20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4658 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4658  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  212  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000145123  unclonable  0.0000000000000112336 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3423  plasmid stabilization system  38.04 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000145668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2399  plasmid stabilization system protein  33.68 
 
 		 97 aa  68.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00225312  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1571  plasmid stabilization system  30.11 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4655  plasmid stabilization system  32.63 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.026638  normal  0.454528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1013  hypothetical protein  30.95 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1260  hypothetical protein  28.57 
 
 		 98 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.848688  unclonable  0.00000662005 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1059  plasmid stabilization system  32.5 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.059768  hitchhiker  0.0000840756 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0055  hypothetical protein  23.16 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00614  Plasmid stabilization system  27.08 
 
 		 98 aa  48.9  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.2967  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1938  plasmid stabilization system protein  34.62 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1848  hypothetical protein  26.32 
 
 		 97 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.0132038 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2139  plasmid stabilization system  25.84 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.857601  normal  0.128216 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3206  hypothetical protein  30.93 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0349  hypothetical protein  30 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1758  hypothetical protein  26.09 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2727  hypothetical protein  27.27 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1379  hypothetical protein  31.58 
 
 		 99 aa  42  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  hitchhiker  0.00821218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0685  hypothetical protein  22.68 
 
 		 100 aa  42  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000390836  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1934  hypothetical protein  33.33 
 
 		 97 aa  40.4  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>