More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4463 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
341 aa  707    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29527  normal  0.178629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5387  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.16 
 
 
341 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.760663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.6 
 
 
341 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.406343  normal  0.0918592 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.19 
 
 
343 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1746  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.36 
 
 
339 aa  386  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00146223 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.13 
 
 
339 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.82 
 
 
340 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.138732  normal  0.0406215 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3748  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.08 
 
 
331 aa  360  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.94 
 
 
324 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.24 
 
 
331 aa  354  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4410  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.79 
 
 
331 aa  353  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0139677  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3484  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.43 
 
 
331 aa  348  7e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.21 
 
 
332 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.4 
 
 
324 aa  338  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.91 
 
 
333 aa  314  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.726058  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0945  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.15 
 
 
328 aa  310  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165164  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2559  Short-chain alcohol dehydrogenase  43.15 
 
 
339 aa  276  3e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2701  oxidoreductase  43.34 
 
 
320 aa  271  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0359887  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7081  oxidoreductase  46.2 
 
 
321 aa  266  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.347841  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6184  oxidoreductase  45.06 
 
 
321 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.69376 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1053  oxidoreductase  46.91 
 
 
319 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176111  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15620  oxidoreductase  45.06 
 
 
320 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000160845  hitchhiker  2.2896399999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3640  oxidoreductase  45.06 
 
 
318 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3756  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.85 
 
 
315 aa  252  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.839369  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1143  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 
318 aa  250  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456891  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1253  oxidoreductase  44.75 
 
 
321 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619751  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6579  oxidoreductase  44.75 
 
 
321 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1669  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.34 
 
 
325 aa  241  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.11239  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1138  putative dehydrogenase  40.06 
 
 
329 aa  228  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.530654  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.55 
 
 
335 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
325 aa  225  7e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.167691 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
323 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3314  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.02 
 
 
320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0167098 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.48 
 
 
326 aa  217  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.23 
 
 
338 aa  217  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.200528  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2094  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
322 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26328  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0686  oxidoreductase  41.39 
 
 
324 aa  210  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
327 aa  208  9e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2120  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.62 
 
 
313 aa  203  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.289594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.54 
 
 
326 aa  195  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2445  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
313 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2082  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.53 
 
 
318 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.5 
 
 
313 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00430281  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5759  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
310 aa  172  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0307926 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.86 
 
 
307 aa  166  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2558  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.77 
 
 
312 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863347  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 
297 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  35.93 
 
 
317 aa  159  5e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.96 
 
 
298 aa  159  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  37.18 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 
304 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  35.69 
 
 
303 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.03 
 
 
312 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 
298 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  34.29 
 
 
304 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  34.49 
 
 
316 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.71 
 
 
303 aa  146  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  36.84 
 
 
284 aa  146  6e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  35.87 
 
 
302 aa  145  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.48 
 
 
298 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.35 
 
 
301 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 
312 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.08 
 
 
327 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.64 
 
 
307 aa  142  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
307 aa  142  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.27 
 
 
288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.94 
 
 
312 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 
289 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.89 
 
 
336 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.893798  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 
289 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.19 
 
 
289 aa  140  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.65 
 
 
305 aa  138  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  32.71 
 
 
311 aa  138  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.3 
 
 
298 aa  137  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.17 
 
 
288 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.73 
 
 
290 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01783  short-chain dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00280)  32.26 
 
 
661 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0309502 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  36.25 
 
 
306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.91 
 
 
303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.76 
 
 
324 aa  136  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  33.65 
 
 
303 aa  136  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  33.86 
 
 
300 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  32.29 
 
 
305 aa  135  8e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.69 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  40.2 
 
 
311 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  34.05 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.52 
 
 
241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.58 
 
 
310 aa  133  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.37 
 
 
326 aa  132  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  33.54 
 
 
300 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
305 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  33.54 
 
 
300 aa  132  6e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.73 
 
 
329 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  33.13 
 
 
308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 
312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711865  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  31.73 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  31.73 
 
 
333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>