More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4103 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4103  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
442 aa  897    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110623 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4426  hypothetical protein  37.41 
 
 
440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2234  hypothetical protein  38.64 
 
 
443 aa  315  7e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.840085  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2723  protein of unknown function DUF21  39.35 
 
 
443 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0295  hypothetical protein  38.97 
 
 
443 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73268  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2388  protein of unknown function DUF21  39.4 
 
 
442 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.945135 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  41.96 
 
 
438 aa  311  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  37.88 
 
 
417 aa  311  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  38.85 
 
 
430 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7616  protein of unknown function DUF21  40.14 
 
 
418 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3911  protein of unknown function DUF21  39.9 
 
 
418 aa  301  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  37.64 
 
 
434 aa  297  3e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  38.8 
 
 
429 aa  296  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  37.05 
 
 
448 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4162  protein of unknown function DUF21  36.47 
 
 
440 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  37.97 
 
 
439 aa  290  3e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  38.68 
 
 
437 aa  290  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  38.9 
 
 
442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2174  protein of unknown function DUF21  36 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  36.43 
 
 
446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  36.85 
 
 
446 aa  281  1e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1382  protein of unknown function DUF21  41.8 
 
 
446 aa  280  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2493  protein of unknown function DUF21  35.75 
 
 
404 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  35.91 
 
 
435 aa  277  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2477  protein of unknown function DUF21  34.43 
 
 
439 aa  276  6e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0798586 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  36.87 
 
 
440 aa  275  8e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  36.07 
 
 
435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  38.75 
 
 
431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  35.84 
 
 
435 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  35.84 
 
 
435 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  35.84 
 
 
435 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  35.84 
 
 
435 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1580  hypothetical protein  35.54 
 
 
445 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0951178  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  35.8 
 
 
437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  35.62 
 
 
435 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  35.62 
 
 
435 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4594  hypothetical protein  35.53 
 
 
442 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  38.57 
 
 
444 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  34.93 
 
 
446 aa  270  4e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  36.36 
 
 
451 aa  270  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  36.41 
 
 
440 aa  267  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  35.66 
 
 
443 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  35.43 
 
 
443 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  33.03 
 
 
440 aa  265  8.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  35.68 
 
 
435 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  35.43 
 
 
443 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  34.97 
 
 
443 aa  265  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  35.16 
 
 
451 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  35.16 
 
 
451 aa  265  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  35.16 
 
 
451 aa  264  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.58 
 
 
442 aa  264  2e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  35.16 
 
 
451 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1889  protein of unknown function DUF21  37.67 
 
 
464 aa  264  3e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483019  normal  0.437772 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  35.45 
 
 
435 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  36.32 
 
 
442 aa  262  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  36.32 
 
 
442 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  36.32 
 
 
442 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  37.56 
 
 
443 aa  261  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  36.32 
 
 
435 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  36.08 
 
 
442 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  36.08 
 
 
442 aa  260  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  36.08 
 
 
442 aa  260  3e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  36.72 
 
 
432 aa  260  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  35.85 
 
 
442 aa  260  4e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  34.11 
 
 
432 aa  258  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  36.49 
 
 
432 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  35.85 
 
 
442 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  36.03 
 
 
432 aa  256  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  36.03 
 
 
432 aa  256  7e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  36.03 
 
 
432 aa  255  8e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  34.61 
 
 
428 aa  256  8e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  36.26 
 
 
432 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  36.57 
 
 
432 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  35.27 
 
 
437 aa  254  3e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2217  CBS domain-containing protein  35.73 
 
 
365 aa  253  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.332679 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  36.85 
 
 
425 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  34.98 
 
 
441 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  34.27 
 
 
428 aa  251  1e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  36.6 
 
 
433 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  33.01 
 
 
442 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  32.63 
 
 
443 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  32.63 
 
 
443 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0022  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.49 
 
 
442 aa  250  5e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  33.26 
 
 
444 aa  249  9e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  35.63 
 
 
437 aa  249  9e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  32.74 
 
 
436 aa  248  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0492  hypothetical protein  32.95 
 
 
450 aa  247  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  32.86 
 
 
447 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0397  Mg2+ and Co2+ transporter CorB family  33.63 
 
 
449 aa  246  6.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.595563 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1590  hemolysins and related proteins  35.51 
 
 
436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.727705 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0214  transporter, putative  34.5 
 
 
428 aa  243  3.9999999999999997e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0151  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.14 
 
 
433 aa  243  3.9999999999999997e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0191  putative transporter  34.27 
 
 
428 aa  242  9e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0503  protein of unknown function DUF21  30.61 
 
 
453 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  32.56 
 
 
436 aa  241  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0455  conserved hypothetical protein, putative efflux protein (DUF21 domain protein)  35.29 
 
 
456 aa  241  2e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.844865  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  33.26 
 
 
435 aa  239  6.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  31.96 
 
 
439 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0742  hypothetical protein  32.78 
 
 
449 aa  235  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0575  CBS domain-containing protein  38.03 
 
 
361 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>