More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4807 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4807  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 466 aa  920    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000796608 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.68 
 
 		 527 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.94 
 
 		 487 aa  161  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.74 
 
 		 498 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 494 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.05 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 483 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  28.54 
 
 		 475 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  28.4 
 
 		 497 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.7 
 
 		 490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.81 
 
 		 487 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.27 
 
 		 509 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  26.16 
 
 		 498 aa  147  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00880  sugar phosphate permease  28.71 
 
 		 458 aa  147  5e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.34 
 
 		 474 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3647  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.12 
 
 		 486 aa  143  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.04243 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2069  major facilitator superfamily permease  29.83 
 
 		 440 aa  144  5e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0103  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 470 aa  143  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.360848  hitchhiker  0.000281581 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.07 
 
 		 500 aa  143  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.89 
 
 		 763 aa  141  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1434  MFS family transporter  30.12 
 
 		 452 aa  140  3.9999999999999997e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.95 
 
 		 478 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1374  multidrug resistance protein B  30.02 
 
 		 452 aa  140  6e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.394355  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.75 
 
 		 553 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.8 
 
 		 487 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 		 477 aa  139  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.14 
 
 		 504 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  27.21 
 
 		 489 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.1 
 
 		 502 aa  137  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.22 
 
 		 788 aa  136  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4704  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 		 478 aa  136  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.43 
 
 		 477 aa  136  8e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.48 
 
 		 514 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.18 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.81 
 
 		 522 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 485 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 490 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.36 
 
 		 529 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.98 
 
 		 508 aa  134  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7465  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 474 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1815  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 		 448 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.39624  normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2475  major facilitator transporter  28.43 
 
 		 468 aa  133  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.91 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.92 
 
 		 458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4643  putative multidrug resistance protein  28.97 
 
 		 537 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00119486  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0059  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.976428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.91 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.91 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.24 
 
 		 539 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1149  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0695  putative multidrug resistance protein  28.97 
 
 		 537 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0299481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.96 
 
 		 493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.37 
 
 		 488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.73 
 
 		 478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.6 
 
 		 485 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.12 
 
 		 482 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.91 
 
 		 486 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.91 
 
 		 486 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.87 
 
 		 541 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.21 
 
 		 458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.12 
 
 		 482 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.91 
 
 		 486 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.37 
 
 		 469 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3405  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 471 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00287902  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.39 
 
 		 579 aa  131  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.79 
 
 		 478 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.1 
 
 		 484 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.77 
 
 		 537 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  29 
 
 		 510 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 491 aa  130  6e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3373  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 482 aa  130  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0630  multidrug-efflux transporter  28.28 
 
 		 476 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0118993  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5418  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.36 
 
 		 583 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.97043  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0574  multidrug resistance protein B; sugar (and other) transporter  28.28 
 
 		 537 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0573  multidrug-efflux transporter  28.28 
 
 		 537 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0295676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7521  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 492 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011773  BCAH820_0720  putative multidrug resistance protein  28.28 
 
 		 537 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55065e-20 
 
 
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NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  25.48 
 
 		 503 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.31 
 
 		 504 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.08 
 
 		 528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
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NC_013739  Cwoe_5556  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.14 
 
 		 489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798171  normal  1 
 
 
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NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.08 
 
 		 532 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal  1 
 
 
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NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_23710  arabinose efflux permease family protein  29.02 
 
 		 469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.277036 
 
 
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NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0792  putative multidrug resistance protein  28.28 
 
 		 537 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000149033  n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_1125  drug resistance transporter, EmrB/QacA family protein  29.85 
 
 		 462 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.78 
 
 		 478 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
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NC_007492  Pfl01_2726  major facilitator transporter  32.13 
 
 		 484 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011832  Mpal_1781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.43 
 
 		 483 aa  128  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.787219  normal  1 
 
 
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NC_011883  Ddes_0194  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 523 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  29.31 
 
 		 530 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
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NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  27.76 
 
 		 504 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
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NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  28.02 
 
 		 553 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  28.02 
 
 		 582 aa  127  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 483 aa  127  5e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
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NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.07 
 
 		 505 aa  127  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  26.73 
 
 		 495 aa  126  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
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NC_007796  Mhun_1950  major facilitator transporter  29.33 
 
 		 461 aa  127  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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