More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3989 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3989  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 420 aa  828    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.442233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2957  sodium:dicarboxylate symporter  65.85 
 
 		 406 aa  533  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0772221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1513  sodium:dicarboxylate symporter  61.35 
 
 		 407 aa  477  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0761035  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3956  sodium:dicarboxylate symporter  53.87 
 
 		 413 aa  449  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.712566  normal  0.290558 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3757  sodium:dicarboxylate symporter  45.91 
 
 		 405 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5384  putative proton/glutamate symporter family protein  45.41 
 
 		 405 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4897  proton/sodium-glutamate symport protein  45.41 
 
 		 405 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4910  proton/sodium-glutamate symport protein  45.41 
 
 		 405 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5327  proton/glutamate symporter family protein, putative  45.41 
 
 		 405 aa  352  8e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5337  putative proton/glutamate symporter family protein  45.66 
 
 		 405 aa  352  8e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5065  proton/glutamate symporter family protein  45.16 
 
 		 405 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5450  proton/glutamate symporter family protein  45.16 
 
 		 405 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5008  sodium:dicarboxylate symporter  45.16 
 
 		 405 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5622  putative proton/glutamate symporter family protein  45.41 
 
 		 405 aa  351  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000191019 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5306  putative proton/glutamate symporter family protein  45.16 
 
 		 405 aa  349  5e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000137948 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0546  sodium:dicarboxylate symporter  46.29 
 
 		 411 aa  342  7e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0263  sodium:dicarboxylate symporter  41.19 
 
 		 411 aa  322  9.000000000000001e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000117938  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0155  sodium:dicarboxylate symporter  42.86 
 
 		 412 aa  316  5e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0784  hypothetical protein  39.74 
 
 		 415 aa  301  1e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0755  hypothetical protein  39.61 
 
 		 415 aa  300  2e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0541  sodium:dicarboxylate symporter  35.56 
 
 		 403 aa  293  4e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.7451499999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0278  sodium:dicarboxylate symporter  35.18 
 
 		 395 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0289  sodium:dicarboxylate symporter  34.49 
 
 		 399 aa  242  7e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000142207 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3917  sodium:dicarboxylate symporter  32.68 
 
 		 420 aa  236  7e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3722  sodium:dicarboxylate symporter  34.41 
 
 		 400 aa  236  8e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0297  sodium:dicarboxylate symporter  34.16 
 
 		 415 aa  234  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.016184 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0297  sodium:dicarboxylate symporter  34.41 
 
 		 414 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.459588  hitchhiker  0.000103111 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3453  sodium:dicarboxylate symporter  33.51 
 
 		 407 aa  222  8e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0519486  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0757  sodium:dicarboxylate symporter  34.23 
 
 		 409 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0412672  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4646  sodium:dicarboxylate symporter  34.12 
 
 		 405 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0310  sodium:dicarboxylate symporter  34.6 
 
 		 398 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0301  sodium:dicarboxylate symporter  34.97 
 
 		 398 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0305  sodium:dicarboxylate symporter  34.6 
 
 		 398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0306  sodium:dicarboxylate symporter  34.7 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1002  sodium:dicarboxylate symporter  25.87 
 
 		 432 aa  127  3e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.541825 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  25.24 
 
 		 419 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  26.92 
 
 		 413 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  25.24 
 
 		 419 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  25.78 
 
 		 413 aa  123  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  26.57 
 
 		 416 aa  123  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  27.6 
 
 		 409 aa  123  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  25.24 
 
 		 419 aa  123  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  25.24 
 
 		 419 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  28.02 
 
 		 442 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  26.04 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  25.13 
 
 		 427 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  26.15 
 
 		 444 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  25.78 
 
 		 417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  25.78 
 
 		 417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  26.15 
 
 		 444 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  27.2 
 
 		 437 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  27.75 
 
 		 436 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  28.18 
 
 		 437 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  27.64 
 
 		 436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  25.98 
 
 		 444 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  25.98 
 
 		 444 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  25.85 
 
 		 439 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  26.96 
 
 		 436 aa  116  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  26.6 
 
 		 419 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0209  sodium:dicarboxylate symporter  26.91 
 
 		 419 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0330286  normal  0.314079 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  28.73 
 
 		 440 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  28.73 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  28.73 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  25.06 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0397  sodium:dicarboxylate symporter  27.75 
 
 		 409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000267322  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  26.45 
 
 		 409 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  26 
 
 		 426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  27.14 
 
 		 443 aa  113  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  26.95 
 
 		 447 aa  113  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  27.91 
 
 		 437 aa  113  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  27.45 
 
 		 437 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  26.42 
 
 		 424 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  28.54 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  24.54 
 
 		 441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  28.18 
 
 		 440 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_002620  TC0681  sodium:dicarboxylate symporter family protein  26.89 
 
 		 409 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.442764  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  27.91 
 
 		 433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1770  Sodium/dicarboxylate symporter  25.62 
 
 		 405 aa  110  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.352949  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  26.46 
 
 		 434 aa  110  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  25.31 
 
 		 416 aa  110  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  25.86 
 
 		 437 aa  110  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  25.47 
 
 		 432 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  25.88 
 
 		 416 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  26.95 
 
 		 440 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  26.95 
 
 		 435 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  26.95 
 
 		 440 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  27.09 
 
 		 441 aa  107  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1279  sodium:dicarboxylate symporter  25.29 
 
 		 441 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0428035  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  28.11 
 
 		 423 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  28.11 
 
 		 423 aa  106  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  27.86 
 
 		 423 aa  107  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  28.11 
 
 		 423 aa  106  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  28.11 
 
 		 423 aa  106  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  25.26 
 
 		 411 aa  106  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  23.82 
 
 		 417 aa  106  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  27.86 
 
 		 423 aa  106  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  27.62 
 
 		 438 aa  106  9e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  25.13 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  27.86 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  27.86 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>