More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5101 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5101  peptidase M24  100 
 
 
465 aa  957    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.232729  normal  0.589739 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1440  Xaa-Pro dipeptidase  58.13 
 
 
461 aa  550  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.377937 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5472  Xaa-Pro dipeptidase  44.54 
 
 
472 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.812118  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3422  Xaa-Pro dipeptidase  44.47 
 
 
464 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0811  Xaa-Pro dipeptidase  44.37 
 
 
471 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0068  Xaa-Pro dipeptidase  34.87 
 
 
451 aa  296  6e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0066  peptidase M24  34.87 
 
 
451 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0179653  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3411  Xaa-Pro dipeptidase  35.5 
 
 
458 aa  285  9e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.141786 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0766  peptidase M24  35.45 
 
 
459 aa  281  1e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.498025  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1467  Xaa-Pro dipeptidase  38.02 
 
 
493 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4366  peptidase M24  35.78 
 
 
455 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2684  Xaa-Pro dipeptidase  35.48 
 
 
463 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3327  proline aminopeptidase P II  32.9 
 
 
437 aa  193  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0020606  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3217  proline aminopeptidase P II  31.55 
 
 
438 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00100894  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3291  proline aminopeptidase P II  31.55 
 
 
438 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.133072  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3229  proline aminopeptidase P II  31.55 
 
 
438 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000552442  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3294  proline aminopeptidase P II  31.55 
 
 
438 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0229287  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3396  proline aminopeptidase P II  31.55 
 
 
438 aa  192  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00011206  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0682  aminopeptidase P  31.47 
 
 
439 aa  191  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0390702  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0860  proline aminopeptidase P II  32.4 
 
 
437 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000995662  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2542  aminopeptidase P  31.05 
 
 
437 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158286  normal  0.0283016 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0863  proline aminopeptidase P II  32.4 
 
 
437 aa  190  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00955422  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0444  proline aminopeptidase P II  31.33 
 
 
441 aa  190  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0805194  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3827  proline aminopeptidase P II  32.4 
 
 
437 aa  190  5e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000338921  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2770  xaa-pro aminopeptidase  31.47 
 
 
436 aa  188  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3329  proline aminopeptidase P II  31.76 
 
 
441 aa  188  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000100618  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3042  proline aminopeptidase P II  31.33 
 
 
441 aa  188  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000751227  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0801  proline aminopeptidase P II  31.76 
 
 
441 aa  187  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000590411  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3427  peptidase M24  31.84 
 
 
439 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02740  proline aminopeptidase P II  31.33 
 
 
441 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000920962  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3067  proline aminopeptidase P II  31.33 
 
 
441 aa  187  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000106171  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02703  hypothetical protein  31.33 
 
 
441 aa  187  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000102485  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4201  proline aminopeptidase P II  31.33 
 
 
441 aa  187  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000052463  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3236  proline aminopeptidase P II  31.33 
 
 
441 aa  187  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000420398  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0541  proline aminopeptidase P II  30.47 
 
 
441 aa  186  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.597882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0784  peptidase M24  31.76 
 
 
441 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264237  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3594  proline aminopeptidase P II  31.91 
 
 
442 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5967  aminopeptidase P  31.62 
 
 
444 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2764  peptidase M24  31.34 
 
 
454 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69000  aminopeptidase P  31.62 
 
 
444 aa  183  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2579  peptidase M24  29.4 
 
 
443 aa  181  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3475  proline aminopeptidase P II  31.76 
 
 
441 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2438  peptidase M24  30.41 
 
 
446 aa  179  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000518121  hitchhiker  0.000000118983 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2815  Xaa-Pro aminopeptidase  30.41 
 
 
446 aa  179  8e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.269049  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0131  peptidase M24  30.49 
 
 
439 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.366962  decreased coverage  0.000000108006 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47330  Aminopeptidase P  30.6 
 
 
444 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0134  peptidase M24  30.49 
 
 
439 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1185  peptidase M24  32.33 
 
 
452 aa  177  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3919  proline aminopeptidase P II  30.6 
 
 
437 aa  176  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000043495  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0606  peptidase M24  28.85 
 
