65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4241 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4241  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L- fucosidase)  100 
 
 
555 aa  1154    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.525329  normal  0.717793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1302  glycoside hydrolase family alpha-L-fucosidase  49.11 
 
 
540 aa  506  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.186001 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2072  Alpha-L-fucosidase  45.26 
 
 
486 aa  411  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1541  Alpha-L-fucosidase  40.92 
 
 
516 aa  360  3e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  39.81 
 
 
464 aa  345  8.999999999999999e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  35.67 
 
 
532 aa  306  5.0000000000000004e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  35.79 
 
 
584 aa  306  9.000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  37.57 
 
 
466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  37.13 
 
 
484 aa  305  2.0000000000000002e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  35.61 
 
 
606 aa  304  3.0000000000000004e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  34.63 
 
 
505 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  34 
 
 
537 aa  297  3e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  33.97 
 
 
515 aa  286  5.999999999999999e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  31.23 
 
 
534 aa  270  5e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  32.1 
 
 
495 aa  242  1e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  29.21 
 
 
798 aa  198  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  29.1 
 
 
663 aa  194  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  30.04 
 
 
483 aa  194  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  28.9 
 
 
731 aa  174  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  26.41 
 
 
446 aa  148  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  26.14 
 
 
446 aa  147  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  26.96 
 
 
627 aa  130  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  25.74 
 
 
471 aa  117  5e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  24.23 
 
 
478 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  23.26 
 
 
492 aa  106  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  23.17 
 
 
473 aa  103  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  24.84 
 
 
473 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  34.68 
 
 
463 aa  99.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  36.08 
 
 
490 aa  98.2  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  25.35 
 
 
473 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  22.56 
 
 
479 aa  94.4  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  22.97 
 
 
452 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  23.25 
 
 
429 aa  84.7  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  24.82 
 
 
464 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  31.06 
 
 
482 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  21.63 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48865  predicted protein  31.93 
 
 
500 aa  77.4  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  23.65 
 
 
429 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  32.35 
 
 
435 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  30.08 
 
 
644 aa  74.7  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  21.88 
 
 
494 aa  73.9  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  31.1 
 
 
474 aa  73.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  28.36 
 
 
435 aa  72  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  31.18 
 
 
479 aa  71.2  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  27.8 
 
 
485 aa  70.1  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  22.47 
 
 
711 aa  67.4  0.0000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  27.68 
 
 
445 aa  65.1  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  20.8 
 
 
471 aa  64.3  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  37.78 
 
 
538 aa  63.9  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  29.41 
 
 
478 aa  62.8  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  27.14 
 
 
596 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  28.47 
 
 
441 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  27.85 
 
 
408 aa  61.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  29.45 
 
 
581 aa  60.5  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  31.68 
 
 
440 aa  60.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  26.32 
 
 
447 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  22.12 
 
 
479 aa  58.2  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  29.23 
 
 
446 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  24.19 
 
 
340 aa  57  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  30.63 
 
 
415 aa  57  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  26.72 
 
 
674 aa  56.6  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  22.5 
 
 
212 aa  55.1  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  31.91 
 
 
450 aa  53.5  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  33.8 
 
 
474 aa  46.2  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.47 
 
 
487 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>