More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4249 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 370 aa  761    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  39.56 
 
 		 372 aa  269  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  40.98 
 
 		 371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  41.69 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  39.52 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  38.32 
 
 		 400 aa  242  7.999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  37.47 
 
 		 380 aa  239  5e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  38.72 
 
 		 407 aa  236  7e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  36.52 
 
 		 384 aa  234  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  38.44 
 
 		 399 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  36.31 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  39.48 
 
 		 374 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  38.59 
 
 		 387 aa  215  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  38.39 
 
 		 424 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  35.07 
 
 		 377 aa  210  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  35.34 
 
 		 400 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  37.6 
 
 		 372 aa  208  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  38.56 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  36.44 
 
 		 398 aa  207  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  35.08 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  35.08 
 
 		 400 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  35.17 
 
 		 402 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  34.59 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  36.64 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  38.08 
 
 		 393 aa  202  8e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  37.79 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  35.39 
 
 		 393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.68 
 
 		 403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  32.62 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  34.21 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  36.63 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  35.1 
 
 		 389 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  36.47 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  34.9 
 
 		 415 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  32.88 
 
 		 403 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  35.29 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  30.91 
 
 		 423 aa  175  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  30.52 
 
 		 398 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  30.21 
 
 		 415 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  30.62 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  32.53 
 
 		 400 aa  160  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  32.47 
 
 		 408 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  32.93 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  32.66 
 
 		 467 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  34.42 
 
 		 381 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  29.89 
 
 		 396 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  29.71 
 
 		 418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  30.86 
 
 		 496 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  29.43 
 
 		 405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  29.03 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  29.78 
 
 		 388 aa  130  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  30.28 
 
 		 388 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  29.06 
 
 		 393 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  29.22 
 
 		 392 aa  129  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  27.89 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  31.83 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  28.98 
 
 		 396 aa  110  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  25.07 
 
 		 395 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  27.76 
 
 		 373 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  26.9 
 
 		 377 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  27.08 
 
 		 376 aa  96.3  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  27.24 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  26.52 
 
 		 377 aa  94.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  26.02 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  25.63 
 
 		 397 aa  91.3  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  25.78 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2242  hypothetical protein  25.58 
 
 		 379 aa  90.9  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  26.67 
 
 		 408 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  26.93 
 
 		 385 aa  90.1  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  25.93 
 
 		 376 aa  90.1  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  25.23 
 
 		 376 aa  89.7  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3224  monooxygenase FAD-binding  27.03 
 
 		 399 aa  89.4  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  26.09 
 
 		 376 aa  89  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3547  hypothetical protein  26.61 
 
 		 374 aa  89  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  26.26 
 
 		 378 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  25.36 
 
 		 396 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  25.53 
 
 		 386 aa  87  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  25.73 
 
 		 377 aa  87  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  25.14 
 
 		 408 aa  86.7  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  27.08 
 
 		 404 aa  86.3  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  26.36 
 
 		 404 aa  85.9  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1542  monooxygenase FAD-binding protein  25.39 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0929471  normal  0.228138 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  24.29 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  24.93 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  23.97 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  26.54 
 
 		 422 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3996  hypothetical protein  28.29 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  24.32 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  24.6 
 
 		 376 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2149  monooxygenase FAD-binding protein  22.68 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.438269  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  27.62 
 
 		 399 aa  82.8  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  23.69 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  27.53 
 
 		 405 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08521  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06050)  26.74 
 
 		 469 aa  82.4  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.883838  normal  0.0891916 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3438  monooxygenase, FAD-binding  26.76 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0304  hypothetical protein  27.27 
 
 		 361 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.196732 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  26.59 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  25.93 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2172  monooxygenase, FAD-binding  24.18 
 
 		 413 aa  80.1  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>