 
439 aa  176  6e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02378  aminopeptidase P  32.54 
 
 
446 aa  176  9e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05810  ProlidasePutative uncharacterized protein (EC 3.4.13.9); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96WX8]  31.06 
 
 
465 aa  176  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0500  putative aminopeptidase P  30.71 
 
 
441 aa  176  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0229386  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5025  peptidase M24  30.34 
 
 
444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.252533  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0321  peptidase M24:peptidase M24B, X-Pro dipeptidase/aminopeptidase N-terminal  30.69 
 
 
444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.735607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5434  aminopeptidase P  29.83 
 
 
444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5200  peptidase M24  30.13 
 
 
444 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.322511  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26550  predicted protein  29.58 
 
 
490 aa  173  6.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0032931 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1559  peptidase M24  30.47 
 
 
443 aa  173  6.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.287144  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4084  Xaa-Pro dipeptidase  29.37 
 
 
429 aa  172  9e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.544517  normal  0.312434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5107  peptidase M24  30.13 
 
 
444 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.132845  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0024  aminopeptidase P  31.13 
 
 
445 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.407188  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0325  peptidase M24  30.45 
 
 
444 aa  171  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5260  peptidase M24  29.7 
 
 
444 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0894  peptidase M24  32.98 
 
 
449 aa  170  6e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3513  aminopeptidase P  30.02 
 
 
439 aa  170  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135159  normal  0.871047 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1821  peptidase M24  30.89 
 
 
454 aa  170  6e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0438992  hitchhiker  0.0000000354037 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0966  aminopeptidase P  30.59 
 
 
442 aa  169  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.309482  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1782  peptidase M24  29 
 
 
461 aa  166  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000518902  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2777  aminopeptidase P  29.57 
 
 
436 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1711  peptidase M24  28.9 
 
 
434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000229951  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2146  aminopeptidase P  29.78 
 
 
439 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0848  peptidase M24B X-Pro dipeptidase/aminopeptidase domain-containing protein  30.59 
 
 
442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.283134  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3502  peptidase M24  29.81 
 
 
443 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3757  peptidase M24  29.59 
 
 
435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.390253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5223  Xaa-Pro aminopeptidase  28.82 
 
 
444 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1873  peptidase M24  27.97 
 
 
458 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3277  peptidase M24  30.52 
 
 
442 aa  162  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.609187  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2399  peptidase M24  29.79 
 
 
435 aa  162  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.320532  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2334  putative XAA-Pro aminopeptidase  30.26 
 
 
433 aa  161  2e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.544372 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1271  Xaa-Pro aminopeptidase  29.18 
 
 
461 aa  161  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4599  aminopeptidase P  29.2 
 
 
436 aa  160  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1485  peptidase M24  28.98 
 
 
413 aa  160  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0254  putative Xaa-Pro aminopeptidase (aminopeptidase P II) protein  29.92 
 
 
454 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15611  putative aminopeptidase P  29.72 
 
 
439 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2176  aminopeptidase P  30.44 
 
 
426 aa  156  9e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.408367 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62767  X-Pro dipeptidase  28.51 
 
 
475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.106037 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00832  peptidase D, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G14920)  28.57 
 
 
469 aa  154  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.06769  normal  0.708956 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2358  peptidase M24  30.41 
 
 
439 aa  154  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000327517  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0973  aminopeptidase P  28.9 
 
 
439 aa  152  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0091  hypothetical protein  28.24 
 
 
436 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0075  aminopeptidase P  30.09 
 
 
437 aa  152  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.819876  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18411  putative aminopeptidase P  28.69 
 
 
439 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.502832 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0079  hypothetical protein  28.24 
 
 
436 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1577  peptidase M24  28.93 
 
 
455 aa  151  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3935  peptidase M24  29.54 
 
 
436 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3343  peptidase M24  29.54 
 
 
414 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00849  proline aminopeptidase P II  34.78 
 
 
437 aa  149  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2806  peptidase M24  28.69 
 
 
416 aa  149  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.275182  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3337  peptidase M24  28.63 
 
 
499 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.106603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>