253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4598 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4598  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  100 
 
 
143 aa  300  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4168  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  50 
 
 
140 aa  137  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0156126  hitchhiker  0.00300436 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1711  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  49.65 
 
 
144 aa  120  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2613  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.97 
 
 
148 aa  120  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524251 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4571  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  45.39 
 
 
322 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.811205  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2330  hypothetical protein  41.01 
 
 
142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.875189  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1228  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.61 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.73608  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1204  PhnB protein  42.86 
 
 
145 aa  110  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5411  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.3 
 
 
141 aa  110  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110771 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0039  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.85 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3991  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  43.06 
 
 
155 aa  107  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.463262  normal  0.542881 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1773  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.71 
 
 
140 aa  107  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.019002 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4633  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.29 
 
 
142 aa  103  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346773  normal  0.129541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21400  hypothetical protein  39.55 
 
 
139 aa  102  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.327191 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1792  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.64 
 
 
144 aa  99  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000310805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1646  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.59 
 
 
138 aa  99  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.246975  normal  0.123315 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2829  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.6 
 
 
139 aa  99  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000111266  normal  0.0167858 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2509  hypothetical protein  42.34 
 
 
136 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6102  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.64 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2362  hypothetical protein  42.34 
 
 
136 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1950  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.13 
 
 
137 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.671815  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.71 
 
 
137 aa  95.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172223  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2043  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.64 
 
 
164 aa  94.4  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.236061  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1375  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.24 
 
 
133 aa  94  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4772  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40 
 
 
139 aa  89.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261659  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3122  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.81 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364708  normal  0.0270793 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3064  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.96 
 
 
138 aa  88.6  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1958  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.21 
 
 
152 aa  87.8  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2381  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.59 
 
 
138 aa  87  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000314859  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4177  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.04 
 
 
137 aa  84.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1131  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.81 
 
 
139 aa  84.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4159  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.96 
 
 
136 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.458009  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0601  hypothetical protein  39.44 
 
 
143 aa  83.6  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3596  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.83 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000394768  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3316  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.67 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.918478  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3966  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.67 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.591195  normal  0.267495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5402  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.56 
 
 
136 aa  82  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3779  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.07 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0377778  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  37.23 
 
 
284 aa  80.9  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3003  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.82 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3524  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.56 
 
 
138 aa  80.1  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0734  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.62 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  35.77 
 
 
279 aa  78.2  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4762  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.84 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4030  hypothetical protein  37.86 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46780  hypothetical protein  37.86 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00435317  hitchhiker  0.000000369567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4029  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.36 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31410  hypothetical protein  32.12 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1724  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.51 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0853542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2336  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.51 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1560  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.11 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.742645 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2265  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.25 
 
 
150 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289163  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2359  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.51 
 
 
151 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0941  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.01 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000300848  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6895  glyoxalase family protein  34.31 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.008726  normal  0.0923151 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0482  hypothetical protein  30.37 
 
 
143 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226703 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4028  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.43 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0559791  normal  0.357373 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0029  PhnB protein  33.8 
 
 
140 aa  75.5  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0403111  normal  0.0726467 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2255  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.51 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.260674  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1225  hypothetical protein  29.93 
 
 
136 aa  74.7  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000443563  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0961  glyoxalase family protein  34.53 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.398511  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1590  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.33 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2375  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.51 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614742  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1609  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.56 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20440  hypothetical protein  33.59 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.565275  normal 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3066  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.59 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4608  hypothetical protein  27.66 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2003  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.3 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2770  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.29 
 
 
144 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00372425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4762  hypothetical protein  29.85 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5620  hypothetical protein  27.66 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03978  hypothetical protein  27.66 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4542  hypothetical protein  29.63 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0952662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4378  PhnB protein  29.63 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4388  PhnB protein  29.63 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0567187  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3963  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase:3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.23 
 
 
135 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0315736  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4572  hypothetical protein  27.66 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5678  glyoxalase/bleomycin resistance protein  34.78 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4895  hypothetical protein  29.63 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00185304  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03939  hypothetical protein  27.66 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4753  hypothetical protein  29.63 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4779  hypothetical protein  29.63 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3920  hypothetical protein  27.66 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3885  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.66 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4347  hypothetical protein  27.66 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4661  hypothetical protein  27.66 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1941  glyoxalase family protein  33.09 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.758162  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1324  glyoxalase family protein  33.09 
 
 
260 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.228518  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4569  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.419653 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0295  glyoxalase family protein  33.09 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.198245  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3497  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.35175  normal  0.404774 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1012  glyoxalase family protein  33.09 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.50661  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0853  glyoxalase family protein  33.09 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1173  VOC metalloenzyme family protein  33.09 
 
 
144 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.71319  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0327  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.85 
 
 
138 aa  72  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.247487 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0310  hypothetical protein  29.29 
 
 
143 aa  72  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0504777 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1165  VOC metalloenzyme family protein  33.09 
 
 
144 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0826  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.03 
 
 
131 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4412  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.58 
 
 
139 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.243499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4780  hypothetical protein  28.15 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>