134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4697 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4697  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  543  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342624  normal  0.0224398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2073  hypothetical protein  52 
 
 		 256 aa  263  2e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.197974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2921  hypothetical protein  50.61 
 
 		 261 aa  250  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.547284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1915  hypothetical protein  49.6 
 
 		 266 aa  247  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.312443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0995  hypothetical protein  49.38 
 
 		 262 aa  244  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0193892  normal  0.140843 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01798  hypothetical protein  50.4 
 
 		 258 aa  240  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2724  hypothetical protein  47.45 
 
 		 263 aa  237  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1607  hypothetical protein  39.42 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.387519  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2677  hypothetical protein  34.9 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0239  hypothetical protein  29.88 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.661071 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04860  hypothetical protein  28.63 
 
 		 231 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.412432  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0422  hypothetical protein  28.57 
 
 		 248 aa  102  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164773  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0144  hypothetical protein  33.33 
 
 		 185 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.852907  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2496  hypothetical protein  30.36 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.045483  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1179  hypothetical protein  32.6 
 
 		 224 aa  92.8  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0431  hypothetical protein  27.83 
 
 		 245 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1085  hypothetical protein  31.15 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22470  hypothetical protein  28.63 
 
 		 235 aa  86.3  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.728206 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2256  hypothetical protein  28.18 
 
 		 259 aa  85.9  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0543  hypothetical protein  33.16 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0137  hypothetical protein  26.27 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0135  hypothetical protein  26.27 
 
 		 212 aa  84.3  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0238  hypothetical protein  30.41 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.911643 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0480  hypothetical protein  29.78 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758585  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0593  hypothetical protein  28.65 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3003  hypothetical protein  31.63 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2753  hypothetical protein  31.03 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0569  hypothetical protein  27.37 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12650  hypothetical protein  28.45 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1637  hypothetical protein  24.71 
 
 		 257 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1833  hypothetical protein  31.63 
 
 		 228 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.037542  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0410  integral membrane protein-like protein  27.59 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0390  hypothetical protein  28.89 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0293125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0376  hypothetical protein  30.77 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.012139 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1037  hypothetical protein  28.24 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0375  hypothetical protein  28.44 
 
 		 238 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0512  conserved integral membrane protein  30.57 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00965465 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0307  hypothetical protein  30.18 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.183212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0021  hypothetical protein  32.34 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3234  hypothetical protein  29.83 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1113  hypothetical protein  24.78 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4165  hypothetical protein  34.52 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.486669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0290  hypothetical protein  32.84 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3147  hypothetical protein  24.57 
 
 		 256 aa  72  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.134821  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4196  hypothetical protein  27.13 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0051  transporter  28.57 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0725  hypothetical protein  28.74 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0199  hypothetical protein  25.86 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.184422  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3163  hypothetical protein  25.97 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.405047  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0849  hypothetical protein  24.16 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1846  hypothetical protein  26.29 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.376701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0596  hypothetical protein  26.55 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0269  hypothetical protein  26.11 
 
 		 226 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0279  hypothetical protein  26.11 
 
 		 226 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.155146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0259  hypothetical protein  26.11 
 
 		 226 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.254406 
 
 
-
 
NC_002936  DET0425  hypothetical protein  30.71 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.325475  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0819  hypothetical protein  24.29 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.518689  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2415  hypothetical protein  30.85 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000066201  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1492  hypothetical protein  25.65 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1869  hypothetical protein  24.21 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000517299  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1521  hypothetical protein  25.65 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0401  hypothetical protein  30.71 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.851057  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_366  hypothetical protein  30 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2053  hypothetical protein  31.34 
 
 		 214 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0438  hypothetical protein  24.89 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.186047  normal  0.701848 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1009  hypothetical protein  27.78 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.562517  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1193  hypothetical protein  22.49 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1583  hypothetical protein  29.25 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7921  hypothetical protein  29.56 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.649004  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0915  hypothetical protein  26.29 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00670  ATP synthase subunit 6/subunit A  23.26 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1798  hypothetical protein  25.97 
 
 		 207 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0029  hypothetical protein  26.4 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3227  hypothetical protein  26.67 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0857493 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15690  hypothetical protein  27.37 
 
 		 254 aa  52.8  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3679  hypothetical protein  26.2 
 
 		 222 aa  52.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000848067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0029  hypothetical membrane spanning protein  25 
 
 		 252 aa  52.4  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1998  hypothetical protein  25 
 
 		 252 aa  52.4  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1418  hypothetical protein  26.62 
 
 		 189 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03320  conserved inner membrane protein  27.53 
 
 		 221 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0244  conserved hypothetical protein  27.53 
 
 		 221 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3870  hypothetical protein  26.78 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000480386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3963  hypothetical protein  26.78 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000681461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03273  hypothetical protein  27.53 
 
 		 221 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4073  hypothetical protein  26.78 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000180741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3670  hypothetical protein  27.53 
 
 		 221 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3953  hypothetical protein  27.53 
 
 		 221 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3851  hypothetical protein  27.53 
 
 		 221 aa  50.4  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3875  hypothetical protein  26.78 
 
 		 219 aa  50.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0609678  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0917  hypothetical protein  25.69 
 
 		 216 aa  50.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3771  hypothetical protein  26.04 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3296  hypothetical protein  27.37 
 
 		 221 aa  49.7  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.635388  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0128  hypothetical protein  28.57 
 
 		 221 aa  49.3  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.517941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3340  hypothetical protein  30 
 
 		 207 aa  49.3  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3755  hypothetical protein  27.12 
 
 		 221 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4791  hypothetical protein  27.12 
 
 		 221 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4715  hypothetical protein  26.23 
 
 		 219 aa  49.3  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3878  hypothetical protein  28.4 
 
 		 221 aa  49.3  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0922175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0091  hypothetical protein  24.29 
 
 		 223 aa  49.3  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000285366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3848  hypothetical protein  26.04 
 
 		 221 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>