197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4746 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4746  transferase hexapeptide repeat containing protein  100 
 
 
181 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00152727  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  37.13 
 
 
203 aa  114  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  37.8 
 
 
196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  33.71 
 
 
204 aa  104  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  36.72 
 
 
210 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  35.75 
 
 
229 aa  96.3  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0951  general glycosylation pathway protein  30.81 
 
 
195 aa  91.3  6e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0572  putative acetyltransferase  33.51 
 
 
197 aa  88.6  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  31.44 
 
 
226 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2607  putative acetyltransferase  34.86 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000773835  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  35.33 
 
 
223 aa  85.5  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  30.72 
 
 
196 aa  85.5  4e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  33.15 
 
 
194 aa  84.3  7e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0293  carbonic anhydrase  31.46 
 
 
214 aa  84  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436969  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  26.46 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001799  putative acetyltransferase  28.98 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0314  hexapaptide repeat-containing transferase  29.65 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.328072  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1380  general glycosylation pathway protein  31.52 
 
 
192 aa  82.8  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  33.13 
 
 
209 aa  82  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1256  UDP-4-amino-sugar N-acetyltransferase  29.51 
 
 
204 aa  80.9  0.000000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  30.73 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1140  general glycosylation pathway protein  28.82 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.672363  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0050  sialic acid biosynthesis protein NeuD  28.12 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1265  general glycosylation pathway protein  28.82 
 
 
203 aa  77.4  0.00000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333754  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1915  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  32.04 
 
 
213 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00871959  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1665  hexapaptide repeat-containing transferase  27.96 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0598  general glycosylation pathway protein  27.59 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.707027  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  32.56 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1973  hexapeptide transferase family protein  30.39 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001766  putative serine O-acetyltransferase  30.64 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00483498  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  30.11 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  33.15 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  29.61 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  31.91 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3872  hexapaptide repeat-containing transferase  30.69 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0820  hypothetical protein  31.69 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0791  hypothetical protein  31.11 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2245  pilin glycosylation protein  27.13 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0796956  normal  0.0504546 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4004  pilin glycosylation protein  27.07 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1269  acetyltransferase  28.49 
 
 
296 aa  71.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83932  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3128  hexapaptide repeat-containing transferase  32.58 
 
 
211 aa  70.9  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0286028  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2395  hexapeptide transferase family protein  34.71 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0255  putative acetyltransferase  26.04 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0168  putative acetyltransferase  26.04 
 
 
214 aa  69.7  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4155  acetyltransferase  27.6 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  27.68 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4261  hexapaptide repeat-containing transferase  34.43 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01411  carbonic anhydrase  28.09 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4284  acetyltransferase  27.32 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0715  transferase hexapeptide repeat containing protein  26.09 
 
 
197 aa  67.8  0.00000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  26.67 
 
 
211 aa  67.8  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2125  hexapaptide repeat-containing transferase  26.88 
 
 
210 aa  67  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0400816  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0218  hexapaptide repeat-containing transferase  27.72 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2227  hexapaptide repeat-containing transferase  30.53 
 
 
174 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5687  sugar O-acyltransferase, sialic acid O- acetyltransferase NeuD family  26.56 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1581  sialic acid biosynthesis protein NeuD  27.01 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.295514  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1588  hexapaptide repeat-containing transferase  27.46 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1574  putative serine O-acetyltransferase  27.85 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3841  putative acetyltransferase  27.74 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1159  neuD protein  27.84 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0594  acetyl transferase  26.34 
 
 
191 aa  64.7  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2813  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  28.18 
 
 
365 aa  63.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  29.73 
 
 
213 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3101  sialic acid biosynthesis protein NeuD  30.29 
 
 
206 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4057  acetyltransferases  25.73 
 
 
222 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1460  hexapaptide repeat-containing transferase  24.47 
 
 
218 aa  62.4  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2576  acetyltransferase  28.82 
 
 
206 aa  61.6  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.538596  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  26.23 
 
 
221 aa  62  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513916  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14091  hypothetical protein  23.62 
 
 
197 aa  62  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.742426  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2304  hypothetical protein  26.37 
 
 
203 aa  61.6  0.000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1935  acetyltransferase  27.18 
 
 
227 aa  61.2  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2592  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  25.7 
 
 
218 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2642  hexapaptide repeat-containing transferase  26.98 
 
 
214 aa  59.3  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1168  putative acetyl transferase protein  27.75 
 
 
217 aa  58.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.7385 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0194  hypothetical protein  27.64 
 
 
209 aa  58.9  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0094  putative acetyltransferase  24.68 
 
 
210 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315578 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4433  pilin glycosylation protein  26 
 
 
194 aa  57.8  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3035  putative acetyl transferase protein  29.44 
 
 
221 aa  57.8  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00399053  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5253  hexapeptide repeat-containing transferase  24.31 
 
 
210 aa  57.8  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00987  acetyltransferase  28.26 
 
 
216 aa  57.4  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0192  transferase, putative  27.64 
 
 
209 aa  57.4  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0496333  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0611  acetyltransferase  28.35 
 
 
216 aa  57  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06179  acetyltransferase  28.26 
 
 
216 aa  57.4  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0364172  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3476  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like  29.84 
 
 
269 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3981  hypothetical protein  29.13 
 
 
225 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0526  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.8 
 
 
209 aa  55.5  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2692  acetyltransferase  28.12 
 
 
214 aa  54.7  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1127  putative acetyl transferase protein  28.21 
 
 
220 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.037936  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01111  hypothetical protein  24.21 
 
 
198 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.238768 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2310  pilin glycosylation protein PglB  27.96 
 
 
206 aa  52.8  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.380656  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1876  hypothetical protein  27.23 
 
 
195 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.851217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1515  hexapaptide repeat-containing transferase  31.82 
 
 
219 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1273  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  37.25 
 
 
233 aa  52  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000226984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3020  hexapeptide transferase family protein  32.65 
 
 
371 aa  51.6  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2808  hexapeptide transferase family protein  30 
 
 
216 aa  52  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3899  putative acetyltransferase protein  23.7 
 
 
219 aa  51.6  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1413  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  36.27 
 
 
233 aa  51.6  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0200133  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4412  pilin glycosylation protein  24.52 
 
 
207 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3036  hexapeptide transferase family protein  30 
 
 
216 aa  51.2  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1877  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  31.5 
 
 
231 aa  51.2  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>