226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4134 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  100 
 
 		 121 aa  245  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  50.47 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  39.42 
 
 		 126 aa  87.4  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  41 
 
 		 114 aa  84  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 276 aa  80.5  0.000000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  34.34 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  34.91 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 128 aa  76.6  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  37.86 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  38.74 
 
 		 268 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 269 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  36.63 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  38.37 
 
 		 270 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  39.25 
 
 		 269 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  36.67 
 
 		 270 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  38.16 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  41.05 
 
 		 257 aa  72  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  41.18 
 
 		 269 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  40.59 
 
 		 270 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  40.59 
 
 		 270 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  42.06 
 
 		 270 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  38.89 
 
 		 263 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 108 aa  70.5  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  37.21 
 
 		 270 aa  70.5  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  37.74 
 
 		 265 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  41.75 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 135 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0723  helix-turn-helix domain protein  45.31 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.523038  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0871  putative transcriptional regulator, ModE family  45.31 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.741628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  36.9 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  39.47 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  40 
 
 		 270 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  39.47 
 
 		 114 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  40.59 
 
 		 278 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 278 aa  67  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0207  ModE family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  43.75 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  36.04 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  43.75 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  42.57 
 
 		 282 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 269 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0974  molybdenum-binding transcriptional repressor  39.13 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  29.63 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 278 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  41 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  32.38 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 262 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 279 aa  62  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 268 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  36.84 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  35.29 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  32.26 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3199  ModE family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.213891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1450  molybdenum-binding protein  30.63 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  31.63 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  40.51 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  38.16 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  35.14 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  37.96 
 
 		 282 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  37.96 
 
 		 282 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  37.96 
 
 		 282 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  37.96 
 
 		 282 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  37.96 
 
 		 282 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  37.96 
 
 		 282 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  31.3 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0011  ModE family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  29.79 
 
 		 247 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  36.89 
 
 		 281 aa  57  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 263 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  38.1 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0983  putative transcriptional regulator, ModE family  43.28 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>