26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4063 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4063  protein of unknown function DUF763  100 
 
 		 400 aa  826    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000157406  normal  0.0638485 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2835  hypothetical protein  71.93 
 
 		 408 aa  614  1e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.011435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3205  hypothetical protein  63.75 
 
 		 406 aa  550  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5130  protein of unknown function DUF763  50.98 
 
 		 414 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.738653  normal  0.0751589 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5426  protein of unknown function DUF763  51.23 
 
 		 414 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.167115  hitchhiker  0.0091498 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2730  hypothetical protein  50.59 
 
 		 443 aa  424  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.252799  normal  0.0414028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3496  hypothetical protein  51.75 
 
 		 415 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1733  protein of unknown function DUF763  52.21 
 
 		 433 aa  421  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.610359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0646  hypothetical protein  52.41 
 
 		 413 aa  418  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2571  hypothetical protein  52.04 
 
 		 446 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.223682  normal  0.445631 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4400  hypothetical protein  48.41 
 
 		 425 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.901272  normal  0.333483 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0136  hypothetical protein  48.47 
 
 		 362 aa  353  2.9999999999999997e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000501513  normal  0.643444 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1990  protein of unknown function DUF763  43.26 
 
 		 387 aa  332  8e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000614194  normal  0.138146 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1047  protein of unknown function DUF763  46.44 
 
 		 364 aa  331  1e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.93099  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0772  protein of unknown function DUF763  44.38 
 
 		 358 aa  325  6e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.446587  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1144  hypothetical protein  44.32 
 
 		 371 aa  311  1e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1361  hypothetical protein  45.01 
 
 		 388 aa  307  3e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0713  protein of unknown function DUF763  40.22 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.045514  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1062  hypothetical protein  42.06 
 
 		 373 aa  265  1e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0261  protein of unknown function DUF763  37.63 
 
 		 379 aa  256  6e-67  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0022  hypothetical protein  41.64 
 
 		 370 aa  253  3e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.982389  normal  0.0622424 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0026  hypothetical protein  40.94 
 
 		 371 aa  250  3e-65  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1523  hypothetical protein  38.38 
 
 		 380 aa  249  5e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.427834  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1191  hypothetical protein  40.29 
 
 		 385 aa  248  2e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2156  hypothetical protein  40.99 
 
 		 369 aa  245  8e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0265  hypothetical protein  36.06 
 
 		 389 aa  235  8e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.499335  decreased coverage  0.0000000041207 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>