More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4618 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
245 aa  504  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.978262  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.61 
 
 
260 aa  362  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3828  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.06 
 
 
246 aa  261  6.999999999999999e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.02 
 
 
245 aa  259  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035289  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.98 
 
 
272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.56 
 
 
246 aa  231  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.53 
 
 
246 aa  228  7e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.08 
 
 
244 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120829  normal  0.282186 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.32 
 
 
241 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.409582  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.63 
 
 
241 aa  168  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2677  putative short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  40.87 
 
 
245 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.334903  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.13 
 
 
270 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1054  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.24 
 
 
242 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7619  short chain oxidoreductase  41.74 
 
 
244 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493234  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6333  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.47 
 
 
252 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.519755  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.78 
 
 
245 aa  158  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
257 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135845  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.56 
 
 
231 aa  154  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.376795 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0814  putative short-chain dehydrogenase/reductase  38.78 
 
 
257 aa  154  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.968056 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
251 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.350436  normal  0.454063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0146  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.25 
 
 
244 aa  154  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0855  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.65 
 
 
247 aa  151  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5116  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1616  short chain dehydrogenase  39.82 
 
 
236 aa  150  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.124879  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1818  short chain dehydrogenase  39.82 
 
 
236 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
250 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0227742 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.57 
 
 
249 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06450  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  38.55 
 
 
240 aa  146  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1782  short chain dehydrogenase  38.91 
 
 
236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.75 
 
 
250 aa  145  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0163958 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0513  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.04 
 
 
233 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1765  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.18 
 
 
237 aa  145  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
234 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2601  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 
234 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3562  short chain dehydrogenase  38.01 
 
 
236 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2190  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230027  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0516  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.73 
 
 
244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
250 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886047  decreased coverage  0.000126478 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.03 
 
 
229 aa  135  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0980  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.13 
 
 
238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633587  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.1 
 
 
239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.512494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
237 aa  132  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0285855 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2801  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
248 aa  132  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1084  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0199  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.93 
 
 
237 aa  125  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.36 
 
 
231 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0836078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.75 
 
 
232 aa  121  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.6 
 
 
238 aa  121  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.9 
 
 
229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
239 aa  115  8.999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.475837  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.05 
 
 
227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07268  short chain dehydrogenase/reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00840)  37.05 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.886513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2390  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
236 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0167749  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1523  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 
269 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3450  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  29.44 
 
 
234 aa  109  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2448  short chain dehydrogenase  35.68 
 
 
277 aa  109  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 
264 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.44 
 
 
234 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.137706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3437  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  27.83 
 
 
234 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3218  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.83 
 
 
234 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3471  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  27.83 
 
 
234 aa  106  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.64 
 
 
240 aa  105  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.19 
 
 
236 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497428  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3423  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  30.23 
 
 
234 aa  105  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
236 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.75 
 
 
243 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3196  short chain dehydrogenase  27.39 
 
 
234 aa  105  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0271807  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0345  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.43 
 
 
248 aa  103  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02369  short chain dehydrogenase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15350)  32.77 
 
 
309 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.406317 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00525  conserved hypothetical protein  29.79 
 
 
263 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.30588 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.65 
 
 
265 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.729821 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07999  conserved hypothetical protein  32.09 
 
 
266 aa  102  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.65 
 
 
271 aa  102  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0558  short chain dehydrogenase  35.5 
 
 
272 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.449424 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  35.03 
 
 
286 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11468  acetoin(diacetyl)reductase  36.79 
 
 
254 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0328388  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 
236 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1601  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  34.33 
 
 
253 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00663805  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.63 
 
 
281 aa  99.4  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
234 aa  99.8  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00144491  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02039  short chain oxidoreductase (CsgA), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00910)  30.53 
 
 
251 aa  99  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.049775  normal  0.21203 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.41 
 
 
235 aa  98.6  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2280  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 
247 aa  97.4  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474555  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  33.76 
 
 
274 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.01 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0154  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 
255 aa  96.3  4e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.649375  normal  0.270956 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1603  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.83 
 
 
248 aa  96.3  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000401343  decreased coverage  0.000161546 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.85 
 
 
254 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  31.7 
 
 
271 aa  95.5  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0396  carbonyl reductase  30.67 
 
 
243 aa  94.7  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  34.34 
 
 
272 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0796  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.37 
 
 
281 aa  94  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 
307 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002996  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  31 
 
 
245 aa  94.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000487281  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  33.18 
 
 
236 aa  92.8  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.77 
 
 
273 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0700292  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  34.5 
 
 
272 aa  92.8  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46600  short chain dehydrogenase  31.65 
 
 
268 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000918039  hitchhiker  0.00000172259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0715  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.17 
 
 
269 aa  92.8  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.96 
 
 
256 aa  92.8  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.872247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>