147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4979 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  100 
 
 		 1418 aa  2883    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1308  APHP domain-containing protein  44.32 
 
 		 1085 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0025589  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  33.46 
 
 		 981 aa  361  7e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.64 
 
 		 1410 aa  235  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  30.07 
 
 		 1213 aa  218  5.9999999999999996e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  30.6 
 
 		 1091 aa  216  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1017  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.96 
 
 		 584 aa  199  4.0000000000000005e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  27.02 
 
 		 1000 aa  188  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.94 
 
 		 1212 aa  188  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  28.28 
 
 		 1200 aa  171  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7012  hypothetical protein  30.9 
 
 		 675 aa  162  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.342221  hitchhiker  0.00752546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.28 
 
 		 1448 aa  160  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4658  mycodextranase  28.85 
 
 		 671 aa  159  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.69 
 
 		 933 aa  156  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  40.16 
 
 		 1275 aa  152  3e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.14 
 
 		 1109 aa  153  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.61 
 
 		 823 aa  146  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301567  normal  0.394151 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  39.47 
 
 		 1223 aa  141  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  40.84 
 
 		 1002 aa  139  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  40.84 
 
 		 1585 aa  138  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  40.84 
 
 		 1247 aa  138  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  40.84 
 
 		 1217 aa  138  9e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  40.84 
 
 		 1474 aa  138  9e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  35.42 
 
 		 1748 aa  119  6e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  39.71 
 
 		 1160 aa  114  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  31.55 
 
 		 626 aa  97.8  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  31.6 
 
 		 1495 aa  96.3  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  35.26 
 
 		 1020 aa  94.7  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  30.45 
 
 		 1018 aa  90.5  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  32.47 
 
 		 1059 aa  89.4  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  32.81 
 
 		 1059 aa  89.4  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  51.33 
 
 		 1821 aa  89  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  31.82 
 
 		 1050 aa  87  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  41.67 
 
 		 1009 aa  77.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  34.46 
 
 		 1041 aa  77.8  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  50.57 
 
 		 556 aa  75.9  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  56 
 
 		 1048 aa  73.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  44.71 
 
 		 1732 aa  72.8  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  45.26 
 
 		 2638 aa  70.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0643  Carbohydrate-binding family 9  26.09 
 
 		 215 aa  70.1  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3488  Ig domain protein group 2 domain protein  48.72 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3463  Carbohydrate-binding family 9  26.19 
 
 		 691 aa  69.3  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0207696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  28.93 
 
 		 2286 aa  69.3  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  40.15 
 
 		 1771 aa  68.6  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  24.75 
 
 		 1780 aa  68.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  39.43 
 
 		 969 aa  67  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  40 
 
 		 868 aa  67  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03943  hypothetical protein  33.9 
 
 		 253 aa  67  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1715  Endo-1,4-beta-xylanase  30.81 
 
 		 1037 aa  66.6  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000895355  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3694  hypothetical protein  33.6 
 
 		 275 aa  66.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  39.13 
 
 		 868 aa  66.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3677  FG-GAP repeat-containing protein  39.29 
 
 		 639 aa  65.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.431632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  27.88 
 
 		 1657 aa  65.5  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  43.01 
 
 		 868 aa  63.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  49.4 
 
 		 1226 aa  62  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2669  Carbohydrate-binding family 9  32.16 
 
 		 535 aa  61.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3136  hypothetical protein  34.78 
 
 		 244 aa  61.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.030981  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1988  hypothetical protein  52.54 
 
 		 554 aa  61.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00985126  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  38.78 
 
 		 220 aa  61.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  38.2 
 
 		 1831 aa  60.5  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0697  hypothetical protein  49.3 
 
 		 564 aa  60.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000189598  hitchhiker  0.0000524761 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  36.61 
 
 		 867 aa  60.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  45.24 
 
 		 526 aa  60.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  36.61 
 
 		 868 aa  60.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  37.58 
 
 		 437 aa  60.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  34.21 
 
 		 985 aa  59.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1252  Endo-1,4-beta-xylanase  27.27 
 
 		 1019 aa  59.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.104467 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  27.66 
 
 		 1215 aa  59.3  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  35.71 
 
 		 868 aa  59.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0086  hypothetical protein  43.9 
 
 		 248 aa  59.3  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  35.71 
 
 		 868 aa  59.3  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  42.55 
 
 		 833 aa  58.5  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3388  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  34.57 
 
 		 1022 aa  58.2  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  31.11 
 
 		 576 aa  57.8  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0886  hypothetical protein  35.4 
 
 		 631 aa  56.6  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.57162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  34.26 
 
 		 748 aa  56.2  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2198  phage tail protein  45.35 
 
 		 306 aa  56.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2341  agarase  35.83 
 
 		 1171 aa  55.8  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384937  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  33.64 
 
 		 972 aa  55.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  29.11 
 
 		 1331 aa  55.8  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  34.82 
 
 		 869 aa  55.1  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  28.3 
 
 		 848 aa  55.5  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2224  PKD domain-containing protein  38.46 
 
 		 460 aa  54.3  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  45.16 
 
 		 1004 aa  55.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  36.61 
 
 		 820 aa  54.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  36.59 
 
 		 4013 aa  53.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1308  hypothetical protein  33.63 
 
 		 414 aa  54.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2474  hypothetical protein  37.61 
 
 		 826 aa  53.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1232  PKD domain-containing protein  38.61 
 
 		 2706 aa  54.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.73 
 
 		 1146 aa  53.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  39.02 
 
 		 1300 aa  53.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3715  hypothetical protein  28.46 
 
 		 259 aa  52.8  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.937408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0625  PE-PGRS family protein  41.94 
 
 		 665 aa  52.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215384  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  42.68 
 
 		 1937 aa  52.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  42.68 
 
 		 1467 aa  52.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  27.27 
 
 		 1141 aa  52.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  32.06 
 
 		 746 aa  51.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2571  Ig domain protein group 2 domain protein  42.25 
 
 		 942 aa  50.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  37.59 
 
 		 1011 aa  50.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>