More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4468 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4468  aminotransferase class I and II  100 
 
 		 342 aa  706    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.517965  normal  0.0670224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5370  aminotransferase class I and II  43.03 
 
 		 340 aa  292  5e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0012  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  40.47 
 
 		 342 aa  271  8.000000000000001e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.393854 
 
 
-
 
NC_002950  PG1160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  42.26 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.693312 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3537  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.86 
 
 		 379 aa  170  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0487  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  34.23 
 
 		 399 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3603  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.23 
 
 		 370 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1020  aminotransferase class I and II  32.74 
 
 		 364 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1011  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.57 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0304  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.08 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  33.73 
 
 		 863 aa  162  7e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0043  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  33.24 
 
 		 357 aa  160  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1515  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.25 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3448  cobyric acid synthase CobQ  32.63 
 
 		 852 aa  160  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1268  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.14 
 
 		 364 aa  159  6e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1287  aminotransferase class I and II  29.55 
 
 		 356 aa  159  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0948768  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2936  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.18 
 
 		 351 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1295  threonine-phosphate decarboxylase  29.45 
 
 		 354 aa  155  8e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.806359  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  31.52 
 
 		 863 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1139  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.84 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.122292 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1265  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  32.29 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1104  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.35 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1849  histidinol-phosphate transaminase  29.33 
 
 		 346 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1114  threonine-phosphate decarboxylase  29.14 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.677622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1737  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.45 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0451969 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0760  threonine-phosphate decarboxylase  32.06 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0846626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1118  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  30.84 
 
 		 366 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0747  threonine-phosphate decarboxylase  31.47 
 
 		 364 aa  152  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00550171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0687  threonine-phosphate decarboxylase  30.27 
 
 		 364 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000611427  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3160  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.66 
 
 		 352 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0852475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0804  threonine-phosphate decarboxylase  31.76 
 
 		 364 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0706087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0701  threonine-phosphate decarboxylase  31.47 
 
 		 364 aa  151  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0153114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2208  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.16 
 
 		 356 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1623  aminotransferase family protein  28.44 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0121339  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1365  aminotransferase family protein  28.14 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078136  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1309  aminotransferase class I and II  30.19 
 
 		 378 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000234222  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  31.64 
 
 		 864 aa  146  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3089  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.5 
 
 		 366 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00022777  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1585  class I/II aminotransferase  29.88 
 
 		 359 aa  144  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2701  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.17 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0869  putative L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.48 
 
 		 358 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0161  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.32 
 
 		 848 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02181  aminotransferases class-I  26.8 
 
 		 374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1067  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.17 
 
 		 359 aa  140  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.748471  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  32.68 
 
 		 368 aa  139  8.999999999999999e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0200  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.78 
 
 		 374 aa  139  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.374942  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1111  aminotransferase class I and II  27.98 
 
 		 362 aa  138  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0722  threonine-phosphate decarboxylase  30 
 
 		 366 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.762895 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02161  aminotransferases class-I  26.45 
 
 		 373 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  33 
 
 		 368 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6030  aminotransferase class I and II  32.84 
 
 		 343 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.426698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1231  aminotransferase class I and II  29.85 
 
 		 339 aa  136  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  32.35 
 
 		 368 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  32.35 
 
 		 368 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02271  aminotransferases class-I  27.45 
 
 		 361 aa  135  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645989  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3433  aminotransferase class I and II  31.08 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0324026  normal  0.394034 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1466  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  29.22 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2989  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  29.66 
 
 		 361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.223207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0420  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  31.6 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1611  threonine-phosphate decarboxylase  30.95 
 
 		 368 aa  134  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.238586  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17740  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.58 
 
 		 807 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.27949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0576  aminotransferase, class I and II  31.55 
 
 		 357 aa  133  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  26.36 
 
 		 369 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27901  aminotransferases class-I  28.83 
 
 		 360 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  28.57 
 
 		 858 aa  129  7.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  28.81 
 
 		 350 aa  127  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  28.62 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0317  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  27.38 
 
 		 364 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1109  threonine-phosphate decarboxylase  31.25 
 
 		 357 aa  124  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0182392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  28.04 
 
 		 372 aa  123  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  27.69 
 
 		 351 aa  123  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21150  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  28.65 
 
 		 350 aa  122  6e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  29.64 
 
 		 359 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0878  aminotransferase class I and II  30.32 
 
 		 347 aa  120  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1723  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  27.3 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  28.53 
 
 		 368 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0633  aminotransferase class I and II  32.14 
 
 		 354 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.468003 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1766  threonine-phosphate decarboxylase  29.17 
 
 		 367 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  23.67 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0538  aminotransferase class I and II  31 
 
 		 358 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  27.87 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3547  hypothetical protein  31.86 
 
 		 396 aa  116  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2687  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase, putative  26.27 
 
 		 352 aa  116  6e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.243018  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1052  aminotransferase class I and II  30.43 
 
 		 383 aa  116  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1116  histidinol-phosphate aminotransferase  30.03 
 
 		 370 aa  116  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.177687 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  29.45 
 
 		 353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  28.99 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  28.99 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.191971 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  28.66 
 
 		 356 aa  113  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  28.66 
 
 		 356 aa  113  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  26.72 
 
 		 359 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  28.74 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2490  L-threonine-O-3-phosphate decarboxylase  30.84 
 
 		 362 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3922  hypothetical protein  32.43 
 
 		 366 aa  113  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.753113  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12260  hypothetical protein  29.82 
 
 		 364 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0612  histidinol-phosphate aminotransferase  27.95 
 
 		 369 aa  112  7.000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  28.34 
 
 		 359 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0943  aminotransferase class I and II  26.74 
 
 		 363 aa  112  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.4987  normal  0.594638 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  28.34 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  27.61 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>