More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4818 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 486 aa  1006    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  37.03 
 
 		 499 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  36.96 
 
 		 506 aa  248  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  33.27 
 
 		 499 aa  232  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  35.32 
 
 		 477 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  32.84 
 
 		 541 aa  215  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  32.07 
 
 		 493 aa  207  3e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  32.55 
 
 		 513 aa  199  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  32.75 
 
 		 511 aa  197  5.000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  34.9 
 
 		 508 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  32.15 
 
 		 487 aa  193  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  32.99 
 
 		 494 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  30.65 
 
 		 494 aa  187  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  29.82 
 
 		 506 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  29.49 
 
 		 488 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  31.38 
 
 		 483 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  30.06 
 
 		 494 aa  172  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  29.94 
 
 		 511 aa  170  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  29.89 
 
 		 520 aa  169  9e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  31.19 
 
 		 502 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  29.16 
 
 		 478 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  31.37 
 
 		 479 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  30.74 
 
 		 476 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  30.95 
 
 		 486 aa  163  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  27.74 
 
 		 500 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  30.84 
 
 		 514 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  28.9 
 
 		 495 aa  159  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  32.67 
 
 		 514 aa  157  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  29.4 
 
 		 477 aa  156  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  27.66 
 
 		 504 aa  156  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  29.61 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  28.6 
 
 		 491 aa  154  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  29.45 
 
 		 576 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  29.71 
 
 		 481 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  27.67 
 
 		 497 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  28.65 
 
 		 505 aa  149  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  30.92 
 
 		 507 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  27.01 
 
 		 511 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  28.71 
 
 		 523 aa  148  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  28.6 
 
 		 570 aa  147  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  28.46 
 
 		 507 aa  146  7.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  30.69 
 
 		 503 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  29.62 
 
 		 501 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  31.46 
 
 		 511 aa  144  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  27.52 
 
 		 461 aa  143  7e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 592 aa  143  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  27.53 
 
 		 594 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  30.24 
 
 		 522 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 592 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  27.94 
 
 		 483 aa  141  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  28.5 
 
 		 588 aa  139  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  27.62 
 
 		 499 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  30.31 
 
 		 480 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 448 aa  136  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  26.56 
 
 		 470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  28.28 
 
 		 531 aa  134  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  29.45 
 
 		 549 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  28.26 
 
 		 488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  26.64 
 
 		 511 aa  131  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 489 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  27.56 
 
 		 460 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  26.41 
 
 		 582 aa  127  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  28.29 
 
 		 471 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  27.04 
 
 		 498 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  26.26 
 
 		 519 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  28.23 
 
 		 519 aa  124  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 		 447 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  28.09 
 
 		 490 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  28.01 
 
 		 603 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  26.13 
 
 		 503 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 485 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  28.48 
 
 		 498 aa  121  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  26.45 
 
 		 531 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  27.5 
 
 		 478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  28.63 
 
 		 497 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  25.2 
 
 		 457 aa  120  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  27.36 
 
 		 476 aa  120  6e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  27.33 
 
 		 458 aa  119  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3283  RagB/SusD domain protein  28.63 
 
 		 579 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 579 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  26.41 
 
 		 601 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  27.98 
 
 		 531 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  27.12 
 
 		 492 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  26.32 
 
 		 598 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 512 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  25.7 
 
 		 549 aa  116  8.999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  28.14 
 
 		 531 aa  116  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  26.93 
 
 		 456 aa  113  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 613 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  28.27 
 
 		 495 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  25.5 
 
 		 527 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 522 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  26.91 
 
 		 511 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 490 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  25.24 
 
 		 481 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  24.34 
 
 		 592 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  29.04 
 
 		 447 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  25.35 
 
 		 521 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 		 582 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>