More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4705 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4705  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
311 aa  647    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  39.92 
 
 
294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2767  glycosyl transferase family protein  40.97 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.280211  normal  0.34813 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 
930 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3678  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  33.94 
 
 
466 aa  115  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  28.72 
 
 
374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1401  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
898 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.463731  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1497  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
898 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0238039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2458  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
774 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.745195  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  29.2 
 
 
299 aa  112  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  32.71 
 
 
812 aa  112  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 
321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
330 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3506  glycosyl transferase family 2  32.91 
 
 
318 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.33454e-25 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  26.43 
 
 
398 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 
1250 aa  106  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  33.16 
 
 
321 aa  105  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
321 aa  105  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2383  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
316 aa  105  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 
318 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  28.2 
 
 
397 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 
376 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3095  glycosyl transferase family protein  32.85 
 
 
320 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2164  glycosyl transferase family 2  40.31 
 
 
330 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3802  glucosyltransferase  28.94 
 
 
341 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0960  glycosyl transferase family 2  37.8 
 
 
338 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0106239  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 
390 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0840  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
318 aa  102  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0249486 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3243  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
337 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0174671  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
581 aa  101  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0725  glycosyl transferase family protein  29.25 
 
 
734 aa  101  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.492928  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4316  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
450 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  29.22 
 
 
255 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1280  lipooligosaccharide biosynthesis galactosyltransferase, putative  28.63 
 
 
323 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.265819  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5183  glycosyl transferase family 2  27.98 
 
 
315 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2382  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 
319 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3099  glycosyl transferase family protein  35.42 
 
 
303 aa  99  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.122373  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
305 aa  98.2  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
365 aa  98.6  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1049  glycosyl transferase family protein  32.08 
 
 
295 aa  98.2  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.173501  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0632  glycosyl transferase family 2  25.51 
 
 
313 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.138746  normal  0.982719 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 
350 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2952  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 
377 aa  97.4  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.604226  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1932  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
373 aa  97.1  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.876392  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2481  family 2 glycosyl transferase  30.49 
 
 
340 aa  97.1  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  35.82 
 
 
353 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
280 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2585  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
264 aa  95.1  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  28.71 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  28.63 
 
 
351 aa  95.5  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 
351 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  30.73 
 
 
386 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
354 aa  94.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  31.74 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1391  glycosyl transferase family 2  30.48 
 
 
209 aa  94.4  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.961124  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  30.05 
 
 
334 aa  94.7  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 
347 aa  94  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 
1035 aa  94  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 
235 aa  94  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1156  beta-1,3-galactosyltransferase  36.84 
 
 
181 aa  94.4  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000973066  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.92 
 
 
341 aa  93.6  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1609  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
280 aa  93.6  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00100883  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0430  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.62 
 
 
337 aa  93.2  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  29.52 
 
 
704 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0585  beta-1,3-galactosyltransferase  36.89 
 
 
287 aa  92.8  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1402  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 
372 aa  92.8  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000124327  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  27.66 
 
 
746 aa  92.8  7e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0374  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.62 
 
 
316 aa  92.4  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00522517  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1721  glycosyl transferase family protein  25.94 
 
 
261 aa  92.4  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.205644  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14251  hypothetical protein  32.08 
 
 
218 aa  92.4  8e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.485314  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 
390 aa  92.4  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 
352 aa  92.4  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 
316 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  27.88 
 
 
377 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
336 aa  91.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  30.81 
 
 
347 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3698  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  25.38 
 
 
305 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1043  glycosyl transferase family 2  26.64 
 
 
1009 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0124689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  35.48 
 
 
1739 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 
330 aa  91.3  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  31.63 
 
 
313 aa  90.9  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2391  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 
244 aa  91.3  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  37.6 
 
 
326 aa  90.9  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3285  glycosyl transferase family 2  36.72 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.044685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 
347 aa  91.3  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
727 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1613  glycosyl transferase family 2  25.12 
 
 
343 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2763  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
324 aa  90.9  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.32347  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0952  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
276 aa  90.1  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.768268 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
336 aa  90.1  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4802  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
373 aa  90.1  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.858117  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22790  glycosyl transferase family 2  26.58 
 
 
250 aa  90.1  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
380 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 
597 aa  89.7  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  27.75 
 
 
363 aa  89.4  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  36.43 
 
 
303 aa  89.4  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1837  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 
350 aa  89  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4345  glycosyl transferase family 2  31.22 
 
 
847 aa  89  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.321273  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2262  glycosyl transferase, group 2  41 
 
 
386 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>