75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4197 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  100 
 
 
1063 aa  2149    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0798  proprotein convertase, P  45.24 
 
 
886 aa  480  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0966  hypothetical protein  39.63 
 
 
709 aa  417  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000682742  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1811  hypothetical protein  41.34 
 
 
661 aa  392  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.032061  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05520  hypothetical protein  35.9 
 
 
742 aa  381  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1970  hypothetical protein  37.19 
 
 
734 aa  379  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13263  hypothetical protein  32.31 
 
 
1093 aa  374  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.970861  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0728  hypothetical protein  36.33 
 
 
667 aa  359  1.9999999999999998e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0879674  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  34.6 
 
 
852 aa  321  3.9999999999999996e-86  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1034  PPE repeat-containing protein  36.46 
 
 
886 aa  314  5.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313591  normal  0.411811 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0505  PPE repeat-containing protein  33.6 
 
 
891 aa  295  4e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4153  hypothetical protein  29.71 
 
 
863 aa  142  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0157419  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0359  peptidase M12B ADAM/reprolysin  26.98 
 
 
1008 aa  89.4  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.199443  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4303  peptidase-like  26.37 
 
 
1289 aa  71.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0594037  normal  0.0791445 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1835  peptidyl-Asp metallopeptidase. metallo peptidase. MEROPS family M72  26.13 
 
 
2062 aa  71.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4572  peptidase M23B  31.65 
 
 
995 aa  67.4  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.109216  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1636  peptidase  30.13 
 
 
800 aa  67  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  28.14 
 
 
3333 aa  65.1  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_002950  PG1427  thiol protease/hemagglutinin PrtT precursor, putative  27.37 
 
 
843 aa  60.1  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.491886 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09473  fat protein-possibly involved in cell-cell attachment  28.67 
 
 
1441 aa  59.3  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1891  peptidase-like  27.36 
 
 
1156 aa  56.6  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0870492  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1456  hypothetical protein  29.48 
 
 
1024 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00611896  normal  0.0757666 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  27.35 
 
 
2632 aa  56.2  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1105  hypothetical protein  31.36 
 
 
425 aa  56.2  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.355107  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02230  metalloprotease, putative  37.93 
 
 
927 aa  55.5  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.493351  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.23 
 
 
1143 aa  55.5  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  26.87 
 
 
1594 aa  55.5  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2248  hypothetical protein  32.91 
 
 
549 aa  54.3  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  31.73 
 
 
1302 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3805  glycoside hydrolase family 18  34.72 
 
 
801 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.165252 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05870  hypothetical protein  27.27 
 
 
243 aa  53.1  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0804  hypothetical protein  36.49 
 
 
946 aa  52.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.771937  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0358  peptidase M12B ADAM/reprolysin  21.42 
 
 
783 aa  52  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.556061  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3105  hypothetical protein  36.36 
 
 
787 aa  52  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.667845  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2870  hypothetical protein  30.85 
 
 
1243 aa  51.6  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.772535  hitchhiker  0.00123304 
 
 
-
 
NC_002950  PG0411  hemagglutinin, putative  32.89 
 
 
925 aa  50.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  23.68 
 
 
480 aa  50.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  32.94 
 
 
887 aa  50.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  28.48 
 
 
649 aa  49.3  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  33.33 
 
 
752 aa  49.3  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6593  fibronectin type III domain-containing protein  25.62 
 
 
428 aa  49.3  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  26.47 
 
 
614 aa  48.5  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3498  hypothetical protein  32.32 
 
 
1440 aa  48.5  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309515  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  34.07 
 
 
571 aa  48.5  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  34.67 
 
 
1174 aa  48.1  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3448  hypothetical protein  23.19 
 
 
1839 aa  48.1  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0227257  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  29.49 
 
 
1418 aa  48.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  32.5 
 
 
1303 aa  47.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  27.01 
 
 
409 aa  47.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5679  PKD domain containing protein  29.79 
 
 
511 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.132353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4113  hypothetical protein  30.56 
 
 
3562 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0537133 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03270  hypothetical protein  30.59 
 
 
1070 aa  47  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.88849  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.92 
 
 
695 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3082  peptidase domain protein  25.52 
 
 
539 aa  47.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  24.44 
 
 
2690 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  31.94 
 
 
861 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03265  hypothetical protein  31.58 
 
 
528 aa  46.2  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0507671  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4545  hypothetical protein  36.71 
 
 
772 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.402962  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2188  peptidase domain protein  39.74 
 
 
692 aa  46.6  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000255141  hitchhiker  0.000237212 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  27.91 
 
 
1386 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1969  hypothetical protein  35.37 
 
 
300 aa  45.8  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.643947 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0357  hypothetical protein  22.86 
 
 
998 aa  46.2  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.525924  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3777  hypothetical protein  28.41 
 
 
1163 aa  45.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  33.93 
 
 
821 aa  45.4  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  28.65 
 
 
2286 aa  45.8  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  35.8 
 
 
749 aa  45.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  22.97 
 
 
1067 aa  45.4  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  26.88 
 
 
874 aa  45.8  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0772  hypothetical protein  28.99 
 
 
1023 aa  45.4  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  29.83 
 
 
1887 aa  45.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  36.56 
 
 
1187 aa  45.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2321  Fibronectin type III domain protein  31.82 
 
 
701 aa  45.1  0.008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3103  hypothetical protein  31.25 
 
 
588 aa  45.1  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655604  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3106  hypothetical protein  31.25 
 
 
595 aa  45.1  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  35.8 
 
 
692 aa  44.7  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>