272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5035 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 374 aa  770    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  59.67 
 
 		 378 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3806  FAD dependent oxidoreductase  57.64 
 
 		 375 aa  452  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.749975  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  55.43 
 
 		 375 aa  440  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10918  putative oxidoreductase  48.06 
 
 		 374 aa  335  7.999999999999999e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.183929  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3796  oxidoreductase  37.87 
 
 		 377 aa  246  4e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.204918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2035  FAD dependent oxidoreductase  38.65 
 
 		 379 aa  244  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3389  monooxygenase FAD-binding  29.72 
 
 		 392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1512  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 365 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.193117  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  27.59 
 
 		 368 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2674  FAD dependent oxidoreductase  26.4 
 
 		 443 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.680206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  24.79 
 
 		 384 aa  94  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3158  tryptophan halogenase  23.39 
 
 		 584 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000257719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  26.46 
 
 		 425 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3634  putative electron transfer oxidoreductase  28.47 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  25.27 
 
 		 424 aa  81.3  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  27.41 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  25.21 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  25.34 
 
 		 413 aa  76.3  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  23.43 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0420  hypothetical protein  21.54 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.299605 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  25.23 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  25.49 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  24.18 
 
 		 418 aa  73.9  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  28 
 
 		 374 aa  73.6  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  23.43 
 
 		 393 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1194  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 		 340 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.232264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  29.02 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  24.26 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  23.08 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  25 
 
 		 506 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  22.49 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  25.86 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  23.31 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  25.42 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2756  tryptophan halogenase  24.52 
 
 		 618 aa  69.3  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  26.27 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  25.31 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2333  FAD binding domain-containing protein  24.71 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  23.85 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  24.78 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18731  NAD binding site  22.97 
 
 		 385 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.413657 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0255  FAD dependent oxidoreductase  20.58 
 
 		 352 aa  67  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.794372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  23.62 
 
 		 415 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5142  monooxygenase, FAD-binding  25.08 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  25.71 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  25.94 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  23.5 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  23.56 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2051  2-octaprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase  23.9 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0991465  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  23.58 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  24.17 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4182  monooxygenase FAD-binding  25.78 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  24.92 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  21.83 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2102  monooxygenase FAD-binding  25.51 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  23.35 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  23.4 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  22.35 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  24.76 
 
 		 461 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  24.22 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0530  tryptophan halogenase  21.85 
 
 		 491 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.680136  normal  0.208224 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 376 aa  62  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1825  FAD dependent oxidoreductase  22.65 
 
 		 455 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.133963  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  22.87 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  26.45 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  25.23 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  23.73 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  21.72 
 
 		 431 aa  59.7  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  24.62 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  27.33 
 
 		 384 aa  58.9  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  24.36 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  21.54 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  21.74 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.95 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  26.32 
 
 		 365 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  21.94 
 
 		 457 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0327  geranylgeranyl reductase  27.6 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.252383  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0609  ubiquinone biosynthesis visC protein  25.48 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5951  monooxygenase FAD-binding protein  25.17 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  24.76 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  23.47 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  23.23 
 
 		 424 aa  57  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  22.91 
 
 		 378 aa  57  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  22.44 
 
 		 385 aa  57  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  22.7 
 
 		 455 aa  57  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  27.04 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  23.08 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  22.19 
 
 		 431 aa  56.2  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0390  FAD-binding monooxygenase  24.39 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  23.49 
 
 		 406 aa  56.2  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  22.84 
 
 		 444 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  29.41 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  22.36 
 
 		 431 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  25.16 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0788  non-heme halogenase, putative  22.15 
 
 		 439 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.702938  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0114  FAD dependent oxidoreductase  23.4 
 
 		 399 aa  55.1  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00154267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  25.16 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0931  tryptophan halogenase  22.15 
 
 		 439 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>