155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5036 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  100 
 
 		 305 aa  626  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  67.87 
 
 		 305 aa  414  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  55.22 
 
 		 303 aa  340  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  52 
 
 		 308 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  50.67 
 
 		 315 aa  319  3e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  50 
 
 		 318 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  50.33 
 
 		 308 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  48.36 
 
 		 306 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1264  hypothetical protein  46.86 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.021109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  50.5 
 
 		 303 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4469  hypothetical protein  49.34 
 
 		 306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476961  normal  0.842377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4007  hypothetical protein  49.01 
 
 		 306 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3788  hypothetical protein  47.37 
 
 		 306 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4580  hypothetical protein  47.37 
 
 		 306 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0477154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5725  hypothetical protein  47.37 
 
 		 306 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890183  normal  0.38929 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4064  hypothetical protein  46.53 
 
 		 306 aa  296  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0121  protein of unknown function UPF0187  50.17 
 
 		 303 aa  295  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6970  hypothetical protein  49.02 
 
 		 306 aa  295  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5683  hypothetical protein  50 
 
 		 306 aa  295  9e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.326794 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6441  hypothetical protein  50 
 
 		 306 aa  295  9e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549137 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  47.7 
 
 		 303 aa  294  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  47.37 
 
 		 306 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7068  hypothetical protein  49.02 
 
 		 306 aa  291  9e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.85763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0613  protein of unknown function UPF0187  45.07 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1420  hypothetical protein  48.69 
 
 		 306 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6409  hypothetical protein  48.69 
 
 		 306 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5402  hypothetical protein  49.34 
 
 		 306 aa  288  7e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145488  normal  0.0274711 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3838  hypothetical protein  47.85 
 
 		 303 aa  286  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.294262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  47.14 
 
 		 302 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  46.18 
 
 		 305 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1255  hypothetical protein  46.28 
 
 		 302 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288403  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2578  hypothetical protein  46.28 
 
 		 302 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0228  hypothetical protein  46.28 
 
 		 302 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0500  hypothetical protein  46.28 
 
 		 302 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1335  hypothetical protein  46.28 
 
 		 302 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1070  hypothetical protein  46.28 
 
 		 302 aa  279  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.55174  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1417  hypothetical protein  46.28 
 
 		 302 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  41.81 
 
 		 310 aa  263  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  42.35 
 
 		 308 aa  262  4.999999999999999e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  41.08 
 
 		 314 aa  256  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  44.88 
 
 		 306 aa  247  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  39.61 
 
 		 308 aa  245  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  41.56 
 
 		 321 aa  245  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  42.18 
 
 		 300 aa  244  9e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  38.64 
 
 		 309 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  39.32 
 
 		 304 aa  236  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  39.27 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  37.92 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  38.94 
 
 		 321 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  38.94 
 
 		 321 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  38.94 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  39.32 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  38.94 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  39.3 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  38.94 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  39.32 
 
 		 304 aa  233  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  37.71 
 
 		 308 aa  232  7.000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  38.82 
 
 		 315 aa  231  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  39.41 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  37.58 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  37.37 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  39.14 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  36.27 
 
 		 299 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  36.93 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  36.6 
 
 		 299 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  35.29 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  34.64 
 
 		 299 aa  210  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  38.51 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  37.25 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  34.64 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  36.03 
 
 		 305 aa  205  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0440  protein of unknown function UPF0187  37.84 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0368  hypothetical protein  36.73 
 
 		 306 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0400  protein of unknown function UPF0187  36.73 
 
 		 306 aa  196  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4016  hypothetical protein  34.67 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3117  protein of unknown function UPF0187  34.09 
 
 		 315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1301  hypothetical protein  35.21 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0943303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0922  hypothetical protein  33.79 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  33.9 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0993  hypothetical protein  33.8 
 
 		 290 aa  171  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000360463  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  32.57 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02585  hypothetical protein  37.7 
 
 		 286 aa  169  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0218  protein of unknown function UPF0187  35.11 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.920117  normal  0.0106107 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0221  protein of unknown function UPF0187  35.11 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  33 
 
 		 310 aa  167  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0608  protein of unknown function UPF0187  31.65 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.638552 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  32.76 
 
 		 287 aa  166  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3670  protein of unknown function UPF0187  32.6 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0078  protein of unknown function UPF0187  35.1 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.323458  hitchhiker  0.00334919 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0605  hypothetical protein  32.11 
 
 		 327 aa  162  5.0000000000000005e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0343991  normal  0.65798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5502  hypothetical protein  31.16 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0039  protein of unknown function UPF0187  34.56 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115525  normal  0.475905 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5054  hypothetical protein  31.14 
 
 		 295 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.399703  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  31.69 
 
 		 309 aa  152  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2549  protein of unknown function UPF0187  35.44 
 
 		 272 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3402  hypothetical protein  33.22 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.408916 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3315  hypothetical protein  31.37 
 
 		 318 aa  149  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.386659 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2717  protein of unknown function UPF0187  27.68 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0718878  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2042  protein of unknown function UPF0187  30.95 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0364314  hitchhiker  0.00398813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0277  protein of unknown function UPF0187  33.99 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>