More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4797 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4797  ThiJ/PfpI domain protein  100 
 
 
223 aa  457  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  hitchhiker  0.0019745 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3190  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.75 
 
 
237 aa  187  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.687105  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5032  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.29 
 
 
237 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.848966 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  43.05 
 
 
230 aa  185  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  41.26 
 
 
227 aa  167  9e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4294  ThiJ/PfpI domain protein  42.27 
 
 
224 aa  167  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  38.29 
 
 
221 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  38.5 
 
 
221 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1577  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.64 
 
 
235 aa  165  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  40.61 
 
 
223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2650  ThiJ/PfpI  38.74 
 
 
224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  37.05 
 
 
230 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3360  ThiJ/PfpI domain protein  41.55 
 
 
226 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00683077  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.36 
 
 
224 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  36.61 
 
 
230 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0479  NonF-related protein  41.96 
 
 
229 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0634  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.91 
 
 
258 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1134  ThiJ/PfpI  37.77 
 
 
250 aa  158  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1676  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.04 
 
 
238 aa  158  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.529621  normal  0.596562 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.78 
 
 
231 aa  157  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.16 
 
 
230 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1995  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.74 
 
 
234 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0948  ThiJ/PfpI domain protein  38.94 
 
 
267 aa  155  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.223812  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2424  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.82 
 
 
232 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0093  ThiJ/PfpI  39.73 
 
 
231 aa  155  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.28 
 
 
230 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  39.01 
 
 
245 aa  154  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.28 
 
 
232 aa  154  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2185  ThiJ/PfpI domain protein  38.12 
 
 
246 aa  154  9e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  37.72 
 
 
230 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0805  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.57 
 
 
225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.22 
 
 
229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  38.18 
 
 
228 aa  151  8e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.22 
 
 
227 aa  151  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  39.21 
 
 
226 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  39.21 
 
 
226 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  39.21 
 
 
226 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  39.21 
 
 
226 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  39.21 
 
 
226 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  39.21 
 
 
226 aa  150  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  39.21 
 
 
226 aa  150  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2247  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.6 
 
 
227 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  38.77 
 
 
227 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5679  ThiJ/PfpI  36.84 
 
 
260 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6043  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.84 
 
 
260 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0569087 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6825  ThiJ/PfpI domain protein  39.46 
 
 
233 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.397498 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  37.74 
 
 
229 aa  149  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.22 
 
 
228 aa  149  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1094  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.67 
 
 
225 aa  149  4e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.226669  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.73 
 
 
228 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1380  ThiJ/PfpI domain protein  37.44 
 
 
257 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1724  ThiJ/PfpI  37.67 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2633  ThiJ/PfpI domain protein  37.73 
 
 
230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.73 
 
 
225 aa  146  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1020  ThiJ/PfpI domain protein  40.38 
 
 
226 aa  145  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.276045  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.67 
 
 
225 aa  145  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4178  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.33 
 
 
228 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.96 
 
 
230 aa  145  6e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5801  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.67 
 
 
227 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.716355  normal  0.558329 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2826  intracellular protease/amidase, putative  37.05 
 
 
227 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  37.67 
 
 
225 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0774  ThiJ/PfpI domain protein  38.74 
 
 
254 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.561024  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.46 
 
 
230 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1011  ThiJ/PfpI  36.16 
 
 
225 aa  144  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2295  ThiJ/PfpI domain protein  37.05 
 
 
230 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159862  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0791  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.68 
 
 
229 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196046 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  37.22 
 
 
267 aa  144  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4210  ThiJ/PfpI domain protein  36.89 
 
 
225 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.414893 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3509  DJ-1/PfpI family protein  36.57 
 
 
270 aa  143  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.962862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3240  ThiJ/PfpI domain protein  40.38 
 
 
233 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1353  ThiJ/PfpI family protein  36.61 
 
 
225 aa  143  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0419  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.87 
 
 
209 aa  143  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1737  ThiJ/PfpI family protein  37.5 
 
 
228 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276901  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  37.55 
 
 
224 aa  143  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  36.32 
 
 
261 aa  142  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3106  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.39 
 
 
223 aa  142  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.424885 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4593  thiJ/pfpI family protein  37.61 
 
 
220 aa  142  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4224  thiJ/PfpI family protein  37.61 
 
 
220 aa  142  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0419  ThiJ/PfpI  36.24 
 
 
234 aa  141  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3545  ThiJ/PfpI family protein  36.77 
 
 
225 aa  141  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.809418  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4627  thiJ/pfpI family protein  37.61 
 
 
220 aa  141  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4383  thiJ/pfpI family protein  37.61 
 
 
220 aa  141  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4722  thiJ/pfpI family protein  37.61 
 
 
220 aa  141  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.477028  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5603  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.73 
 
 
242 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15940  putative intracellular protease/amidase  36.32 
 
 
227 aa  140  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.581968  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02417  ThiJ/PfpI family protein  35.14 
 
 
232 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.847717  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4608  thiJ/pfpI family protein  37.16 
 
 
220 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1750  ThiJ/PfpI  36.16 
 
 
226 aa  140  9.999999999999999e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.45981  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  34.22 
 
 
229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5542  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.29 
 
 
224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126229 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2821  ThiJ/PfpI domain protein  35.53 
 
 
227 aa  139  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7474  ThiJ/PfpI family protein  36.4 
 
 
227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9266  predicted protein  32.14 
 
 
224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.774425  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4110  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.22 
 
 
227 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2722  putative intracellular protease/amidase-like protein  37.12 
 
 
378 aa  138  6e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.268961  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4578  thiJ/pfpI family protein  37.16 
 
 
220 aa  138  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4361  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.53 
 
 
228 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0227  ThiJ/PfpI family protein  35.24 
 
 
235 aa  137  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29000  hypothetical protein  34.65 
 
 
228 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000723683 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  35.87 
 
 
227 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>