225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4967 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4967  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 185 aa  385  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110994  normal  0.179343 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4313  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 600 aa  126  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  32.22 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  32.22 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 205 aa  101  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 188 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 188 aa  99  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 193 aa  99  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0834  transcriptional regulator  32.95 
 
 		 189 aa  98.2  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0575081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  28.34 
 
 		 195 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 194 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 188 aa  94.7  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  94.7  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 188 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 188 aa  91.7  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 191 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 193 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 201 aa  88.2  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4262  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 196 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 188 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 187 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4685  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 189 aa  84.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.26494  hitchhiker  0.000674431 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 179 aa  84.7  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 187 aa  84.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4267  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  27.65 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1966  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 188 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.273818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 216 aa  77.8  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1689  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 195 aa  77.8  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  36.52 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 192 aa  77.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2297  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.299638  hitchhiker  0.00738055 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4676  transcriptional regulator, TetR family  28.15 
 
 		 190 aa  72  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 188 aa  71.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4127  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0300  transcriptional regulator, TetR family  38.05 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000186865  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3422  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7851  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1790  transcriptional regulator of TetR family protein  26.16 
 
 		 176 aa  64.3  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  24.4 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  28.41 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1797  TetR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0497705  normal  0.0268872 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  27.82 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1991  transcriptional regulator, TetR family  21.76 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000115862  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1841  transcriptional regulator, TetR family  21.76 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.170954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  21.35 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1726  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.716564  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  21.33 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1980  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00264568  hitchhiker  0.00106159 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  21.54 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2361  transcriptional regulator, TetR family  22.35 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000141293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 225 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1549  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 199 aa  54.3  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0178403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  20.35 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1860  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0204447  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  20.95 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 194 aa  51.6  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  21.02 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3574  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  21.94 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  19.41 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  25.27 
 
 		 287 aa  49.3  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  19.41 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  19.41 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>