More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4835 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4835  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
273 aa  566  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000227026 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60 
 
 
267 aa  330  1e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.38 
 
 
265 aa  296  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4320  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.06 
 
 
266 aa  280  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.0308076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3645  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.38 
 
 
268 aa  278  9e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.81 
 
 
268 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.31 
 
 
268 aa  267  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.99 
 
 
268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.122827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6701  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.61 
 
 
271 aa  238  9e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.9 
 
 
272 aa  232  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.59 
 
 
272 aa  210  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.07 
 
 
271 aa  207  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0362247 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1020  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.63 
 
 
273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0196176  normal  0.613777 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.53 
 
 
282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.556145  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.67 
 
 
272 aa  183  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000075991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4362  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.28 
 
 
274 aa  152  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.236839  normal  0.0715195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
281 aa  152  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243534  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0526  short chain dehydrogenase  43.17 
 
 
279 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928222  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
289 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.137743 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7087  short chain dehydrogenase  37.44 
 
 
284 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 
279 aa  149  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1038  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.43 
 
 
247 aa  148  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00179214  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.43 
 
 
247 aa  148  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.505512  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28960  Short-chain dehydrogenase/reductase, SDR family  36.8 
 
 
244 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1064  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.84 
 
 
247 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104553  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0206  short chain dehydrogenase  31.62 
 
 
284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3386  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
278 aa  147  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.314719  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4789  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.73 
 
 
293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.47 
 
 
275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.274606 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0983  short chain dehydrogenase  33.7 
 
 
277 aa  146  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.622863  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4247  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1249  short chain dehydrogenase  34.21 
 
 
279 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1406  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.77 
 
 
267 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615665  normal  0.271714 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4288  short chain dehydrogenase  32.95 
 
 
287 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.861996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.21 
 
 
295 aa  143  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 
271 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1025  short chain dehydrogenase  36.52 
 
 
274 aa  142  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.150864  normal  0.667254 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3999  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 
292 aa  142  9e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0909  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.34519  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3237  short chain dehydrogenase  39.89 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.996911 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  35.18 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0982  short chain dehydrogenase  42.16 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6770  short chain dehydrogenase  40.43 
 
 
276 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  37.23 
 
 
303 aa  138  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.79 
 
 
242 aa  138  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1248  short chain dehydrogenase  35.61 
 
 
282 aa  138  8.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.6 
 
 
271 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0040  short chain dehydrogenase  31.82 
 
 
283 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262261  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 
245 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  33.99 
 
 
272 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.880623  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
249 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.184253  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0029  short chain dehydrogenase  30.8 
 
 
278 aa  136  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148269  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4296  short chain dehydrogenase  32.71 
 
 
280 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1825  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
278 aa  136  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.356255  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12080  short-chain alcohol dehydrogenase  32.66 
 
 
266 aa  136  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4560  short chain dehydrogenase  37.95 
 
 
280 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0967831  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  31.15 
 
 
283 aa  135  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.15 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.97 
 
 
300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  34.55 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.11 
 
 
286 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.21 
 
 
273 aa  133  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1861  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  33.7 
 
 
270 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0952097  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  34.24 
 
 
286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0065  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  36.33 
 
 
274 aa  132  5e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2109  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 
248 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7039  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 
275 aa  132  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0246661  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0756  short chain dehydrogenase  37.2 
 
 
274 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.624051 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6332  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.526934  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0762  short chain dehydrogenase  38.95 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0776  short chain dehydrogenase  38.95 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03890  short chain dehydrogenase  31.94 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564594  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 
317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2942  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.07 
 
 
276 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.25 
 
 
314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3333  short chain dehydrogenase  37.81 
 
 
280 aa  129  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.87 
 
 
247 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.12368  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.38 
 
 
275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
273 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.25 
 
 
276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0843  short chain dehydrogenase  32.17 
 
 
275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.767433  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.58 
 
 
285 aa  128  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.103253 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3361  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
249 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
249 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl172  dehydrogenase  37.37 
 
 
279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2717  short chain dehydrogenase  33.08 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3541  short chain dehydrogenase  32.71 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100637  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1176  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1744  short chain dehydrogenase  38.38 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.324234  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.45 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0069  Short-chain dehydrogenase of various substrate specificities  32.1 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.367303  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.34 
 
 
275 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  34.87 
 
 
286 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1384  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 
249 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.95107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.89 
 
 
281 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>