More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4939 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 406 aa  815    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  70.69 
 
 		 406 aa  608  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  54.93 
 
 		 406 aa  476  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  46.44 
 
 		 406 aa  379  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  47.04 
 
 		 405 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  45.72 
 
 		 409 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  47.92 
 
 		 408 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  48.03 
 
 		 402 aa  363  2e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  45.23 
 
 		 409 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  45.61 
 
 		 409 aa  360  2e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  49.88 
 
 		 409 aa  360  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  49.63 
 
 		 409 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  48.01 
 
 		 409 aa  353  4e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  43.39 
 
 		 715 aa  353  4e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  48.63 
 
 		 409 aa  349  4e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  43.78 
 
 		 401 aa  338  8e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  47.06 
 
 		 409 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  42.26 
 
 		 406 aa  334  1e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  40.8 
 
 		 401 aa  332  6e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  42.59 
 
 		 707 aa  332  9e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  42.12 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  42.12 
 
 		 402 aa  330  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  44.33 
 
 		 404 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  42.68 
 
 		 402 aa  328  7e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  45.32 
 
 		 405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  43.83 
 
 		 653 aa  327  2.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  42.42 
 
 		 400 aa  325  7e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  42.54 
 
 		 658 aa  322  7e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  41.04 
 
 		 400 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  45.59 
 
 		 406 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  40.55 
 
 		 403 aa  321  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  40.49 
 
 		 405 aa  319  7e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  44.55 
 
 		 670 aa  318  1e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  40.84 
 
 		 402 aa  317  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  44.03 
 
 		 403 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  43.9 
 
 		 408 aa  315  9e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  42.14 
 
 		 401 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  38.03 
 
 		 456 aa  311  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  44.08 
 
 		 657 aa  311  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  40.55 
 
 		 400 aa  311  2e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  42.39 
 
 		 401 aa  310  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  42.39 
 
 		 401 aa  310  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  39.6 
 
 		 403 aa  310  4e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  43.58 
 
 		 656 aa  308  9e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  39.37 
 
 		 411 aa  301  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  43.95 
 
 		 671 aa  299  6e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  40.2 
 
 		 412 aa  298  9e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2608  hypothetical protein  41.75 
 
 		 411 aa  295  8e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  40.75 
 
 		 400 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2149  hypothetical protein  39.7 
 
 		 402 aa  293  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  40.5 
 
 		 400 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  42.51 
 
 		 409 aa  291  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  39.34 
 
 		 454 aa  291  1e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  41.98 
 
 		 653 aa  291  2e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  42.3 
 
 		 405 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  41.98 
 
 		 661 aa  290  3e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  41.06 
 
 		 657 aa  290  4e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  41.81 
 
 		 657 aa  289  7e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  38.93 
 
 		 443 aa  287  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  42.28 
 
 		 415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  36.57 
 
 		 647 aa  281  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  41.32 
 
 		 405 aa  280  3e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  41.65 
 
 		 644 aa  280  5e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  40.73 
 
 		 405 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  38.73 
 
 		 651 aa  276  6e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  38.44 
 
 		 409 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  41.34 
 
 		 407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  37.31 
 
 		 409 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  35.15 
 
 		 649 aa  272  8.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  41.81 
 
 		 405 aa  272  9e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  41.11 
 
 		 409 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  39.32 
 
 		 410 aa  271  2e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  35.89 
 
 		 650 aa  269  8e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  37.23 
 
 		 409 aa  267  2.9999999999999995e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  39.04 
 
 		 681 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  40.87 
 
 		 391 aa  266  5e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  39.04 
 
 		 681 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  38.35 
 
 		 410 aa  266  5.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2039  hypothetical protein  39.15 
 
 		 403 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  39.01 
 
 		 410 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  42.14 
 
 		 650 aa  265  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  39.01 
 
 		 410 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  40.38 
 
 		 417 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.75 
 
 		 678 aa  262  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  35.75 
 
 		 678 aa  262  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  35.75 
 
 		 678 aa  262  8.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  38.14 
 
 		 405 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  38.14 
 
 		 405 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  38.52 
 
 		 398 aa  260  3e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1452  hypothetical protein  39.66 
 
 		 410 aa  260  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  37.53 
 
 		 652 aa  260  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  36.78 
 
 		 653 aa  259  8e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  38.04 
 
 		 687 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  37 
 
 		 642 aa  258  2e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  36.54 
 
 		 409 aa  257  3e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  37.68 
 
 		 394 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  37.28 
 
 		 653 aa  255  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  37.28 
 
 		 653 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  37.28 
 
 		 653 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  38.88 
 
 		 405 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>