55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4822 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4822  glycosyl hydrolase 38 domain protein  100 
 
 		 830 aa  1723    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000118458  hitchhiker  0.00000000000299684 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0848  glycosy hydrolase family protein  20.18 
 
 		 1022 aa  90.1  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.553553  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4232  glycosyl hydrolase 38 domain protein  20.54 
 
 		 1049 aa  87.8  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1434  Alpha-mannosidase  24.78 
 
 		 1057 aa  87  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.070535  normal  0.0215856 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1096  Alpha-mannosidase  20 
 
 		 1044 aa  85.5  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2851  Alpha-mannosidase  25.44 
 
 		 1061 aa  85.9  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14420  Alpha-mannosidase  21.6 
 
 		 1048 aa  85.1  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1628  glycoside hydrolase family protein  22.62 
 
 		 1032 aa  84.7  0.000000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0841  alpha-mannosidase 2c1  19.73 
 
 		 1022 aa  83.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1501  glycoside hydrolase family 38  22.47 
 
 		 1076 aa  82.4  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3122  glycosyl hydrolases 38-like  25.09 
 
 		 1147 aa  81.6  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2337  alpha-mannosidase  21.93 
 
 		 1044 aa  80.9  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4785  glycoside hydrolase family 38  22.01 
 
 		 1008 aa  80.9  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.470761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3007  alpha-mannosidase  21.8 
 
 		 1055 aa  80.9  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.799127 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4705  glycoside hydrolase family 38  22.61 
 
 		 1008 aa  79.7  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1084  glycoside hydrolase family protein  30.1 
 
 		 1398 aa  80.1  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.503572  normal  0.0341362 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3665  glycosyl hydrolase 38 domain protein  20.54 
 
 		 1059 aa  78.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2049  alpha-mannosidase  21.37 
 
 		 1044 aa  77.8  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1191  glycoside hydrolase family protein  28.62 
 
 		 1398 aa  75.9  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.143545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10661  alpha-mannosidase  22.84 
 
 		 1398 aa  75.1  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000236587  normal  0.132856 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1720  glycoside hydrolase family protein  23.03 
 
 		 1043 aa  74.7  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0981  glycoside hydrolase family protein  23.39 
 
 		 1374 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.239974  normal  0.147978 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0722  glycoside hydrolase family protein  20.03 
 
 		 1022 aa  73.2  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0963  glycoside hydrolase family protein  23.39 
 
 		 1374 aa  73.2  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4452  glycoside hydrolase family protein  21.18 
 
 		 1058 aa  73.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4998  Alpha-mannosidase-like protein  28.01 
 
 		 1408 aa  73.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.610774  normal  0.702636 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1924  alpha-mannosidase  19.58 
 
 		 1040 aa  72.8  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.831395  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5104  glycoside hydrolase family protein  26.73 
 
 		 1378 aa  71.2  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0747946 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2051  Alpha-mannosidase  22.87 
 
 		 1063 aa  70.5  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3666  Alpha-mannosidase  20.3 
 
 		 1034 aa  69.3  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.555262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2444  glycosyl hydrolase 38 domain protein  20.56 
 
 		 1034 aa  68.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7446  alpha-D-mannosidase  21.16 
 
 		 1028 aa  67.8  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2864  Alpha-mannosidase  22.49 
 
 		 1062 aa  66.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.266249 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3192  glycosyl hydrolases 38-like  19.97 
 
 		 1095 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00253204 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1249  glycoside hydrolase family protein  24.74 
 
 		 1371 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324048 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0697  glycosyl hydrolase 38 domain protein  21.64 
 
 		 1037 aa  65.9  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.03662  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15000  alpha-mannosidase  19.86 
 
 		 870 aa  64.3  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303353  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1345  glycoside hydrolase family 38  24.09 
 
 		 1465 aa  64.3  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.326956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1503  glycoside hydrolase family 38  19.33 
 
 		 820 aa  63.9  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2057  Alpha-mannosidase  20.86 
 
 		 1042 aa  62.8  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.196818  normal  0.623087 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1758  Alpha-mannosidase  18.35 
 
 		 1032 aa  59.7  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1703  putative alpha-mannosidase  27.74 
 
 		 1025 aa  58.2  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.114569  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06750  alpha-mannosidase, putative  21.86 
 
 		 1147 aa  55.8  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.854831  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0189  alpha-mannosidase  21.72 
 
 		 1046 aa  55.1  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.398697  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0991  glycoside hydrolase family protein  23.35 
 
 		 1368 aa  55.1  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7334  alpha-D-mannosidase  25.27 
 
 		 1007 aa  53.9  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14830  alpha-mannosidase  21.37 
 
 		 1002 aa  53.5  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0345511 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0965  glycoside hydrolase family protein  20.66 
 
 		 1010 aa  52  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.272944  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1049  glycosyl hydrolase family 38 N-terminal domain protein  19.36 
 
 		 1044 aa  49.7  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02936  Alpha-mannosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13344]  20.66 
 
 		 1095 aa  50.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0191  alpha-mannosidase  22.6 
 
 		 958 aa  49.3  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.690014  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2136  glycoside hydrolase family 38  22.54 
 
 		 1003 aa  47  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1011  glycoside hydrolase family protein  19.95 
 
 		 988 aa  47  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0892535  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0948  glycoside hydrolase family protein  20.98 
 
 		 1010 aa  45.8  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0188  alpha-mannosidase  22.89 
 
 		 1039 aa  45.4  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>