflux family protein  60.21 
 
 		 1037 aa  1298    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.601813  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0010  putative acriflavin resistance transmembrane protein  37.9 
 
 		 1049 aa  686    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.461171  normal  0.0539399 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1113  transmembrane multidrug-efflux system lipoprotein transmembrane  38.95 
 
 		 1069 aa  680    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.674026  normal  0.708175 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1355  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  37.87 
 
 		 1052 aa  739    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1537  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  41.27 
 
 		 1037 aa  820    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209864  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0415  RND efflux system, inner membrane transporter CmeB  37.85 
 
 		 1040 aa  766    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0292  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  40.13 
 
 		 1051 aa  795    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0334  hydrophobe/amphiphile efflux-1 family protein  39.15 
 
 		 1074 aa  746    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3492  RND multidrug efflux transporter MexF  39.39 
 
 		 1047 aa  694    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4692  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.6 
 
 		 1044 aa  710    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3100  multidrug efflux RND transporter MexF  39.4 
 
 		 1063 aa  719    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0635013  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4304  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.61 
 
 		 1044 aa  704    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1465  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  38.11 
 
 		 1061 aa  721    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.372368  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2130  hypothetical protein  37.79 
 
 		 1050 aa  727    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2580  hypothetical protein  38.65 
 
 		 1050 aa  730    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2104  hypothetical protein  37.39 
 
 		 1052 aa  721    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2434  hypothetical protein  38.94 
 
 		 1050 aa  731    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2282  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37.71 
 
 		 1047 aa  693    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0161777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2968  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.41 
 
 		 1063 aa  732    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.599397  normal  0.253976 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4008  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  36.6 
 
 		 1044 aa  702    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.507214  normal  0.0226563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2161  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  40.12 
 
 		 1040 aa  777    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3062  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.07 
 
 		 1057 aa  770    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4089  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37 
 
 		 1050 aa  698    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4334  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39 
 
 		 1063 aa  683    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.637408  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37.98 
 
 		 1057 aa  744    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1841  multidrug-efflux transporter protein  38.11 
 
 		 1061 aa  721    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1130  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.85 
 
 		 1059 aa  765    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.121687  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1827  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.93 
 
 		 1071 aa  690    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0746968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1279  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  36.51 
 
 		 1054 aa  697    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0197931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2658  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.75 
 
 		 1063 aa  741    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2757  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.12 
 
 		 1043 aa  690    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0156651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2894  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37.57 
 
 		 1032 aa  680    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0114017  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1100  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  37.52 
 
 		 1060 aa  707    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3095  cation/multidrug efflux pump  38.38 
 
 		 1042 aa  759    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00680948  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0296  hydrophobe/amphiphile efflux pump, HAE1  38.59 
 
 		 1066 aa  725    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.243004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0807  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  43.73 
 
 		 1070 aa  828    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1203  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  42.24 
 
 		 1055 aa  842    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0458875  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1664  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  36.46 
 
 		 1044 aa  680    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.186908  normal  0.57083 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0401  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37.59 
 
 		 1055 aa  718    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.913827  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0536  resistance-nodulation-cell division family transporter  39.23 
 
 		 1034 aa  771    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0688  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.29 
 
 		 1057 aa  745    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0691  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41.24 
 
 		 1038 aa  761    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.553697  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0850  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.06 
 
 		 1074 aa  689    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1727  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  60.53 
 
 		 1059 aa  1325    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0256707  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0886  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  36.85 
 
 		 1052 aa  684    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1118  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37.18 
 
 		 1052 aa  695    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.558549  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2105  hydrophobe/amphiphile efflux family protein  38.02 
 
 		 1061 aa  719    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.179451  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3303  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37.65 
 
 		 1078 aa  699    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.110746  normal  0.948069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4026  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  36.23 
 
 		 1053 aa  692    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.698151 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3585  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37.46 
 
 		 1050 aa  689    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4635  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.81 
 
 		 1047 aa  788    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.518068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0373  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  63.95 
 
 		 1059 aa  1446    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1592  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  41 
 
 		 1037 aa  798    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0951856  unclonable  0.000000469931 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1793  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.18 
 
 		 1062 aa  690    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3428  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.64 
 
 		 1065 aa  684    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2892  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  38.63 
 
 		 1088 aa  695    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1230  RND family hydrophobe/amphiphile efflux pump  38.27 
 
 		 1076 aa  739    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207904 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3080  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.41 
 
 		 1078 aa  712    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2310  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37.68 
 
 		 1062 aa  696    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.107479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2681  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37.51 
 
 		 1049 aa  694    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0839162  normal  0.444783 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3330  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37.27 
 
 		 1042 aa  693    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.66718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0949  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  37.3 
 
 		 1066 aa  745    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0712  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.02 
 
 		 1057 aa  709    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1702  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  39.77 
 
 		 1063 aa  768    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.710777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3589  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.11 
 
 		 1050 aa  681    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3924  multidrug efflux system protein  36.15 
 
 		 1048 aa  682    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0170856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4866  acriflavin resistance protein F  38.55 
 
 		 1081 aa  681    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0385197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1068  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.25 
 
 		 1059 aa  761    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.186507 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2817  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.74 
 
 		 1043 aa  739    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.702974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4071  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.48 
 
 		 1055 aa  721    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.702974  normal  0.202748 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3420  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.87 
 
 		 1042 aa  737    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3015  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  38.5 
 
 		 1061 aa  724    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841089  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4125  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.73 
 
 		 1058 aa  703    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0790876  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0538  AcrB/AcrD family multidrug resistance protein  57.88 
 
 		 1048 aa  1245    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199673  normal  0.872862 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0941  acriflavin resistance protein D  39.92 
 
 		 1056 aa  734    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0389771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2860  acridine efflux pump  63.07 
 
 		 1055 aa  1381    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00427277  normal  0.0312794 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1074  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.54 
 
 		 1049 aa  691    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1940  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.74 
 
 		 1055 aa  714    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0454025  hitchhiker  0.00180133 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3836  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  36.85 
 
 		 1044 aa  702    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1146  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.54 
 
 		 1049 aa  691    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.204778  normal  0.908583 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2036  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.74 
 
 		 1055 aa  714    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.449144  normal  0.194235 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3929  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  36.85 
 
 		 1044 aa  702    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1408  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  36.31 
 
 		 1058 aa  687    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.902436  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4698  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.59 
 
 		 1071 aa  723    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.294616  normal  0.444302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05540  RND multidrug efflux transporter MexB  38.6 
 
 		 1046 aa  725    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.277681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32390  RND multidrug efflux transporter MexF  39.22 
 
 		 1062 aa  714    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.119837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60830  multidrug efflux RND transporter MexD  38.22 
 
 		 1043 aa  682    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.503401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5351  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.5 
 
 		 1061 aa  724    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31153  normal  0.391167 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1075  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  37.02 
 
 		 1065 aa  679    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.405118  normal  0.514139 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1076  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  37.88 
 
 		 1063 aa  701    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.421657  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1457  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.89 
 
 		 1055 aa  722    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000798188 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3922  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  38.19 
 
 		 1052 aa  757    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.222699 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1078  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  39.54 
 
 		 1049 aa  691    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1993  acriflavin resistance protein  38.64 
 
 		 1055 aa  714    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.194422  normal  0.0258068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>