More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4205 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2572  resolvase domain protein  94.61 
 
 		 539 aa  996    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3523  resolvase domain protein  94.4 
 
 		 568 aa  992    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4205  resolvase domain protein  100 
 
 		 525 aa  1090    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2975  resolvase domain-containing protein  38.42 
 
 		 516 aa  368  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.539501  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  35.91 
 
 		 513 aa  292  8e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3000  resolvase domain protein  24.59 
 
 		 549 aa  133  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  24.84 
 
 		 542 aa  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  24.84 
 
 		 542 aa  131  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  24.89 
 
 		 542 aa  130  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  24.68 
 
 		 613 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  25.35 
 
 		 522 aa  123  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  26.04 
 
 		 515 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.919369999999999e-21 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2949  site-specific recombinase  24.83 
 
 		 479 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000000764647  unclonable  0.00000628307 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3976  resolvase domain-containing protein  28.61 
 
 		 415 aa  114  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  23.6 
 
 		 665 aa  109  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  22.39 
 
 		 558 aa  107  6e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  25.52 
 
 		 509 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  23.97 
 
 		 546 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  26.7 
 
 		 521 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  26.42 
 
 		 506 aa  105  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000998497  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3963  recombinase  25.06 
 
 		 493 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0231  resolvase domain-containing protein  26.92 
 
 		 519 aa  102  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.829739  normal  0.106092 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  27.35 
 
 		 546 aa  100  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  0.00000000017806 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  23.46 
 
 		 517 aa  99.8  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3805  resolvase-like protein  23.45 
 
 		 526 aa  99.4  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.296715  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  26.41 
 
 		 441 aa  98.2  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  24.63 
 
 		 447 aa  97.8  5e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1297  resolvase domain-containing protein  24.93 
 
 		 555 aa  97.4  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.023509  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1292  ssrA integrase  24.93 
 
 		 550 aa  97.4  6e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00290655  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0910  recombinase  29.28 
 
 		 743 aa  97.1  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  26.71 
 
 		 441 aa  96.7  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1282  ssrA integrase  25.56 
 
 		 558 aa  95.9  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000313732  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2057  Resolvase domain protein  25.1 
 
 		 582 aa  95.9  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0536001  normal  0.0182288 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  26.19 
 
 		 542 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  26.19 
 
 		 554 aa  94.4  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  28.08 
 
 		 548 aa  94  5e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  24.63 
 
 		 462 aa  93.2  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0737  resolvase  21.98 
 
 		 542 aa  91.7  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0547783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  27.24 
 
 		 528 aa  91.7  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  28.39 
 
 		 544 aa  91.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  27.42 
 
 		 528 aa  91.3  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  25.81 
 
 		 343 aa  90.9  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6320  resolvase domain protein  24.64 
 
 		 553 aa  90.5  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0568  recombinase  27.73 
 
 		 547 aa  90.1  8e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.816013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  26.74 
 
 		 484 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000173859 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  23.88 
 
 		 445 aa  89.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4193  Resolvase domain  27.65 
 
 		 555 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0430  putative resolvase  28.57 
 
 		 540 aa  88.6  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0212047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1942  Resolvase domain protein  24.94 
 
 		 561 aa  88.6  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1486  resolvase domain-containing protein  25.54 
 
 		 485 aa  88.6  3e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  25.83 
 
 		 443 aa  87.8  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1037  resolvase domain-containing protein  25.07 
 
 		 504 aa  87.8  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00127199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  26.39 
 
 		 484 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0486  Resolvase domain protein  31.9 
 
 		 515 aa  86.3  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.325495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  25.16 
 
 		 444 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0397  resolvase domain-containing protein  26.7 
 
 		 494 aa  86.7  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  22.99 
 
 		 445 aa  86.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0320  resolvase domain-containing protein  24.15 
 
 		 531 aa  85.9  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.140685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  22.97 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0795  Recombinase  25.25 
 
 		 496 aa  85.1  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 510 aa  83.6  0.000000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  23.91 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  24.48 
 
 		 459 aa  83.2  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  23.96 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  26.14 
 
 		 475 aa  80.9  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  22.98 
 
 		 449 aa  80.5  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  22.98 
 
 		 449 aa  80.5  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5133  Resolvase domain  21.17 
 
 		 539 aa  80.1  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.880179 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  25.44 
 
 		 525 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7321  putative resolvase  28.32 
 
 		 518 aa  79.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0594  Resolvase domain protein  24.93 
 
 		 525 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  25.45 
 
 		 522 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000418639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  24.49 
 
 		 552 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000141398  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  23.43 
 
 		 525 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  27.86 
 
 		 281 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1250  resolvase  22.97 
 
 		 524 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0102  resolvase domain-containing protein  25 
 
 		 537 aa  78.6  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218605 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0001  recombinase  26.5 
 
 		 539 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  24.62 
 
 		 522 aa  78.2  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000177151  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3138  resolvase  25.43 
 
 		 561 aa  77.8  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.741085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  26.82 
 
 		 474 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2498  cassette chromosome recombinase A  22.65 
 
 		 449 aa  76.6  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1272  resolvase domain-containing protein  24.02 
 
 		 519 aa  76.6  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000672315  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2851  resolvase domain-containing protein  28.4 
 
 		 565 aa  76.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.437901 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  26.74 
 
 		 527 aa  75.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0277  resolvase domain-containing protein  27.06 
 
 		 551 aa  74.7  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.738521  normal  0.0325045 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  24.19 
 
 		 462 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1368  recombinase  23.13 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.118986  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  24.63 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  24.25 
 
 		 521 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  28.24 
 
 		 295 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3384  resolvase domain-containing protein  27.03 
 
 		 590 aa  72.4  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  23.21 
 
 		 511 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  23.99 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  22.61 
 
 		 445 aa  71.2  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1430  Resolvase domain protein  25.75 
 
 		 607 aa  70.9  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1524  Resolvase domain protein  22.01 
 
 		 543 aa  70.5  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000240403  hitchhiker  0.00200455 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  22.19 
 
 		 482 aa  70.5  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  23.29 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  21.9 
 
 		 606 aa  69.7  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>