More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4455 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
346 aa  716    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153396  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.62 
 
 
347 aa  372  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0426426  normal  0.159992 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3396  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.67 
 
 
342 aa  348  1e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5514  putative dihydrokaempferol 4-reductase (NAD-dependent epimerase/dehydratase)  49.85 
 
 
340 aa  330  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.43 
 
 
351 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.43 
 
 
351 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.71 
 
 
351 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249443  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.74 
 
 
346 aa  296  5e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.07 
 
 
319 aa  272  5.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0387  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  42.27 
 
 
341 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.831837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0377  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  42.27 
 
 
341 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.7 
 
 
325 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.12 
 
 
352 aa  230  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.558578  normal  0.0371472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.74 
 
 
335 aa  216  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80185  CAD family protein  36.81 
 
 
331 aa  210  3e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101414  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.63 
 
 
332 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56924  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.302956 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0529  dihydrokaempferol 4-reductase  38.49 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34417  hypothetical protein  34.02 
 
 
328 aa  192  7e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.584917  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31128  cinnamoyl-Coa reductase  35.29 
 
 
328 aa  191  2e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15511  dihydroflavonol-4-reductase  33.02 
 
 
322 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.738069  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05977  ketoreductase (AFU_orthologue; AFUA_2G10280)  33.24 
 
 
334 aa  160  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.396271 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2413  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  34.17 
 
 
352 aa  159  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208408  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.95 
 
 
348 aa  159  9e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.621455 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.7 
 
 
347 aa  156  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6522  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.14 
 
 
363 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5668  dihydrokaempferol 4-reductase  33.14 
 
 
363 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6032  dihydrokaempferol 4-reductase  33.14 
 
 
363 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1931  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.82 
 
 
349 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.593459  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5780  dihydrokaempferol 4-reductase  33.62 
 
 
357 aa  149  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42555 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0547  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  34.01 
 
 
347 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.403557 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 
348 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5544  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.05 
 
 
357 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72153  NADPH-dependent methylglyoxal reductase GRE2  32.76 
 
 
337 aa  144  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00635585 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03560  dihydrokaempferol 4-reductase, putative  34.7 
 
 
346 aa  142  8e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.69 
 
 
346 aa  142  9e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03540  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  33.1 
 
 
346 aa  138  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58065  dihydroflavonol-4-reductases  32.19 
 
 
335 aa  137  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5234  hypothetical protein  32.8 
 
 
349 aa  136  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03550  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  31.07 
 
 
346 aa  134  3e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50500  predicted protein  30.9 
 
 
358 aa  132  6e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.650002  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1666  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
355 aa  131  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0378933  normal  0.767388 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31257  predicted protein  32.2 
 
 
354 aa  129  7.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.367524  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00765  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02250)  31 
 
 
343 aa  120  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56762  protein induced by osmotic stress  30.34 
 
 
334 aa  119  9e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.516497  normal  0.0996379 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32463  protein induced by osmotic stress  30.41 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254213  normal  0.336313 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34974  NADPH-dependent Cinnamyl-alcohol dehydrogenase.  27.17 
 
 
336 aa  114  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.577054 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36555  Cinnamyl-alcohol dehydrogenase Flavonol reductase/cinnamoyl-CoA reductase  27.15 
 
 
339 aa  114  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0121063  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39216  GRE2-like protein  27.17 
 
 
335 aa  108  2e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.239106  hitchhiker  0.00871069 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42452  dihydroflavonol-4-reductases  25.49 
 
 
336 aa  106  5e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49223  protein induced by osmotic stress  28.52 
 
 
336 aa  100  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.376808 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01830  oxidoreductase, putative  31.05 
 
 
357 aa  97.8  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.01 
 
 
338 aa  95.9  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08583  aldehyde reductase II (AFU_orthologue; AFUA_1G11360)  29.79 
 
 
341 aa  95.1  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.835406  normal  0.302961 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1377  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
321 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.824049  hitchhiker  0.00256302 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 
354 aa  91.3  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0848085  normal  0.577467 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2616  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 
319 aa  90.9  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23450  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 
317 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292756  hitchhiker  0.00536132 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1017  nucleoside diphosphate sugar epimerase family protein  27.65 
 
 
328 aa  87.8  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2077  hypothetical protein  37.93 
 
 
155 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398465  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1984  UDP-glucose 4-epimerase  27.95 
 
 
318 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  29.75 
 
 
333 aa  86.7  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.87 
 
 
361 aa  85.1  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3031  O-antigen biosynthetic gene WbjF  28.87 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.175759 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
320 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.5 
 
 
318 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.92 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3782  putative epimerase/dehydratase  27.98 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.585015  normal  0.508619 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  25.36 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  25.36 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.78 
 
 
506 aa  80.5  0.00000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.287512 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0827  hypothetical protein  25.54 
 
 
318 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.39 
 
 
318 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  0.485366 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.08 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0763  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.41 
 
 
320 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2399  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.47 
 
 
327 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131768  normal  0.0846691 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  27.39 
 
 
329 aa  77  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0864  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 
328 aa  77  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0568  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.19 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000335133  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2506  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.18 
 
 
321 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3457  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.1 
 
 
508 aa  75.5  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.291016  normal  0.0152952 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.76 
 
 
315 aa  74.7  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0171245  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7040  hopanoid-associated sugar epimerase  26.8 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000519767 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.66 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.51 
 
 
335 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.44 
 
 
333 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10818  hypothetical protein  38 
 
 
151 aa  74.3  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000907114  normal  0.897069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1803  UDP-sugar epimerase  25.73 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.23 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  26.51 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.44 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210062  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  26.46 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.37 
 
 
313 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0589  sugar epimerase family protein  25.81 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>