More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4814 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1298  TonB-dependent receptor  41.01 
 
 		 929 aa  707    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0684189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4814  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 1025 aa  2089    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0976743  unclonable  0.000000000000101535 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2243  TonB-dependent receptor  42.34 
 
 		 913 aa  701    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1124  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 953 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.223448  hitchhiker  0.00360467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1109 aa  432  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  30.06 
 
 		 1123 aa  426  1e-118  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2241  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 1027 aa  425  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.122093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3406  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 1006 aa  423  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3877  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 1036 aa  416  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 1029 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4812  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 1018 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000883537  unclonable  0.000000000000117998 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  27.91 
 
 		 1094 aa  377  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 1033 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5521  TonB-dependent receptor plug  28.71 
 
 		 1130 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000129215  normal  0.0524869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 1056 aa  366  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2722  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 1045 aa  365  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3875  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 937 aa  360  6e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 1081 aa  354  5.9999999999999994e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 		 1062 aa  350  7e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1121  TonB-dependent receptor plug  28.05 
 
 		 1145 aa  348  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 1144 aa  335  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1086 aa  330  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 1047 aa  329  2.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4637  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 1061 aa  329  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0127859  normal  0.0510805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 1176 aa  325  3e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4101  TonB-dependent receptor plug  27.39 
 
 		 1068 aa  324  6e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 1095 aa  320  9e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 1026 aa  320  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 1138 aa  319  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 1038 aa  317  9e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5835  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 1033 aa  316  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880431  normal  0.557328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1036 aa  314  4.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  28.15 
 
 		 1161 aa  308  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 1095 aa  307  6e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2299  TonB-dependent receptor plug  27.55 
 
 		 1056 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.531432  normal  0.0856053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 1086 aa  304  7.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  26.85 
 
 		 1148 aa  303  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0566  TonB-dependent receptor plug  27.05 
 
 		 1043 aa  303  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00250412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2530  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 1146 aa  299  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 1046 aa  297  5e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1488  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 1056 aa  295  4e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  26.69 
 
 		 1079 aa  292  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 1168 aa  290  9e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  26.78 
 
 		 1155 aa  288  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2101  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 		 1038 aa  288  4e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.693236  normal  0.298537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6448  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 1130 aa  288  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 1055 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1020  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 917 aa  286  2.0000000000000002e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.111548  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1773  TonB-dependent receptor plug  26.1 
 
 		 1013 aa  285  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.27129 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  26.82 
 
 		 1181 aa  284  6.000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 1132 aa  284  7.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 1049 aa  282  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  26.78 
 
 		 1066 aa  278  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1064 aa  276  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 1177 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  28.58 
 
 		 1128 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 1024 aa  272  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  25.92 
 
 		 1026 aa  271  5.9999999999999995e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 1127 aa  266  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  25.18 
 
 		 1036 aa  266  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  26.01 
 
 		 1036 aa  265  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  25.64 
 
 		 1077 aa  265  4e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  26.13 
 
 		 1028 aa  265  4.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  26.41 
 
 		 1039 aa  264  6e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4287  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 1065 aa  263  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2667  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 1093 aa  262  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0190872  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  25.46 
 
 		 1114 aa  262  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  24.84 
 
 		 1060 aa  261  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 1008 aa  261  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 		 1192 aa  258  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 1128 aa  258  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 1050 aa  257  6e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  25.14 
 
 		 1052 aa  257  7e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 1037 aa  257  7e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 1137 aa  257  9e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  26.2 
 
 		 1124 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  24.8 
 
 		 1128 aa  255  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 		 1053 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  24.73 
 
 		 1074 aa  254  6e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 1117 aa  254  7e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  25.09 
 
 		 1023 aa  254  8.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1683  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 1045 aa  253  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.125257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  26.31 
 
 		 1097 aa  253  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  26.25 
 
 		 1116 aa  252  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 989 aa  250  8e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  25.14 
 
 		 1096 aa  250  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  26.11 
 
 		 1043 aa  248  4e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 1040 aa  247  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  26.3 
 
 		 1154 aa  247  9e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  25.87 
 
 		 1023 aa  246  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 979 aa  244  6e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 1011 aa  243  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  25.88 
 
 		 1041 aa  243  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  25.04 
 
 		 1085 aa  241  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  25.47 
 
 		 1062 aa  241  6.999999999999999e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  24.49 
 
 		 1084 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  25.59 
 
 		 1081 aa  239  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  24.82 
 
 		 1023 aa  239  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  25.64 
 
 		 1003 aa  238  6e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  25.14 
 
 		 1139 aa  237  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>