More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4031 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4031  ornithine aminotransferase  100 
 
 
410 aa  847    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0013504  normal  0.512867 
 
 
-
 
NC_002950  PG1271  acetylornithine aminotransferase, putative  64.04 
 
 
409 aa  573  1.0000000000000001e-162  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4657  ornithine aminotransferase  65.19 
 
 
417 aa  552  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1494  ornithine aminotransferase  63.46 
 
 
414 aa  551  1e-156  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0647  aminotransferase  64.5 
 
 
410 aa  541  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3421  ornithine aminotransferase  64.11 
 
 
420 aa  535  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000373729  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27726  ornithine aminotransferase  60.92 
 
 
448 aa  531  1e-150  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6558  ornithine aminotransferase  61.9 
 
 
417 aa  530  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08581  acetylornithine aminotransferase, putative  60.19 
 
 
425 aa  517  1.0000000000000001e-145  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.805978  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01810  Ornithine aminotransferase (EC 2.6.1.13)(Ornithine--oxo-acid aminotransferase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q92413]  56.55 
 
 
454 aa  493  9.999999999999999e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0361813  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04880  ornithine-oxo-acid transaminase, putative  57.91 
 
 
452 aa  492  9.999999999999999e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0178177  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77538  ornithine aminotransferase  56.37 
 
 
435 aa  481  1e-135  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3630  ornithine--oxo-acid transaminase  56.05 
 
 
399 aa  455  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3918  ornithine--oxo-acid transaminase  54.81 
 
 
399 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1822  aminotransferase  53.98 
 
 
402 aa  451  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0322  ornithine aminotransferase  55.73 
 
 
403 aa  441  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1044  ornithine--oxo-acid transaminase  52.74 
 
 
399 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0165  aminotransferase  53.38 
 
 
415 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0686  ornithine--oxo-acid transaminase  52.78 
 
 
398 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000099191  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3466  ornithine--oxo-acid transaminase  53.12 
 
 
415 aa  431  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0435653  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0029  ornithine aminotransferase  51.65 
 
 
402 aa  427  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.628841  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2115  acetylornithine aminotransferase  55.05 
 
 
411 aa  427  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0193211 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1150  aminotransferase  53.03 
 
 
398 aa  424  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.348536 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1071  ornithine--oxo-acid transaminase  51.51 
 
 
396 aa  418  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.953264  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1052  ornithine--oxo-acid transaminase  51.76 
 
 
396 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1154  ornithine--oxo-acid transaminase  51.51 
 
 
396 aa  418  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1204  ornithine--oxo-acid transaminase  51.76 
 
 
396 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.957107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1053  ornithine--oxo-acid transaminase  52.01 
 
 
396 aa  421  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4137  ornithine--oxo-acid transaminase  51.51 
 
 
396 aa  418  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1256  ornithine--oxo-acid transaminase  51.51 
 
 
396 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1050  ornithine--oxo-acid transaminase  51.51 
 
 
396 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1307  ornithine--oxo-acid transaminase  51.51 
 
 
396 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0673255  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1231  ornithine--oxo-acid transaminase  51.51 
 
 
396 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1168  ornithine aminotransferase  51.38 
 
 
407 aa  414  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0869  ornithine--oxo-acid transaminase  51.26 
 
 
396 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.523488  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0454  aminotransferase  53.09 
 
 
415 aa  413  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.102369  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1711  ornithine aminotransferase  52.39 
 
 
409 aa  409  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0957  ornithine--oxo-acid transaminase  50 
 
 
396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.593517  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0976  ornithine--oxo-acid transaminase  50 
 
 
396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7971  ornithine aminotransferase  49.25 
 
 
427 aa  405  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2330  ornithine--oxo-acid transaminase  48.74 
 
 
403 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23960  aminotransferase  47.59 
 
 
416 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0400213  normal  0.0558706 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0545  ornithine--oxo-acid transaminase  48.73 
 
 
396 aa  395  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1586  ornithine aminotransferase  47.97 
 
 
409 aa  395  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3540  ornithine aminotransferase  47.84 
 
 
404 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000260033  hitchhiker  0.00155006 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4523  aminotransferase  48.11 
 
 
413 aa  391  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1135  ornithine aminotransferase  48.32 
 
 
399 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3316  ornithine aminotransferase  48.73 
 
 
396 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271295  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4053  ornithine aminotransferase  49.36 
 
 
404 aa  385  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.541542  normal  0.130067 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2808  ornithine aminotransferase  49.22 
 
 
412 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.892113  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3677  ornithine aminotransferase  48.59 
 
 
404 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0609  ornithine aminotransferase  47.34 
 
 
424 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0918035  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2814  ornithine aminotransferase  50.13 
 
 
412 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.53224  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5071  ornithine aminotransferase  46.63 
 
 
401 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4863  aminotransferase  47.25 
 
 
406 aa  377  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0052  ornithine aminotransferase  47.72 
 
 
408 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.98585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1020  aminotransferase  47.44 
 
 
408 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.828452  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3111  ornithine aminotransferase  48.73 
 
 
405 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0992  aminotransferase  47.44 
 
 
408 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1010  aminotransferase  47.44 
 
 
408 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.661373  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1287  ornithine aminotransferase  46.29 
 
 
403 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0501  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1660  ornithine aminotransferase  45.34 
 
 
410 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.567958 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0159  acetylornithine aminotransferase protein  46.95 
 
 
408 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1644  ornithine aminotransferase  49.21 
 
 
680 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2516  ornithine aminotransferase  48.74 
 
 
422 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0049  ornithine aminotransferase  47.97 
 
 
408 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2247  aminotransferase  46.67 
 
 
418 aa  366  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0175  ornithine aminotransferase  45.36 
 
 
394 aa  362  4e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0170  ornithine aminotransferase  45.36 
 
 
394 aa  362  4e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30710  aminotransferase  49.74 
 
 
404 aa  358  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21320  aminotransferase  45.52 
 
 
408 aa  351  1e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.210219  hitchhiker  0.00417952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0779  ornithine aminotransferase  47.09 
 
 
407 aa  348  1e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0886  ornithine aminotransferase  45.48 
 
 
406 aa  347  2e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  35.06 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  38.78 
 
 
398 aa  276  5e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  38.11 
 
 
402 aa  273  5.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0637  acetylornithine aminotransferase  36.43 
 
 
418 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00130856  normal  0.274942 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.23 
 
 
395 aa  269  7e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  37.44 
 
 
398 aa  267  2e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  38.01 
 
 
398 aa  266  4e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  38 
 
 
399 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  36.99 
 
 
427 aa  265  8e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  36.95 
 
 
396 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2649  acetylornithine aminotransferase  35.44 
 
 
423 aa  265  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.46775  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  36.25 
 
 
397 aa  262  8.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  38.14 
 
 
400 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  39.29 
 
 
395 aa  261  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  36.75 
 
 
396 aa  260  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3003  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  36.99 
 
 
427 aa  260  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  34.91 
 
 
396 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1986  acetylornithine aminotransferase  34.76 
 
 
418 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2013  acetylornithine aminotransferase  34.76 
 
 
418 aa  259  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.152714 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  36.46 
 
 
398 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  36 
 
 
397 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0943  acetylornithine aminotransferase  35.62 
 
 
422 aa  257  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  39.07 
 
 
394 aa  256  4e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  36.55 
 
 
399 aa  256  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  37.4 
 
 
413 aa  256  4e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  35.88 
 
 
403 aa  256  6e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  34 
 
 
426 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>