165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4009 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2819  glutamate carboxypeptidase II  51.06 
 
 
757 aa  736    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.140178  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1367  Glutamate carboxypeptidase II  56.08 
 
 
751 aa  805    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0341097  normal  0.079347 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4009  Glutamate carboxypeptidase II  100 
 
 
743 aa  1521    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.677524  decreased coverage  0.0030346 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2092  Glutamate carboxypeptidase II  45.53 
 
 
727 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135334  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2466  glutamate carboxypeptidase II  39.86 
 
 
725 aa  495  9.999999999999999e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0461903  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2823  glutamate carboxypeptidase II  38.54 
 
 
712 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.261678  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18700  predicted aminopeptidase  40 
 
 
678 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.561115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0518  Glutamate carboxypeptidase II  35.42 
 
 
734 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.925044  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33956  membrane protein involved in vacuolar protein sorting  33.5 
 
 
800 aa  356  7.999999999999999e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04018  glutamate carboxypeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03740)  35.37 
 
 
772 aa  328  2.0000000000000001e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.791672 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04925  glutamate carboxypeptidase Tre2, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G10650)  32.03 
 
 
884 aa  322  1.9999999999999998e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0450501  normal  0.0918847 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02920  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  32.09 
 
 
911 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72031  glutamated carboxypeptidase  24.38 
 
 
847 aa  152  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.585457 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80203  vacuolar targeting protein  23.77 
 
 
896 aa  90.9  8e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.397004  normal  0.0921162 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1208  peptidase M28  28.28 
 
 
525 aa  79  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382894  decreased coverage  0.00811068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4736  peptidase M28  26.42 
 
 
497 aa  72.4  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.517188  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  26.88 
 
 
557 aa  72  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  28.44 
 
 
547 aa  72  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0844  peptidase M28  41.58 
 
 
539 aa  70.9  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  26.59 
 
 
557 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  26.88 
 
 
558 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  26.3 
 
 
557 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  26.88 
 
 
558 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  28.33 
 
 
545 aa  68.6  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  26.3 
 
 
522 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  25.23 
 
 
528 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  26.45 
 
 
559 aa  67  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  26.88 
 
 
558 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  26.88 
 
 
558 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  25.42 
 
 
541 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0319  peptidase M28  29.77 
 
 
416 aa  66.6  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  26.63 
 
 
598 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  25.08 
 
 
541 aa  65.1  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  25.85 
 
 
556 aa  64.3  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0749  Aminopeptidase Y  31.06 
 
 
512 aa  63.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2940  peptidase M28  40.7 
 
 
552 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.529928  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  25 
 
 
550 aa  63.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  25.72 
 
 
557 aa  63.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  27.74 
 
 
555 aa  62.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  24.75 
 
 
541 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1362  peptidase M28  34.58 
 
 
495 aa  62  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.162739  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  26.97 
 
 
552 aa  61.2  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2654  peptidase M28  26.19 
 
 
525 aa  60.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.423469 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2962  peptidase M28  41.11 
 
 
468 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00173052  normal  0.676879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  27.18 
 
 
551 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  36.28 
 
 
334 aa  60.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  26.95 
 
 
539 aa  59.7  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3197  peptidase M28  28.9 
 
 
473 aa  59.7  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815061  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  24.11 
 
 
575 aa  60.1  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  26.01 
 
 
569 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2848  peptidase M28  30.83 
 
 
526 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.549527  normal  0.194902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3044  peptidase M28  40 
 
 
468 aa  58.9  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101958  normal  0.29803 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  27.98 
 
 
553 aa  59.3  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  24.41 
 
 
506 aa  58.9  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2131  leucyl aminopeptidase  39.25 
 
 
523 aa  58.5  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.227059  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  23.75 
 
 
532 aa  58.5  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  33.6 
 
 
533 aa  58.5  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  23.4 
 
 
529 aa  58.5  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3142  peptidase M28  40 
 
 
468 aa  58.5  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000890237  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  24.57 
 
 
542 aa  58.5  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1054  peptidase M28  40 
 
 
469 aa  58.5  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  23.75 
 
 
540 aa  58.5  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  32.92 
 
 
563 aa  58.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  23.75 
 
 
540 aa  58.5  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  23.81 
 
 
537 aa  57.8  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0919  peptidase M28  38.54 
 
 
467 aa  57.8  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000320691  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  23.41 
 
 
540 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  23.94 
 
 
532 aa  57.4  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2895  peptidase M28  36.36 
 
 
481 aa  57.4  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0744794  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2403  aminopeptidase Y  31.3 
 
 
512 aa  57  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.204184  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6038  peptidase M28  34.21 
 
 
454 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4110  peptidase M28  25.45 
 
 
487 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1049  peptidase M28  33.85 
 
 
468 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  26.01 
 
 
548 aa  56.2  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0906  peptidase M28  32.12 
 
 
544 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  23.43 
 
 
529 aa  56.2  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3240  peptidase M28  38.89 
 
 
468 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0267852  normal  0.504623 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1189  peptidase M28  34.29 
 
 
477 aa  56.6  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.157157  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  26.36 
 
 
552 aa  56.2  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  27.04 
 
 
552 aa  55.5  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  25.07 
 
 
549 aa  55.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1116  peptidase M28  38.89 
 
 
468 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000079399  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0421  aminopeptidase  35.4 
 
 
501 aa  55.5  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.131984  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  27.25 
 
 
549 aa  55.1  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  25.56 
 
 
549 aa  54.7  0.000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07020  leucyl aminopeptidase  25.29 
 
 
483 aa  54.7  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.384558  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1286  peptidase M28  35.42 
 
 
466 aa  54.7  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000415736  normal  0.392366 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1150  peptidase M28  38.89 
 
 
468 aa  54.7  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000117786  normal  0.22119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2728  peptidase M28  34.38 
 
 
481 aa  54.7  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000349349  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1094  peptidase M28  33.88 
 
 
468 aa  54.7  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000099485  normal  0.0169877 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  25.21 
 
 
563 aa  54.3  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  29.35 
 
 
552 aa  53.9  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3548  aminopeptidase Y  32.2 
 
 
555 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0650469 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  27.69 
 
 
346 aa  53.9  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1190  peptidase M28  31.01 
 
 
458 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.786712 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  28.51 
 
 
420 aa  52.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3539  M28D family peptidase  38.89 
 
 
414 aa  52  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  22.32 
 
 
550 aa  52  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12058  peptidase, M28D family protein  25.9 
 
 
472 aa  52  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  24.74 
 
 
491 aa  51.6  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>