More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4725 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.92 
 
 		 978 aa  707    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  54.48 
 
 		 1011 aa  1130    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  40.02 
 
 		 973 aa  705    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  42.07 
 
 		 967 aa  747    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 976 aa  2035    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  38.69 
 
 		 930 aa  670    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  65.61 
 
 		 977 aa  1368    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  59.12 
 
 		 975 aa  1244    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.67 
 
 		 976 aa  686    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  63.91 
 
 		 991 aa  1323    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  52.05 
 
 		 967 aa  1012    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.95 
 
 		 962 aa  636    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.24 
 
 		 1034 aa  1097    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  63.38 
 
 		 1009 aa  1298    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.17 
 
 		 983 aa  1086    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  53.49 
 
 		 971 aa  1056    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.37 
 
 		 968 aa  1012    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  36.63 
 
 		 952 aa  597  1e-169  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.97 
 
 		 961 aa  585  1.0000000000000001e-165  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.77 
 
 		 1007 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  34.46 
 
 		 1007 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  35.66 
 
 		 1014 aa  581  1e-164  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.7 
 
 		 1025 aa  577  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.62 
 
 		 1038 aa  572  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  35.05 
 
 		 996 aa  570  1e-161  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  35.06 
 
 		 984 aa  566  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.7 
 
 		 1005 aa  559  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.73 
 
 		 1015 aa  557  1e-157  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  33.9 
 
 		 973 aa  554  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  34.46 
 
 		 1024 aa  553  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.88 
 
 		 1032 aa  540  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.21 
 
 		 990 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.04 
 
 		 990 aa  538  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.53 
 
 		 989 aa  536  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  32 
 
 		 1055 aa  538  1e-151  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.07 
 
 		 1035 aa  534  1e-150  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.24 
 
 		 1023 aa  535  1e-150  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.24 
 
 		 990 aa  534  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.67 
 
 		 995 aa  530  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  33.13 
 
 		 1024 aa  531  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.79 
 
 		 1025 aa  529  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.98 
 
 		 1046 aa  528  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  31.55 
 
 		 1070 aa  523  1e-147  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.92 
 
 		 983 aa  522  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  33.85 
 
 		 974 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  33 
 
 		 1015 aa  514  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  33.23 
 
 		 1032 aa  515  1e-144  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  32.99 
 
 		 984 aa  511  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  33.09 
 
 		 999 aa  499  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.02 
 
 		 999 aa  501  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  32.1 
 
 		 1050 aa  496  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.21 
 
 		 945 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  30.91 
 
 		 1023 aa  492  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  32.64 
 
 		 976 aa  488  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  32.04 
 
 		 1013 aa  486  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  32.51 
 
 		 1050 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  31.86 
 
 		 1052 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.26 
 
 		 1031 aa  479  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.64 
 
 		 1037 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  30.88 
 
 		 987 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.33 
 
 		 950 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.46 
 
 		 1022 aa  466  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2371  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.55 
 
 		 1024 aa  462  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.475276  normal  0.254542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2718  FAD linked oxidase-like  30.95 
 
 		 1010 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400601 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  30.14 
 
 		 966 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  29.9 
 
 		 1002 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  30.67 
 
 		 1043 aa  448  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  30.1 
 
 		 1006 aa  449  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.53 
 
 		 973 aa  448  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2296  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.87 
 
 		 1023 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1747  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.96 
 
 		 1018 aa  440  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186842 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  30.29 
 
 		 975 aa  439  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1044  hypothetical protein  29.13 
 
 		 1031 aa  436  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2176  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.88 
 
 		 1018 aa  439  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0114816 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1450  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.35 
 
 		 1014 aa  437  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01656  predicted FAD-linked oxidoreductase  29.61 
 
 		 1018 aa  434  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3999  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.74 
 
 		 1006 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316797 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1768  oxidoreductase, FAD-binding  29.61 
 
 		 1018 aa  434  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.71 
 
 		 948 aa  435  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1944  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.51 
 
 		 1018 aa  433  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150005 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1903  oxidoreductase, FAD-binding  29.51 
 
 		 1018 aa  433  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.610317  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.32 
 
 		 989 aa  434  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01645  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1018 aa  434  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1955  FAD linked oxidase domain protein  29.41 
 
 		 1018 aa  430  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181771  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4493  FAD linked oxidase domain protein  30.84 
 
 		 1006 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2011  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.33 
 
 		 947 aa  430  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00715823  decreased coverage  0.00037047 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7704  FAD linked oxidase  29.62 
 
 		 1017 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.986449 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6630  FAD linked oxidase domain-containing protein  30 
 
 		 1018 aa  432  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1419  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.37 
 
 		 1006 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184545  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2643  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.36 
 
 		 1013 aa  428  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2533  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  30.45 
 
 		 1015 aa  428  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3281  FAD linked oxidase-like  29.4 
 
 		 1009 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.539054  normal  0.121942 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02063  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1011 aa  428  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2402  oxidoreductase, FAD-binding  29.31 
 
 		 1018 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0186702 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001538  Fe-S oxidoreductase  29.31 
 
 		 1015 aa  428  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1888  oxidoreductase, FAD-binding  29.41 
 
 		 1018 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6039  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.46 
 
 		 1017 aa  427  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.549592 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003726  Fe-S oxidoreductase  29.41 
 
 		 1011 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000740961  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1864  FAD linked oxidase domain protein  28.61 
 
 		 1013 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.23854  hitchhiker  0.000000575821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3782  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.65 
 
 		 1005 aa  429  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105727 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>